Posts etiquetados con ‘bacterias del suelo’

Fármacos del Suelo en Beneficio de la Humanidad (nuevas técnicas genómicas, e investigación participativa)

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Drugs From Dirt: a citizen science project

 Buena parte de los ciudadanos desconocen la gran variedad de fármacos descubiertos en el suelo, así como que estos han salvado cientos o miles de millones de vidas. Gran parte de estas drogas dieron lugar a antibióticos (como por ejemplo la tetraciclina y la vancomicina, etc.). La Medicina tiene una deuda importante a los microorganismos edáficos y especialmente con las bacterias y hongos. Estos pequeños bichitos también han proporcionado o inspirado medicamentos contra el cáncer y terapias inmunosupresoras utilizadas en los trasplantes de órganos. Y todo ello a pesar de que, como os menos narrado en post precedentes, apenas conocemos la diversidad que habita en el medio edáfico. Hasta no hace mucho tiempo, los microbios que habitan en los suelos debían aislarse tras crecer en placas Petri. Sin embargo el problema estriba en que hoy sabemos que la mayor parte de ellos no se desarrollaban en tales medios de cultivo, pasando inadvertidos a los científicos. Sin embargo las actuales técnicas de secuenciamiento genómico permiten ahora detectar genes o grupos de genes que los investigadores pueden identificar como fármacos potenciales, directamente sobre las muestras de tierra.  Obviamente, tales sofisticados procedimientos logran detectar enormes cantidades de moléculas, algo que hace una década parecía impensable.  La nota de prensa del artículo que analizamos hoy ofrece resultados más que interesantes, y no solo desde el punto de vista farmacológico.  Omitiré referirme a los procedimientos utilizados ya que se encuentran más allá de los escasos conocimientos que tengo en tales materias. Abajo podréis consultaros en la nota de prensa y el resumen del trabajo original, publicado en el PNAS.  Sin embargo el avance es desorbitante ya que, a día de hoy, la bioprospección de unas pocas muestras de suelo puede dar lugar a identificar una ingente cantidad de compuestos, algunos de los cuales servirán para la producción de nuevos fármacos.

No obstante el trabajo nos informa de muchos más temas. Por ejemplo, Los autores compararon la riqueza y diversidad de genes biosintéticos de 96 microbiomas de los suelos muestreados en una gran variedad de ambientes pertenecientes a todas las regiones del suroeste y noreste de los Estados Unidos. Más aun, como veremos, desean ampliar su colección demandando a los edafólogos interesados y al público en general el muestreo de perfiles de suelos de todos los Estados de la Unión (USA), como manifiestan en su página Web. Se trata pues también de animar al ciudadano a que lleve a cabo la denominada investigación participativa. Más aun los autores del trabajo sesearían llevar a cabo mapas de diversidad genómica alrededor de todo el mundo. Traduciendo literalmente su frase: “The Brady Lab quisiera extender este estudio y espera animar a los científicos y ciudadanos para contribuir a esta iniciativa. El laboratorio ha creado un sitio web: www.drugsfromdirt.org en el que los ciudadanos y edafólogos interesados, después de registrarse, recibirán información acerca de cómo tomar muestras y enviarlas a nuestros laboratorios. El proceso es simple, dice Brady: “Tome una bolsa de sándwich, una cuchara o una espátula, y vierta un par de cucharadas de la bolsa, enviándonoslas después.”. Barrunto que si los compuestos que resulten de interés serán después patentados, y hasta los participantes tendrán que pagar para consumirlos cuando los necesiten. Puro capitalismo neoliberal. Pero sigamos. 

Los autores compararon la riqueza y diversidad de genes biosintéticos de 96 microbiomas de los suelos muestreados en una gran variedad de ambientes de todas las regiones del suroeste y noroeste de los Estados Unidos.

Ellos encontraron una relación entre el tipo de suelo y el tipo de moléculas que sus microbios residentes tenían la capacidad de producir. Por razones que no entendemos, los suelos áridos resultaron albergar microbios capaces de producir una mayor diversidad de compuestos. Seguidamente tales investigadores comentan: “Esperamos poder ampliar a otras regiones del país y del mundo, para incorporar muchas más muestras con el fin de crear mapas de la diversidad biosintética de los microorganismos del suelo“.

La sentencia en la que se indica una relación entre los tipos de suelos y las sustancias metabólicas segregadas o que atesoraban los microrganismos me resulta intriganteHasta el momento, no existen evidencias científicas contundentes para poder afirmar que tipos de suelos distintos atesoran comunidades microbianas idiosincrásicas. Se han publicado artículos que decían corroborar tal correspondencia mientras que en otros se negaba. ¿Cabría pues la posibilidad de que llegaran a obtenerse evidencias más firmes al respecto por esta vía?. Sinceramente permanezco a la espectativa.

Finalmente los autores apuntan a que: “Esperamos poder ampliar nuestro estudio a otras regiones del país y del mundo, para incorporar muchas más muestras con el fin de elaborar mapas de la diversidad biosintética de los microorganismos del suelo”. Ya sabemos que las ciencias del suelo captan escasos fondos en comparación con otras muchas disciplinas científicas. Pero si comparamos las ingentes cantidades de dinero que se invierten en medicina, salud pública e investigación farmacéutica, con la calderilla con la que nos vemos obligados a investigar los edafólogos, las diferencias son abismales. Cuando inicié la andadura en esta bitácora ya os comente en diversos post que la bioprospección de suelos y regolitos debía ser una línea a explorar.  Y el estudio así lo sugiere. Si realmente estos investigadores obtienen resultados exitosos el estrecho y sinuoso camino por el que actualmente transcurre la biología, genética y bioquímica del suelo actual se convertiría en una enorme autopista. Esperemos que así sea.

Os dejo ya con la información comentada, aunque escrita en suajili……

Juan José Ibáñez

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Las Bacterias del Suelo Generan las Infecciones Multiresistentes y la Mayoría de las Infecciones Nosocomiales

No somos adivinos, sino que hablamos con colegas y empleamos el sentido común. Abajo os dejo un amplio repertorio de post en los que ya advertimos que el uso del suelo  como vertedero deviene en uno de los peores problemas de salud pública que aqueja a la humanidad. Como los lectores más asiduos recordarán, ciertas investigaciones y las conversaciones entre mi hermana, Consuelo Ibáñez, la administradora del blog  Salud Pública y Algo Más, nos llevaron a lanzar la conjetura de que los microrganismos del suelo, mediante su flujo horizontal de genes, debían ser los causantes de problemas sanitarios tan graves como el crecimiento exponencial de la resistencia a antibióticos, enfermedades nosocomiales o infecciones intrahospitalarias y bacterias multiresistentes. Todo ello ha sido confirmado recientemente por un equipo de investigadores en un articulo de la revista Science. Sorprende que la prensa general Española apenas publicitara este importante hallazgo al contrario que la Latinoamericana. ¿Por qué? Prefiero callarme. En la carrera armamentística entre los microrganismos patógenos y la especie humana tenemos todas las de perder. Empero como ya os comentamos, esos bichitos son por lo general nuestros amigos. Sin ellos los individuos pertenecientes a la mayor parte de las especies multicelulares no podríamos vivir.  Ahora bien, esta Smart Society se encuentra arruinando nuestro ambiente y nuestra salud, induciendo adicionalmente este enorme problema de salud pública que ha causado ya cientos de miles de fallecimientos y lo seguirá haciendo hasta que se cuenten por millones. La agroindustria y la agricultura/ganadería industrial (con el abuso de antibióticos) son en gran parte responsables del problema, que no de la solución como alegan los irredentos tocagenes defensores de los transgénicos (dejáramos hoy a la farmaindustria al margen, aunque también está implicada). Nuestra economía tecnológica puede estar causando más padecimientos que bienestar a una buena parte de los ciudadanos de esta mugrienta aldea global. Empero en esta ocasión, ni tan siquiera incluimos los devastadores efectos de la contaminación ambiental, o del reciclado de juguetitos electrónicos en los países del tercer mundo. De hacerlo el problema sería tan grave como para considerar a nuestras prácticas tecnosociales el principal enemigo de la especie humana. Se trata de un análisis al que ningún valiente, ya sea persona o institución, desea enfrentarse. Y no somos catastrofistas. Basta para comprobarlo, sumar las causas de morbilidad y mortalidad que publican anualmente organismos internacionales como la FAO; OMS, ONU, etc. ¡Cuestión de sumar, que no de ciencia!. Los datos y narraciones  que os hemos ofrecido ya dan cuenta que no atesoramos el don de la adivinación: basta con utilizar la cabeza “un poco”. La noticia muy clara y precisa que os ofrecemos hoy, no deja lugar a dudas. Resulta paradójico, por ejemplo, que esos microrganismos que dan el olor del suelo húmedo  se encuentren dentro de esta ecuación, cuando la basura humana, el estiércol y purines,  o los residuos sólidos urbanos son esparcidos en el suelo en aras de la producción industrial de alimentos. ¡llueve sobre mojado!. Hablamos del resistoma (nuevo vocablo para un viejo problema). ¿Que es?. Abajo damos cuenta de ello. Tan solo rogar que entendamos de una vez por todas que o cuidamos los suelos o enfermaremos por ello. Comenzaremos dando cuenta de los post que hemos escrito a cerca de este tema, para seguidamente exponeros la noticia, y el resumen de la investigación original. Nos venden por progreso  lo que nos está matando. Somos bobos, producto de la bobalización socio/política/económica. ¡No hay más!. Eso si, por mucho que damos en la diana no recibiremos premios por cuanto a los poderes fácticos no les gustan nuestras ¡adivinanzas!.

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Streptomyces. Microrganismos del suelo. Fuente: DiCYT

Juan José Ibáñez

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Bacterias del Suelo en la Lucha contra el Cáncer

Pues (..) ¡ puede ser una realidad!. Pero habrá que esperar hasta que se realicen los ensayos clínicos en humanos, con vistas a demostrar su eficacia. De hecho, (ya os hablamos de la rapamicina, de origen semejante, que también dicen que es útil en esta empresa). Las esporas de Clostridium sporogenes pueden ayudar “en principio” a “erradicar “todos los tipos de tumores sólidos”, tras ser manipuladas genéticamente, según parece desprenderse de la nota de prensa que hoy comentamos. Estas poseen una encima mejorada en los laboratorios que activa un agente cancerígeno que es incorporado al paciente por otra vía. Tal bacteria no deja de ser una cepa no patogénica de C. botulinum, microorganismo ancestral que se apareció en la tierra hace cientos de millones de años, es decir con anterioridad a la actual atmósfera rica oxígeno generada por la propia vida. Por tanto, se trata de un bichito que necesita de un  ambiente bastante anóxico, como el que se da en el centro de los tumores sólidos. Según los investigadores firmantes del estudio, tal terapia elimina las células cancerígenas, no afectando a las que constituyen el tejido del paciente. Eso sí, reiteremos que hasta que no se hagan los experimentos control con humanos se trata de una promesa entre otras muchas, que no una realidad incuestionable. La prensa científica en estos casos, esta repleta de aparentes procedimientos innovadores que, a la postre, no resultaron ser eficientes. Seguidamente abundamos en la noticia, planteándome de paso algunas dudas.

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Colonias de Clostridium sporogenes. Fuente: totallyfreeimages.com

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Guerras Entre Bacterias y Hombres. Los plásmidos y la Vida Reticulada del Suelo

Imaginaros que una extraña sustancia amenazara la vida sobre un planeta en el cual organismos de diferentes especies intercambiaran entre si material genético. Y así, al conseguir cualquiera de ellos una mutación que lo hiciera resistente ante tal peligro ofreciera su precioso tesoro a los demás. Estos últimos, que al incorporarlo a sus cuerpos y herencia, les permite sorterar tal pavorosa amenaza. ¡Suena bien verdad! Hasta podríamos plantearnos llevar tal historia a un filme de ciencia ficción.  ¡Que vida tan solidaria!, ¡Qué diferencia con esa perspectiva de la evolución terrorífica que nos ofrece la ciencia actual!: la supervivencia del más apto, el pez granda se come al chico, etc. Ahora bien, si a renglón seguido os muestro que tal proceso ocurre en el Planeta Tierra, ¿que pensaríais?. Y si además advierto que se trata de un mecanismo que amenaza a la humanidad,  ¿Cuál sería vuestra opinión? La narración es cierta, pero todo depende del cristal con que se mire. Para las bacterias y otros microorganismos del suelo, los seres humanos somos una amenaza. Las acribillamos con los agroquímicos. Nuestra artillería les lanza misiles cargados de venenos denominados antibióticos. ¿Cómo responden? Pues simplemente apelando al mecanismo anteriormente mentado. Venimos defendiendo que la vida en el suelo difiere de la que acaece sobre el mismo. El medio edáfico es un gigantesco reactor que recicla casi todo lo que cae sobre el, gracias a una enorme biodiversidad, pero también gracias a la extraordinaria genética de los microorganismos del suelo, que conforman una vida reticulada, es decir una singular genética de la biosfera, si la comparamos con la que se nos ofrece actualmente en los medios de comunicación, científica y no científica. De continuar tal conflagración el ser humano se expone a dos escenarios futuros: (i) una guerra interminable y (ii) que finalmente alcancen la victoria esos pequeños bichitos resistentes y “solidarios”, desde la perspectiva aquí adoptada. Si tenemos tanto que perder, ¿por qué no hacer las paces?. ¿No existen otros medios de convivir con ellas? ¡Busquémoslos!

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Plasmidos fuente Access Excelence

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Bacterias del suelo cementantes con la cara más dura que el hormigón armado

Lo lamento pero no puedo engañaros por más tiempo: soy un ingenuo irredimible. No hay ningún día en el que la prensa “científica” me sorprenda con una nueva estupidez. La que vamos a abordar hoy se me antoja descomunal, hilarante, aunque de llevarse a la práctica sumamente peligrosa, excepto a los ojos de los amantes del hormigón y del ladrillo. Sí, de esos que se han encargado de sumergirnos en una nueva crisis económica. La noticia nos informa de que avezados aprendices a “toca genes” han modificado una bacteria del suelo que a la postre resulta ser capaz de segregar carbonato cálcico y cola (pegamento), de tal modo que pueden sellar las grietas de las estructuras en el cemento. ¿Qué ocurriría si proliferaran en el medio ambiente, debido a que su gen de  destrucción fallara? Pues nada, ¡fabuloso! Se imaginan gran extensiones de suelos selladas “a cal y cola” (si al menos fuera “coca cola” (…)). El sueño de los constructores. Los chavales jugaban en una competición. Nada que objetar. Se llevaron la fama y la gloria. Nada que objetar. Desde luego, no se puede negar que imaginación tenían. Ahora bien, que los mayores consideren que esta travesura puede ayudar a solucionar problemas de gran calado y, como no, ayudar a reducir el calentamiento climático, tan solo constata que sus profesores son más peligrosos que un grupo de terroristas anti-ambientales. En un principio desvariaron sus científicos, luego les mostraron como hacerlo a los adolescentes y finalmente: ¡eran pocos y parió la abuela! (Historia del Fin de un Planeta, Capítulo 17888996949153004). Veamos de qué hablo.

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El asombrosos trabajo de la BaciFIilla. Fuente: Blog Interartix

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