Archivo de mayo, 2008

Cuando dependes de un programa antiguo (II): Phrap

Phrap es uno de esos programas bioinformáticos muuuuy usado a la hora de ensamblar todos los contigs (¡que no hay que confundir con los EST contigs!) obtenidos de secuenciadores que usan técnicas similares a la de shotgun. Este programa es gratuito para uso académico (previa solicitud a los autores), y está disponible tanto en código [...]

Cuando dependes de un programa antiguo

Si trabajas en bioinformática, la mayor parte del tiempo estás dependiendo de programas que no has hecho para tu trabajo cotidiano. En ocasiones (más de lo habitual) es necesario usar programas que son antiguos o muy antiguos, y que no consigues que funcionen en los primeros intentos. Eso es lo que nos ha estado pasando [...]

Workshop en Barcelona “Getting the most from biomolecular simulations: a practical workshop”

Siguen llegando mensajes sobre reuniones, conferencias y cursos de verano, y como siempre hay que plantearse ahora la decisión de asistir a dos meses vista, por el tema de las fechas límite de inscripción. En este caso le llegó a mi compañero de trabajo David G. Pisano, y se trata de una variante de las [...]

Curso de verano “BIOINFORMATICS AND FUNCTIONAL GENOMICS: from genes to functions and networks”

Ya falta menos para el verano (a pesar de las lluvias de los últimos días), y eso se nota en parte porque empiezan a llegar los anuncios de los distintos cursos de verano que va a haber. Uno de ellos es “BIOINFORMATICS AND FUNCTIONAL GENOMICS: from genes to functions and networks”, que se celebrará en [...]

Material educativo online sobre bioinformática

Cada día que pasa YouTube y otros sitios de vídeos online proporcionan más y más material interesante relacionado con Biología Molecular, Bioinformática y la divulgación científica en general. Como muestra os incluyo este vídeo sobre cómo se llega a la síntesis de una proteína a partir del RNA, y que está a su vez relacionado [...]

Ha fallecido Ángel Ramírez Ortiz

Acaba de llegarme de mi jefe, Alfonso Valencia, un correo sobre el fallecimiento de Ángel Ramírez Ortiz, al cuál no tuve la oportunidad de tratar y conocer lo suficiente. A continuación os incluyo parte de las palabras de Alfonso: Hoy ha fallecido nuestro colega Ángel Ramírez Ortiz. Ángel era uno de los Bioinformáticos más destacados [...]

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