{"id":102502,"date":"2008-10-03T10:56:00","date_gmt":"2008-10-03T09:56:00","guid":{"rendered":"http:\/\/weblogs.madrimasd.org\/\/biocienciatecnologia\/archive\/2008\/10\/03\/102502.aspx"},"modified":"2010-04-05T14:26:28","modified_gmt":"2010-04-05T13:26:28","slug":"ix-jornadas-de-bioinformatica-en-memoria-de-angel-ramirez-ortiz","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/biocienciatecnologia\/2008\/10\/03\/102502","title":{"rendered":"IX Jornadas de bioinform\u00e1tica en memoria de \u00c1ngel Ram\u00edrez Ortiz"},"content":{"rendered":"<p><P align=justify><SPAN style=\"FONT-SIZE: 12pt; FONT-FAMILY: 'Times New Roman'; mso-fareast-font-family: 'Times New Roman'; mso-fareast-language: AR-SA; mso-ansi-language: ES; mso-bidi-language: AR-SA\"><A href=\"http:\/\/www.manzanareselreal.org\/\"><FONT color=#000080>Manzanares el Real<\/FONT><\/A> se llena en mayo de flores de jara, que suben desde el embalse de Santillana hasta las paredes rocosas del circo de la Pedriza. En este bonito pueblo de la sierra de Madrid falleci\u00f3 el 5 de mayo de 2008 <A href=\"http:\/\/ub.cbm.uam.es\/members\/ortiz\/obituario.php\"><FONT color=#000080>\u00c1ngel Ram\u00edrez Ortiz<\/FONT><\/A>, uno de los m\u00e1s destacados bioinform\u00e1ticos estructurales de Espa\u00f1a y de Europa, a los 41 a\u00f1os&#8230;<\/SPAN><\/P>  <P align=center><SPAN style=\"FONT-SIZE: 12pt; FONT-FAMILY: 'Times New Roman'; mso-fareast-font-family: 'Times New Roman'; mso-fareast-language: AR-SA; mso-ansi-language: ES; mso-bidi-language: AR-SA\"><IMG src=\"\/blogs\/biocienciatecnologia\/wp-content\/blogs.dir\/53\/files\/199\/o_AngelRamirez.JPG\"><\/SPAN><\/P>  <P align=center><SPAN style=\"FONT-SIZE: 12pt; FONT-FAMILY: 'Times New Roman'; mso-fareast-font-family: 'Times New Roman'; mso-fareast-language: AR-SA; mso-ansi-language: ES; mso-bidi-language: AR-SA\"><\/SPAN>&nbsp;<\/P><!--more--><P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\" align=center>\u00c1ngel era un ciudadano del mundo. Nacido en Galicia, donde su familia se hab\u00eda trasladado por motivos laborales (su padre era m\u00e9dico), estudi\u00f3 Farmacia en la Universidad Complutense de Madrid y comparti\u00f3 su doctorado entre el grupo de <A href=\"http:\/\/www.madrimasd.org\/cienciaysociedad\/entrevistas\/quien-es-quien\/detalleGrupo.asp?id=107\"><FONT color=#000080>Federico Gago<\/FONT><\/A> en la Universidad de Alcal\u00e1 de Henares de Madrid, y el <A href=\"http:\/\/www.embl.de\/\"><FONT color=#000080>European Molecular Biology Laboratory<\/FONT><\/A> de Heidelberg, Alemania, donde trabaj\u00f3 con <A href=\"http:\/\/www.eml-research.de\/english\/homes\/wade\/\"><FONT color=#000080>Rebecca Wade<\/FONT><\/A> y <A href=\"http:\/\/pasteur.crg.es\/portal\/page\/portal\/Internet\/02_Research\/01_Programmes\/06_Systems_Biology\/01_Design_of_Biological_Systems\"><FONT color=#000080>Luis Serrano<\/FONT><\/A> entre otros. Se traslad\u00f3 despu\u00e9s a Estados Unidos donde desarroll\u00f3 importantes trabajos, primero en el grupo de <A href=\"http:\/\/www.biology.gatech.edu\/faculty\/jeffrey-skolnick\/\"><FONT color=#000080>Jeffrey Skolnick<\/FONT><\/A> en The Scripps Research Institute y m\u00e1s tarde en su propio grupo, en la Escuela de Medicina Mount Sinai de Nueva York. Volvi\u00f3 a Espa\u00f1a como investigador del <A href=\"http:\/\/www.csic.es\/index.do\"><FONT color=#000080>CSIC<\/FONT><\/A> para liderar la <A href=\"http:\/\/ub.cbm.uam.es\/\"><FONT color=#000080>Unidad de Bioinform\u00e1tica<\/FONT><\/A> del <A href=\"http:\/\/www2.cbm.uam.es\/mkfactory.esdomain\/webs\/CBMSO\/plt_Home.aspx\"><FONT color=#800080>Centro de Biolog\u00eda Molecular \u00abSevero Ochoa\u00bb<\/FONT><\/A> instal\u00e1ndose en Manzanares el Real con su esposa Carme F\u00e1brega, tambi\u00e9n investigadora. Un tumor incurable puso fin prematuramente a su vida en uno de los momentos m\u00e1s creativos de su actividad profesional. Nos ha dejado importantes legados, sobre todo en los campos de la comparaci\u00f3n estructural, la evoluci\u00f3n y el modelado de las estructuras de prote\u00ednas y el dise\u00f1o de f\u00e1rmacos.<\/P>  <P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\" align=center>&nbsp;<\/P>  <P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\" align=center><IMG style=\"WIDTH: 378px; HEIGHT: 298px\" height=350 src=\"\/blogs\/biocienciatecnologia\/wp-content\/blogs.dir\/53\/files\/199\/o_AngelRamirez2.JPG\" width=404><\/P>  <P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\" align=center><?xml:namespace prefix = o ns = \"urn:schemas-microsoft-com:office:office\" \/><o:p>&nbsp;<\/o:p><\/P>  <P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\" align=justify>Para recordar su figura y sus contribuciones se ha organizado el Congreso <A href=\"http:\/\/ub.cbm.uam.es\/memorialortiz\/\"><FONT color=#000080>International workshop in memoriam of \u00c1ngel Ram\u00edrez Ort\u00edz: Structural bioinformatics and beyond. Associated to IX th Jornadas de Bioinform\u00e1tica<\/FONT><\/A>, al cual participar\u00e1n algunos de los mayores expertos espa\u00f1oles e internacionales en el campo de la bioinform\u00e1tica estructural. Este congreso constituye adem\u00e1s la reuni\u00f3n anual de la comunidad de bioinform\u00e1tica espa\u00f1ola, y tendr\u00e1 lugar en Madrid, en la <A href=\"http:\/\/ub.cbm.uam.es\/memorialortiz\/index.php?option=com_content&amp;view=article&amp;id=48&amp;Itemid=48\"><FONT color=#000080>sede central del CSIC<\/FONT><\/A>, desde el 26 al 29 de enero de 2009, contando con el apoyo institucional del <A href=\"http:\/\/www.csic.es\/index.do\"><FONT color=#000080>CSIC<\/FONT><\/A> la <A href=\"http:\/\/www.madrid.org\/cs\/Satellite?pagename=ComunidadMadrid\/Home\"><FONT color=#000080>Comunidad<SPAN style=\"mso-spacerun: yes\">&nbsp; <\/SPAN>de Madrid,<\/FONT><\/A> el <A href=\"http:\/\/www2.cbm.uam.es\/mkfactory.esdomain\/webs\/CBMSO\/plt_Home.aspx\"><FONT color=#800080>CBMSO,<\/FONT><\/A> el <U><SPAN style=\"mso-spacerun: yes\">&nbsp;<\/SPAN><\/U><A href=\"http:\/\/www.inab.org\/\"><FONT color=#000080>Instituto Nacional de Bioinform\u00e1tica<\/FONT><\/A>,<SPAN style=\"mso-spacerun: yes\">&nbsp; <\/SPAN>la <A href=\"http:\/\/www.gen-es.org\/\"><FONT color=#000080>Fundaci\u00f3n Genoma Espa\u00f1a<\/FONT><\/A>, la <A href=\"http:\/\/cbbl.imim.es:8080\/RNB\"><FONT color=#000080>Red Nacional de Bioinform\u00e1tica<\/FONT><\/A>, la <A href=\"http:\/\/bioinfo.cesga.es\/\"><FONT color=#000080>Red Gallega de Bioinform\u00e1tica<\/FONT><\/A>, el <A href=\"http:\/\/bifi.unizar.es\/\"><FONT color=#000080>Instituto BIFI<\/FONT><\/A> de Zaragoza, el <A href=\"http:\/\/www.bsc.es\/\"><FONT color=#000080>Barcelona Supercomputing Center<\/FONT><\/A>, el programa de investigaci\u00f3n <A href=\"http:\/\/solea.quim.ucm.es\/bipedd\"><FONT color=#000080>Bipedd<\/FONT><\/A>, y la ayuda de <I>sponsor<\/I> privados entre los cuales las empresas <A href=\"http:\/\/www.sgi.com\/global\/es\/\"><FONT color=#000080>Silicon Graphics<\/FONT><\/A>, <A href=\"http:\/\/www.fundacionlilly.com\/\"><FONT color=#000080>Lilly<\/FONT><\/A> y <A href=\"http:\/\/www.noscira.com\/\"><FONT color=#000080>Noscira<\/FONT><\/A>. La apertura del plazo de inscripci\u00f3n tendr\u00e1 lugar la primera semana de Octubre de 2008.<\/P>  <P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\" align=justify><o:p>&nbsp;<\/o:p><\/P>  <P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\" align=justify>Quiz\u00e1s se haga necesario decir algo sobre el t\u00e9rmino<SPAN style=\"mso-spacerun: yes\">&nbsp; <\/SPAN><A href=\"http:\/\/en.wikipedia.org\/wiki\/Bioinformatics\"><FONT color=#000080>bioinform\u00e1tica<\/FONT><\/A> para quien no pertenece a este campo porque, a pesar de no sonar extra\u00f1o, a veces da lugar a equ\u00edvocos incluso en los centros de investigaci\u00f3n, donde hay gente que cree que nos dedicamos a arreglar ordenadores.<\/P>  <P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\" align=justify><o:p>&nbsp;<\/o:p><\/P>  <P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\" align=justify>La expresi\u00f3n bioinform\u00e1tica, o <A href=\"http:\/\/en.wikipedia.org\/wiki\/Computational_biology\"><FONT color=#000080>biolog\u00eda computacional<\/FONT><\/A>, que es la que personalmente prefiero, se ha impuesto desde hace tiempo para definir el conjunto de teor\u00edas, modelos y algoritmos que permiten, de una manera cada vez m\u00e1s necesaria, almacenar, clasificar, interpretar y dar un sentido a la gran cantidad de informaci\u00f3n producida por experimentos biol\u00f3gicos. Esta herramienta permite utilizar esta informaci\u00f3n para nuevas predicciones y para objetivos terap\u00e9uticos, por ejemplo, mediante el dise\u00f1o racional de f\u00e1rmacos. Para realizar estos objetivos las gu\u00edas maestras de la bioinform\u00e1tica son la evoluci\u00f3n (de acuerdo con la famosa frase que<I style=\"mso-bidi-font-style: normal\"> \u201c<\/I><A href=\"http:\/\/en.wikipedia.org\/wiki\/Nothing_in_Biology_Makes_Sense_Except_in_the_Light_of_Evolution\"><FONT color=#000080>Nada en biolog\u00eda tiene sentido si no es en la luz de la evoluci\u00f3n<\/FONT><\/A><I style=\"mso-bidi-font-style: normal\">\u201d<\/I>)<I style=\"mso-bidi-font-style: normal\"> <\/I>y la f\u00edsica, con la cual la biolog\u00eda debe ser compatible aunque no se pueda deducir desde la f\u00edsica, por su enorme complejidad y por el car\u00e1cter contingente que le da la evoluci\u00f3n. Por esta duplicidad intr\u00ednseca, la bioinform\u00e1tica es una disciplina ecl\u00e9ctica como pocas, que requiere competencias y puntos de vista diferentes. <\/P>  <P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\" align=justify><o:p>&nbsp;<\/o:p><\/P>  <P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\" align=justify>Esto es particularmente cierto en el campo elegido por \u00c1ngel, las prote\u00ednas, que son como un puente entre el mundo de leyes absolutas de la f\u00edsica y el mundo contingente e hist\u00f3rico de la biolog\u00eda. La mayor\u00eda de las prote\u00ednas adquieren una conformaci\u00f3n tridimensional \u00fanica que es el resultado al mismo tiempo de las leyes de la f\u00edsica, en cuanto a que se trata del estado termodin\u00e1mico de m\u00ednima energ\u00eda libre accesible al sistema prote\u00edna m\u00e1s disolvente, y de las leyes de la biolog\u00eda, en cuanto la secuencia de la prote\u00edna codificada en el genoma de un particular organismo ha evolucionado para adquirir la conformaci\u00f3n estable en la cual la prote\u00edna cumple su funci\u00f3n biol\u00f3gica. Comparar, clasificar y entender la evoluci\u00f3n de las estructuras de las prote\u00ednas era uno de los objetivos principales de \u00c1ngel, que quer\u00eda utilizar estos conocimientos para predecir mejor sus estructuras y su din\u00e1mica, as\u00ed como para poder dise\u00f1ar f\u00e1rmacos. \u00c1ngel pose\u00eda conocimientos de f\u00edsica poco comunes entre quien no es f\u00edsico de formaci\u00f3n (tengo que confesar que los f\u00edsicos que nos dedicamos a la biolog\u00eda, quiz\u00e1s por nuestra gran ignorancia inicial sobre temas biol\u00f3gicos, solemos ser desconfiados en este respecto), un profundo conocimiento de los fen\u00f3menos biol\u00f3gicos y una gran curiosidad intelectual sobre los procesos evolutivos, que hac\u00edan de \u00e9l un cient\u00edfico completo en este campo complejo, sobre todo porque se un\u00edan a la motivaci\u00f3n human\u00edstica que es fundamental en este campo, la de contribuir a luchar contra las enfermedades. <\/P>  <P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\" align=justify><o:p>&nbsp;<\/o:p><\/P>  <P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\" align=justify>Esta motivaci\u00f3n le acompa\u00f1\u00f3 desde sus comienzos en la facultad de Farmacia. Puede parecer parad\u00f3jico que se dedicara a dise\u00f1ar f\u00e1rmacos antitumorales poco antes de saber que le tocar\u00eda luchar su personal batalla contra el c\u00e1ncer. Los que estuvimos cerca en esta \u00faltima fase no olvidaremos su valor al enfrentarse a esta enfermedad sin dejar nada por intentar y sin caer en la desesperaci\u00f3n, pero al mismo tiempo aceptando el ineludible final. Su actitud de dar coraje a los dem\u00e1s m\u00e1s que de recibirlo, y su sentido de responsabilidad, que le llev\u00f3 a preocuparse por la supervivencia de su grupo cuando ya sab\u00eda que su fin era inminente. Tanto \u00e9l como su esposa Carme, siempre a su lado en los momentos m\u00e1s duros con la sonrisa en los labios, nos han dado una gran lecci\u00f3n de valor y calidad humana.<\/P>  <P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\" align=justify>Ahora en septiembre las flores de jara son tan s\u00f3lo un recuerdo, y una promesa. Nos recuerdan lo maravilloso y fr\u00e1gil que puede ser la vida. De \u00c1ngel nos queda su ejemplo y su legado cient\u00edfico, que tambi\u00e9n conllevan recuerdo, y promesa.<\/P>  <P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\" align=center><o:p>&nbsp;<\/o:p><\/P>  <P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\"><SPAN style=\"FONT-SIZE: 11pt\">Ugo Bastolla<o:p><\/o:p><\/SPAN><\/P>  <P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\"><SPAN style=\"FONT-SIZE: 11pt\">Antonio Morreale<o:p><\/o:p><\/SPAN><\/P>  <P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\"><SPAN style=\"FONT-SIZE: 11pt\">David Abia<o:p><\/o:p><\/SPAN><\/P>  <P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\"><SPAN style=\"FONT-SIZE: 11pt\">Sara Cebri\u00e1n<o:p><\/o:p><\/SPAN><\/P>  <P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\"><SPAN style=\"FONT-SIZE: 11pt\">Alvaro Cort\u00e9s<o:p><\/o:p><\/SPAN><\/P>  <P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\"><SPAN style=\"FONT-SIZE: 11pt\">Sandrea Francis<o:p><\/o:p><\/SPAN><\/P>  <P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\"><SPAN style=\"FONT-SIZE: 11pt\">Rub\u00e9n Gil<o:p><\/o:p><\/SPAN><\/P>  <P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\"><SPAN style=\"FONT-SIZE: 11pt\">Javier Klett<o:p><\/o:p><\/SPAN><\/P>  <P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\"><SPAN style=\"FONT-SIZE: 11pt\">Alberto Pascual-Garc\u00eda<o:p><\/o:p><\/SPAN><\/P>  <P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\"><SPAN style=\"FONT-SIZE: 11pt\">Ra\u00fal M\u00e9ndez<o:p><\/o:p><\/SPAN><\/P>  <P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\"><SPAN style=\"FONT-SIZE: 11pt\">Almudena Perona<o:p><\/o:p><\/SPAN><\/P>  <P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\"><SPAN style=\"FONT-SIZE: 11pt\">Gonzalo S\u00e1nchez<o:p><\/o:p><\/SPAN><\/P>  <P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\"><SPAN style=\"FONT-SIZE: 11pt\"><o:p>&nbsp;<\/o:p><\/SPAN><\/P>  <P class=MsoNormal style=\"MARGIN: 0cm -15.8pt 0pt 0cm; TEXT-ALIGN: justify\"><SPAN style=\"FONT-SIZE: 11pt\"><A href=\"http:\/\/www.cbm.uam.es\/mkfactory.esdomain\/webs\/CBMSO\/plt_Servicio_Personal.aspx?IdServicio=4\">Unidad de Bioinform\u00e1tica<o:p><\/o:p><\/A><\/SPAN><\/P><SPAN style=\"FONT-SIZE: 11pt; FONT-FAMILY: 'Times New Roman'; mso-fareast-font-family: 'Times New Roman'; mso-fareast-language: AR-SA; mso-ansi-language: ES; mso-bidi-language: AR-SA\"><A href=\"http:\/\/tempuri.org\/tempuri.html\">Centro de Biolog\u00eda Molecular \u201cSevero Ochoa\u201d<\/A><\/SPAN><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Manzanares el Real se llena en mayo de flores de jara, que suben desde el embalse de Santillana hasta las paredes rocosas del circo de la Pedriza. En este bonito pueblo de la sierra de Madrid falleci\u00f3 el 5 de mayo de 2008 \u00c1ngel Ram\u00edrez Ortiz, uno de los m\u00e1s destacados bioinform\u00e1ticos estructurales de Espa\u00f1a y de Europa, a los 41 a\u00f1os&#8230; &nbsp;<\/p>\n","protected":false},"author":36,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"ngg_post_thumbnail":0},"categories":[77],"tags":[],"blocksy_meta":{"styles_descriptor":{"styles":{"desktop":"","tablet":"","mobile":""},"google_fonts":[],"version":4}},"aioseo_notices":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/biocienciatecnologia\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/102502"}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/biocienciatecnologia\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/biocienciatecnologia\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/biocienciatecnologia\/wp-json\/wp\/v2\/users\/36"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/biocienciatecnologia\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=102502"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/biocienciatecnologia\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/102502\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":131491,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/biocienciatecnologia\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/102502\/revisions\/131491"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/biocienciatecnologia\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=102502"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/biocienciatecnologia\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=102502"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/biocienciatecnologia\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=102502"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}