{"id":114762,"date":"2009-03-18T20:34:00","date_gmt":"2009-03-18T20:34:00","guid":{"rendered":"http:\/\/weblogs.madrimasd.org\/\/bioinformatica\/archive\/2009\/03\/18\/114762.aspx"},"modified":"2009-03-18T20:34:00","modified_gmt":"2009-03-18T20:34:00","slug":"genodive-un-programa-de-visualizacion-de-estructuras-genomicas","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/2009\/03\/18\/114762","title":{"rendered":"genoDive, un programa de visualizaci\u00f3n de estructuras gen\u00f3micas"},"content":{"rendered":"

En las sesiones de BioHackathon acabo de encontrarme con un nuevo programa de visualizaci\u00f3n de estructuras gen\u00f3micas y su informaci\u00f3n asociada. Se llama genoDive<\/a>, y aunque b\u00e1sicamente trabaja como un cliente DAS, da una nueva dimensi\u00f3n al concepto de exploraci\u00f3n gr\u00e1fica de las anotaciones gen\u00f3micas.<\/p>\n

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genoDive Es un programa que est\u00e1 ahora naciendo (es una versi\u00f3n 0.1alpha), est\u00e1escrito en C++ y usa las librer\u00edas OpenGL para la visualizaci\u00f3n. Haydos versiones del mismo, una enfocada en la visualizaci\u00f3n de genomasprocariota con cromosomas circulares (Genotype Pro), mientras que laotra est\u00e1 dedicada a genomas eucariota (con cromosomas lineales).<\/p>\n

Debido a ser tan nuevo, a\u00fan no est\u00e1n disponibles los enlaces de descarga ni de las compilaciones (para Mac OS X y Windows), ni el c\u00f3digo fuente (que deber\u00eda ser posible compilarlo en Linux, seg\u00fan los autores), por lo que s\u00f3lo os puedo ofrecer los videos colgados, que se parecen a la demostraci\u00f3n que acabo de ver.<\/p>\n

Enlaces<\/u><\/p>\n