{"id":11516,"date":"2006-01-03T02:22:00","date_gmt":"2006-01-03T02:22:00","guid":{"rendered":"http:\/\/weblogs.madrimasd.org\/\/bioinformatica\/archive\/2006\/01\/03\/11516.aspx"},"modified":"2006-01-03T02:22:00","modified_gmt":"2006-01-03T02:22:00","slug":"la-bioinformatica-y-los-sistemas-operativos-ii-embnet-livecd","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/2006\/01\/03\/11516","title":{"rendered":"La Bioinform\u00e1tica y los Sistemas Operativos (II): EMBnet LiveCD"},"content":{"rendered":"

Continuando con la serie de art\u00edculos sobre la Bioinform\u00e1tica en su vertiente m\u00e1s ‘cacharrera’, me he encontrado con que EMBnet<\/a> genera peri\u00f3dicamente un DVD con un sistema Linux completo. Dicho DVD contiene el software m\u00e1s usado en bioinform\u00e1tica (en todas sus vertientes), preinstalado en el mismo. Lo mejor de todo es que el DVD es Live<\/i>, lo que permite que puedas usarlo sin necesidad de instalar nada en tu ordenador. La noticia me lleg\u00f3 a trav\u00e9s de un correo del reponsable del nodo EMBnet en Espa\u00f1a<\/a>, J.R. Valverde:
<\/p>\n

Hola a todos,

 est\u00e1 disponible una nueva versi\u00f3n del DVD 'en vivo' de EMBnet. Quien
des\u00e9e una copia puede solicitarla (bajando un DVD virgen) en el servicio de
Inform\u00e1tica Cient\u00edfica, EMBnet\/CNB.

 Para usuarios externos, hay una copia disponible en nuestro servidor
WWW y FTP:

 ftp:\/\/ftp.es.embnet.org\/pub\/EMBnet\/LiveDVD\/<\/a>
 http:\/\/www.es.embnet.org\/Services\/ftp\/EMBnet\/LiveDVD\/<\/a>

 El DVD 'en vivo' de EMBnet est\u00e1 disponible solamente para trabajar con
ordenadores PC. Contiene un sistema operativo Linux y una multitud de programas
tanto cient\u00edficos como de oficina.

 Para usarlo basta arrancar el ordenador con el DVD dentro. Al hacerlo
inicia un sistema Linux (independientemente de lo que contenga nuestro PC),
reconoce las particiones de Windows y da acceso a las mismas, y proporciona 
acceso a una gran variedad de herramientas configuradas para trabajar 
directamente que incluyen

 - an\u00e1lisis de secuencias (EMBOSS...)
 - an\u00e1lisis de estructura molecular (TINKER, Gromacs, SPDBV...)
 - an\u00e1lisis de imagen y geles (ImageJ, GIM...)
 - an\u00e1lisis qu\u00edmico (MPQC, PSI3, Ghemical...)
 - matem\u00e1ticas (R, MuPAD, SciLab...)
 - software de ofim\u00e1tica (OpenOffice, Ximian Office...)
 - servidor Web integrado con portal de trabajo en grupo
 - software de videoconferencia

y mucho m\u00e1s.

 El DVD 'en vivo' de EMBnet ser\u00e1 la herramienta base que usaremos en los
pr\u00f3ximos cursos de inform\u00e1tica cient\u00edfica.

 Muchas de estas herramientas est\u00e1n disponibles tambi\u00e9n para Mac. Si
necesit\u00e1is informaci\u00f3n, consultad con el servicio de Inform\u00e1tica Cient\u00edfica
EMBnet\/CNB.

<\/pre>\n
    Me lo acabo de descargar para probarlo, y nada m\u00e1s arrancar con \u00e9l me he encontrado con una agradable sorpresa: \u00a1est\u00e1 basado en Gentoo! Nada m\u00e1s arrancar, pregunta el kernel que queremos usar. Si teneis problemas con los gr\u00e1ficos al arrancar, os recomiendo que useis ‘gentoo-nofb’, y en caso contrario, ‘gentoo’. En ese momento se inicia el proceso de puesta en marcha del LiveDVD, que consiste en reconocer todos los dispositivos del sistema, autoconfigurar la red y el sonido. A partir de ese instante empieza a arrancar un sistema completo: mysql<\/a> (bases de datos), apache2<\/a> (servidor web), cups<\/a> (servidor de impresi\u00f3n), entorno gr\u00e1fico, etc…<\/p>\n
    He de reconocer que para probarlo lo he sometido a condiciones extremas, porque he usado una m\u00e1quina virtual creada con qemu<\/a> para evitar quemar el DVD en cuesti\u00f3n. La m\u00e1quina virtual era equivalente a un Pentium II con 1.2GHz y 128MB de memoria, y aunque el arranque ha sido muy lento (principalmente por las limitaciones que le he impuesto) \u00a1ha superado la prueba! Obviamente recomiendo usar un ordenador real, y que dicho ordenador tenga como m\u00ednimo 256MB o 512MB de memoria. El principal inconveniente de este LiveDVD es que s\u00f3lo funciona en los PCs (ya sea con procesadores Intel o AMD), con lo que los usuarios actuales de ordenadores Apple (o arquitecturas m\u00e1s ex\u00f3ticas) quedan fuera.<\/p>\n
    En definitiva, si teneis miedo a que vuestro ordenador deje de funcionar al instalar Linux y sois usuarios espor\u00e1dicos de programas bioinform\u00e1ticos, este LiveDVD puede ser la soluci\u00f3n para vosotros, al ser una de las soluciones menos invasivas.<\/p>\n
Enlaces relacionados:<\/p>\n