Archivo de febrero, 2008

BioHackathon 2008, en vivo y en directo

Ahora mismo acaba de comenzar BioHackathon 2008, en Tokyo, Japón, y ya está disponible a través de ustream.tv la retransmisión del evento:

(incluso puede que aparezca…). Si quereis chatear con otr@s “web”-videntes del congreso (en inglés, desde luego), aquí os integro el chat del mismo:


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Publicar en castellano y IV Certamen “Teresa Pinillos” de Ensayos de Divulgación Científica y Humanística

Ayer me llegó a través del interfaz de contacto un mensaje de David Sucunza, en nombre de Nexociencia, para que difunda la convocatoria del IV Certamen «Teresa Pinillos» de Ensayos de Divulgación Científica y Humanística. El principal objetivo de este certamen de ensayos es intentar fomentar el uso del castellano a nivel científico. Como muchos ya sabreis, casi todo el conociemiento científico que se genera hoy en día está escrito en inglés, y antiguamente era en francés o alemán, lo cuál hace que el resto de lenguas queden apartadas casi siempre del mundo de la ciencia.
El tema de publicar en inglés en lugar del idioma nativo es un círculovicioso, porque un@ publica en inglés para aparecer en las revistas demás repercusión, y cualquier publicación tiene más repercusión cuantomás leída es, lo cuál está relacionado con el número de lectorespotenciales. Una forma de reducir la marginación de cualquier lenguanativa frente al inglés a nivel científico es publicar los artículossimultáneamente en esa lengua y en inglés, para así ir asentando las bases de la divulgación y trabajos científicos en ese idioma. Sin embargo, eso esbastante costoso por el tema de comprobar realmente que lo que dice unaversión del artículo también lo dice otra, y no tod@s l@s autor@s están dispuestos a hacerlo (por el trabajo extra que conlleva).

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Software para Machine Learning

Una mini-entrada para tres paquetes software que os pueden servir a la hora de aplicar técnicas de machine learning a la hora de realizar minería de datos sobre vuestros conjuntos de datos:

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BioHackathon 2008

Como algunos sabreis, la semana que viene se va a celebrar en Valencia las VIII Jornadas de Bioinformática, a las cuáles iba a asistir (como he hecho cada año). Sin embargo, este año me han coincidido con BioHackathon 2008, que se celebra este año en Tokio, Japón, a las que voy a asistir en representación del INB. Indagando en la red, me he enterado que este congreso se celebró por primera vez en 2002, siendo en Arizona (EEUU) la primera sesión y en Ciudad del Cabo (Sudáfrica) la segunda, lo cuál fue muy innovador para la fecha en la que se celebró.

Básicamente, BioHackathon es una reunión de desarrolladores de software, protocolos, ontologías y servicios bioinformáticos, enfocando la temática del congreso en distintas áreas según las necesidades. Este año BioHackathon está enfocado en el ámbito de web services desde cuatro perspectivas distintas, con sus propios objetivos:
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20 Aniversario de EMBnet, con logo nuevo

Hace un mes me enteré de que estaba al caer el 20 aniversario de EMBnet, por un correo de J.R. Valverde a la lista de “bioinformatibéricos”. Con motivo del 20 aniversario de su nacimiento, la comunidad de EMBnet está organizando una conferencia en Puglia (Italia), del 18 al 20 Septiembre de 2008.Al mismo tiempo, ha convocado un concurso abierto para cambiar ellogotipo de la institución. Teneis hasta el 11 de Febrero para mandar vuestras propuestas de nuevo logotipo para EMBnet. En la página de EMBnet están disponibles tanto las bases como la página con las propuestas ya recibidas (pero sin acceso a los logos, para que no os copieis ;-) ). Aunque ya conocía de antes EMBnet, me quise documentar un poco, y el siguiente párrafo, más o menos tomado de su página sobre el concurso de logotipos debido a su próximo 20 aniversario, explica qué es:

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Tipos de bioinformáticos (WoBQ)

Por David González me he enterado de que en Bioinformatics Zen salió publicada hace unos días una entrada bastante amena sobre los tipos de bioinformáticos que se pueden encontrar en el mundo de la investigación. La entrada fue estructurada usando el estilo de las guías de creación de perfiles para los juegos sociales como Los Sims, y fue llamada World of Bioinformatics Quest: Character Generation (WoBQ). Leyéndola, uno puede encontrar qué roles parecen ser más comunes en este mundillo, que habilidades son más apreciadas, etc…
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