Archivo de 18 marzo, 2009

E-Cell Simulation Environment 3D

Otra herramienta de visualización que me ha llamado la atención es E-Cell Simulation Environment 3D. Esta herramienta está hecha exclusivamente para Mac OS X, y permite visualizar en un entorno inmersivo la información asociada a las actividades de una célula, como las proteínas que intervienen en un determinado momento, por ejemplo. En el sitio original [...]


Una aplicación bioinformática en GSoC 2009

Tal vez alguna vez habreis escuchado hablar en alguna ocasión del Google Summer of Code (GSoC). Es una iniciativa que lleva a cabo Google desde 2005, y que consiste en que Google patrocina a varios estudiantes que apliquen mejoras en una serie de proyectos de código abierto, descritas en propuestas que han sido previamente aprobadas [...]


Genome Projector: interfaz para Biología Molecular con capacidad de zoom

Otra herramienta interesante que acabo de ver en las sesiones de BioHackathon2009 es Genome Projector, que forma parte del proyecto G-language. Esta herramienta permite visualizar los mapas genómicos (tanto en formato circular como en formato lineal, según se pueda aplicar), de rutas metabólicas y de ‘DNA walk‘ asociados a todos los genomas para los que [...]


genoDive, un programa de visualización de estructuras genómicas

En las sesiones de BioHackathon acabo de encontrarme con un nuevo programa de visualización de estructuras genómicas y su información asociada. Se llama genoDive, y aunque básicamente trabaja como un cliente DAS, da una nueva dimensión al concepto de exploración gráfica de las anotaciones genómicas. You need to a flashplayer enabled browser to view this [...]