Archivo de enero 15th, 2008

Fold Space navigator

Acaba de llegarme información por el lado de Ana Rojas sobre un sitio web relacionado con la bioinformática estructural. Se trata del C.A.M.E. (Center of Applied Molecular Engineering), donde hay disponible un catálogo interesante de servicios bioinformáticos. Entre ellos, el que más le llamó la atención a Ana fue el Fold Space navigator, que es una aplicación basada en Flash que te permite estudiar el espacio conocido de plegamientos de proteínas, y las interrelaciones existentes estos plegamientos por sus coocurrencias en estructuras. La aplicación usa la información proveniente de las bases de datos estructurales COPS, SCOP y CATH. La aplicación permite ver, mediante un identificador de PDB, toda la información que posee relacionada con esa entrada mediante el visor integrado en forma de árbol. Además, permite lanzar el servicio TopMatch de superposición de estructuras, para comparar las diferencias entre las estructuras mediante Jmol, y que proporciona información detallada a varios niveles.

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