General
neXtProt: proteínas humanas anotadas al máximo
Durante estos días estoy asistiendo al ISMB/ECCB 2011, en Viena, Austria, y los dos primeros días no son de congreso como tal, sino dedicados a tutoriales y reuniones de SIGs (Special Interest Groups). En el SIG de CAFA (Critical Assessment on Function Prediction) escuché ayer una charla muy interesante de Amos Bairoch sobre la relación [...]
Workshop “From Phenotypes to Pathways 2011″, en Septiembre
Del 15 al 17 de Septiembre se va a celebrar en Cambridge, Reino Unido, el workshop From Phenotypes to Pathways 2011. Esta reunión forma parte de las reuniones financiadas por el ESF (European Science Foundation), y que forma parte del ESF reseach networking programme (programa de redes de investigación) Frontiers of Functional Genomics. La reunión [...]
Concurso sobre el impacto de la biotecnología en la vida cotidiana
En este mundo virtual de blogs y podcasts, hace poco se pusieron en contacto conmigo desde RadioSíntesis, una radio dedicada a la ciencia y tecnología. Dicha radio emite por streaming en internet, y que provee los programas ya emitidos en su propio podcast. La razón es que han convocado un concurso llamado “La biotecnología en [...]
Y el formato PDB llega a su versión 4.0
Como todo en el mundo de la bioinformática, los formatos de fichero siguen evolucionando. En este caso se trata el formato PDB, que llega a su versión 4.0 . Y con esa nueva versión, toda la base de datos de PDB ha sufrido una revisión profunda para adaptarse al nuevo formato. Dicha revisión se hará [...]
Instalando RSPerl (e intentando no morir en el intento)
RSPerl es un paquete que intenta tender un puente bidireccional entre Perl y R, de forma que desde un programa escrito en Perl se pueda llamar funciones de R, y desde un programa en R se puedan usar código y módulos de Perl. Suena como un sueño, ¿no? Mi compañera de trabajo Kristina estuvo hace [...]
Faculty of 1000 Posters
Algo que siempre he echado en falta en muchos congresos y reuniones es la posibilidad de consultar a posteriori los posters que he visto allí. Es cierto que los resúmenes de los posters aparecen en los libros de actas (o proceedings) de los congresos, pero no incluye ni de lejos todo el material que se [...]
Servicio FTP de KEGG ¿de pago?
Hace un par de días nos han empezado a llegar a todos los que trabajamos en bioinformática correos conteniendo el siguiente párrafo: Starting on July 1, 2011 the KEGG FTP site for academic users will be transferred from GenomeNet at Kyoto University to NPO Bioinformatics Japan, and it will be available only to paid subscribers. [...]
BioSapiens
Instituto Nacional de Bioinformática