Solicitud de una futura bioinformática desde Nigaragua
Últimamente no le estoy dedicando el tiempo que tendría que dedicarle al weblog con la adaptación y puesta en marcha del entorno de trabajo en el CNIO. “Fruto” de ello ha sido que se me traspapelase el siguiente mensaje que envió Conny desde Nicaragua, solicitando orientación:
Estimados compañeros, soy estudiante de maestríaen Ciencias de Computación y estoy estudiandomucho la bioinformática porque quiero hacer mitesis basada en ésta. Solicito su ayuda a ver sime pueden enviar información acerca deherramientas de minería de datos que se aplicanen bioinformática y los algoritmos más usados yasea en genomica, proteómica, análisis de datos deespecies etc, es decir las áreas más claves dondese aplica la bioinformática actualmente. Apropósito, soy nicaragüense y tengo 23 años,estudio en Costa Rica. Mi sueño es etudiar midoctorado en bioinformática en España ya que esuno de los países numero uno en este emergentecampo. Espero sus respuestas.
Aquí está mi propio granito de arena, Conny, con enlaces a los principales algoritmos. Lo más importante: la herramienta básica para buscar artículos es PubMed, la base de datos de abstracts de artículos científicos. El enlace a PubMed es:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi
He estado buscando los artículos de los algoritmos Smith&Waterman, Blast, PSI-Blast y otros, y aquí están los enlaces. El primero de los artículos sólo está disponible bajo suscripción, con lo que de momento tendrás que contentarte con el abstract. En cuanto al resto, espero que no tengas problemas con los enlaces.
(Enlace al abstract de Smith & Waterman)
http://www.springerlink.com/(fmavvh45ujq1fsvukkpkep45)/app/home/contribution.asp?referrer=parent&backto=issue,7,10;journal,126,192;linkingpublicationresults,1:400107,1
(Enlaces al artículo de Blast y PSI-Blast, en HTML y en PDF)
http://nar.oxfordjournals.org/cgi/content/full/25/17/3389
http://nar.oxfordjournals.org/cgi/reprint/25/17/3389.pdf
(Enlace al artículo de ClustalW, en PDF)
http://www.pubmedcentral.nih.gov/picrender.fcgi?tool=EBI&pubmedid=7984417&action=stream&blobtype=pdf
(Enlace al artículo de HMMer)
http://selab.wustl.edu/publications/Eddy98/Eddy98-reprint.pdf
(Enlace al artículo de T-Coffee)
http://igs-server.cnrs-mrs.fr/~cnotred/Publications/Pdf/tcoffee.pdf
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Comentarios
HOla, yo estoy terminando mi licenciatura en ciencias de la computacion pero siempre me ha gustado la biologia, es por eso que quiero hacer mi tesis en bioinformatica, me podrian dar una pista de por donde empezar, he leido bastante pero todo lo q yo todavia no se, esta bastante desarrollado, asi q estoy en un mar de opciones.
hola buen dia. soy estudiante de ing en sistemas compuacionales en estos momentos estoy realizando mi tesis y es acerca de la mineria de datos en la bioinformatica si tienen algunos temas< relacionados o tutotiales se los agradeseria muchismimo. gracias Dios les bendiga.
hola buen dia. soy estudiante de ing en sistemas compuacionales en estos momentos estoy realizando mi tesis y es acerca de la mineria de datos en la bioinformatica si tienen algunos temas< relacionados o tutotiales se los agradeseria muchismimo. gracias Dios les bendiga.
Mi tesis es de Bioinformatica y la de asesor tambien (el de Dr, y tiene una maestria en eso)
Lo que se te ofresca
Hola soy estudiante de biotecnologia y mi tesina de grado sera en un trabajo de bioinformatico, sencillo pero trabajoso para alguien que ha dedicado su carrera a la biologia molecular y no a la programacion,
estoy muy interesada en hacer una pasantia o mejor aun un doctorado en europa. quisiera pedir si alguien tiene informacion al respecto. mi solicitud seria para el año que viene.
gracias
BioSapiens
Instituto Nacional de Bioinformática
Hola Conny un saludo me gusta mucho tu propuesta, soy estudiante de la carrera de Ciencias Biologicas y de igual manera estoy interesado en la Bioinformatica quiero realizar mi tesis en la misma (aun me faltan 3 años casi) pero mas alineada a la Ciencia (Biologia) pero de todos modos estoy buscando informacion (desesperadamente) y me esta llegando
pero podriamos colaborar estoy para eso….