Archivo de 20 julio, 2009

HMMer 3.0 y la migración de Pfam

Una de las noticias que me confirmaron en persona en el pasado ISMB-ECCB 2009 fue que a finales de Agosto o principios de Septiembre la base de datos Pfam va a cambiar de formato para adaptarse a HMMer 3.0, la última versión principal de este software de búsqueda de motivos. Por lo que entendí tras [...]


Benchmarking, Linux distros y bioinformática

Hace unos pocos años era casi imposible encontrar herramientas bioinformáticas en los paquetes estándar de las distintas distribuciones Linux, pero a día de hoy es tan común que las podemos encontrar integradas incluso en sistemas de benchmarking como el Phoronix Test Suite. Hace un par de días aparecieron en Phoronix los resultados de comparar las [...]