Archivo de marzo, 2009
Más aplicaciones bioinformáticas en GSoC 2009
¿Os gusta la bioinformática y programar? ¿Estais interesados en la filoinformática (bioinformática aplicada a problemas de filogenia)? Si es así, y os va el tema del Google Summer Of Code, podeis optar por hacer alguno de los proyectos propuestos por el US National Evolutionary Synthesis Center (NESCent) y aceptados en GSoC 2009 para filoinformática. Por [...]
“Los siete pecados capitales de la Bioinformática”
Así se titula la presentación de Carole Goble The Seven Deadly Sins of Bioinformatics, que está colgada en SlideShare, y donde se despacha a gusto, sin pelos en la lengua. The Seven Deadly Sins of Bioinformatics View more presentations from dullhunk. Es una presentación que os recomiendo que os leais, ¡aunque pueda levantar ampollas!
aGEM, nueva herramienta bioinformática para el estudio de la expresión génica en ratón
Mis colegas del INB Natalia y Joan me pidieron que le echara un vistazo a su nuevo sistema. aGEM (anatomical Gene Expression Mapping) es una plataforma concebida para integrar información fenotípica con la distribución espacial y temporal de conjuntos de genes expresados en ratón. Según sus autores, esta plataforma proporciona la información necesaria para responder [...]
Una consulta de una lectora
Hace unos minutos me ha llegado a través del interfaz de Contactos del blog el siguiente mensaje de Alicia: Saludos a todos! soy licenciada en biología y muyinteresada en la bioinformática. Quiero realizar el master y hasta quesalga estoy ampliando el inglés y familiarizándome con la programación.Sin embargo me gustaría que me pudierais aconsejar sobre [...]
E-Cell Simulation Environment 3D
Otra herramienta de visualización que me ha llamado la atención es E-Cell Simulation Environment 3D. Esta herramienta está hecha exclusivamente para Mac OS X, y permite visualizar en un entorno inmersivo la información asociada a las actividades de una célula, como las proteínas que intervienen en un determinado momento, por ejemplo. En el sitio original [...]
Una aplicación bioinformática en GSoC 2009
Tal vez alguna vez habreis escuchado hablar en alguna ocasión del Google Summer of Code (GSoC). Es una iniciativa que lleva a cabo Google desde 2005, y que consiste en que Google patrocina a varios estudiantes que apliquen mejoras en una serie de proyectos de código abierto, descritas en propuestas que han sido previamente aprobadas [...]
Genome Projector: interfaz para Biología Molecular con capacidad de zoom
Otra herramienta interesante que acabo de ver en las sesiones de BioHackathon2009 es Genome Projector, que forma parte del proyecto G-language. Esta herramienta permite visualizar los mapas genómicos (tanto en formato circular como en formato lineal, según se pueda aplicar), de rutas metabólicas y de ‘DNA walk‘ asociados a todos los genomas para los que [...]
BioSapiens
Instituto Nacional de Bioinformática