Artículos interesantes
Los orígenes de la Bioinformática (IV): the rise of the machines
(Para los que sois nuevos en este blog, ésta es la cuarta entrega de una serie de entradas basadas en el material aportado por David, que es un artículo en Nature Reviews Genetics del año 2000 de Joel B. Hagen, titulado “The origins of bioinformatics”.) Tras las 3 entregas anteriores, donde hemos visto cómo se [...]
Los orígenes de la Bioinformática (III). Sabemos que llevan información, pero ¿cuál?
Una vez que quedó demostrado que las proteínas eran secuencias de aminoácidos donde importaba el orden de los mismos, y que se empezó a secuenciar cada vez más proteínas, el repositorio de información asociado a las proteínas secuenciadas empezó a crecer poco a poco, pero todavía no se habían establecido las correspondencias entre el código [...]
Aprendiendo a usar Ensembl por la red
Haciendo un pequeño paréntesis en mi serie de entradas sobre los orígenes de la bioinformática ha llegado el momento de hablar del material online disponible para aprender a sacarle el máximo partido a Ensembl. Almorzando hoy con mis compañeros de trabajo, Osvaldo mencionó que en la web de Ensembl había una serie de vídeos descriptivos [...]
Los orígenes de la Bioinformática (II) Las macromoléculas llevan información
El concepto de que las proteínas (que a fin de cuentas son macromoléculas) contienen información que está codificada en forma de secuencias lineales de aminoácidos lleva mucho tiempo totalmente aceptado por la comunidad científica, y es la piedra angular de toda la bioinformática clásica. Pero esto no fue siempre así, teniendo que remontarnos a los [...]
Los orígenes de la Bioinformática (I) La semilla
Desde hace unos meses tengo en la recamara de las publicaciones material relacionado con los origenes del EBI (gracias a Graham Cameron) y de la bioinformática en general (gracias a David G. Pisano). En este artículo empezaré a desgranar parte del material aportado por David, que es un artículo en Nature Reviews Genetics del año [...]
Récord de simulación de plegamiento de proteínas
Hace unos días salió publicado en Nature News la noticia ‘Supercomputer sets protein-folding record’, en la que se cuenta cómo se ha conseguido simular con el supercomputador Anton los cambios estructurales de una proteína durante un milisegundo, coincidiendo con las observaciones obtenidas de la proteína real. El tiempo necesario para calcular esa simulación fue de [...]
Ya hay datos piloto disponibles del proyecto de 1000 genomes
Desde hace tiempo se encuentra en marcha el ambicioso proyecto 1000 Genomes, cuyo objetivo es proporcionar un catálogo lo más extenso posible de la variabilidad genética humana. ¿En qué consiste el proyecto? Pues, ni más ni menos, en secuenciar usando técnicas de ultrasecuenciación los genomas de 1000 personas escogidas en todo el planeta que representen [...]
BioSapiens
Instituto Nacional de Bioinformática