{"id":115353,"date":"2009-03-27T07:57:00","date_gmt":"2009-03-27T07:57:00","guid":{"rendered":"http:\/\/weblogs.madrimasd.org\/\/bioinformatica\/archive\/2009\/03\/27\/115353.aspx"},"modified":"2009-03-27T07:57:00","modified_gmt":"2009-03-27T07:57:00","slug":"agem-nueva-herramienta-bioinformatica-para-el-estudio-de-la-expresion-genica-en-raton","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/2009\/03\/27\/115353","title":{"rendered":"aGEM, nueva herramienta bioinform\u00e1tica para el estudio de la expresi\u00f3n g\u00e9nica en rat\u00f3n"},"content":{"rendered":"<p>Mis colegas del <a href=\"http:\/\/www.inab.org\/\">INB<\/a> Natalia y Joan me pidieron que le echara un vistazo a su nuevo sistema. <a href=\"http:\/\/bioweb.cnb.csic.es\/VisualOmics\/aGEM\/home.html\">aGEM<\/a> (<i>anatomical Gene Expression Mapping<\/i>) es una plataforma concebida para integrar informaci\u00f3n fenot\u00edpica con la distribuci\u00f3n espacial y temporal de conjuntos de genes expresados en rat\u00f3n.<\/p>\n<div align=\"center\"><a target=\"_blank\" href=\"http:\/\/bioweb.cnb.csic.es\/VisualOmics\/aGEM\/\"><img decoding=\"async\" src=\"\/blogs\/bioinformatica\/wp-content\/blogs.dir\/41\/files\/165\/o_logo_aGEM-mini.png\"><\/a><\/div>\n<p>Seg\u00fan sus autores, esta plataforma proporciona la informaci\u00f3n necesaria para responder a tres preguntas:<br \/><meta http-equiv=\"CONTENT-TYPE\" content=\"text\/html; charset=utf-8\">\t<title><\/title>\t<meta name=\"GENERATOR\" content=\"OpenOffice.org 3.0  (Linux)\">\t<\/p>\n<style type=\"text\/css\">\t<!--\t\t@page { margin: 2cm }\t\tP { margin-bottom: 0.21cm }\t\tA:link { color: #0000ff }\t--><\/style>\n<p><!--more--><\/p>\n<ol>\n<li>\u00bfQu\u00e9 genes se expresan en un determinado componente anat\u00f3mico del rat\u00f3n?<\/li>\n<li>\u00bfEn qu\u00e9 estructuras anat\u00f3micas se expresa un gen o un conjunto de genes?<\/li>\n<li>\u00bfHay alguna correlaci\u00f3n entre estos hallazgos?<\/li>\n<\/ol>\n<p>Esta plataforma <a href=\"http:\/\/bioweb.cnb.csic.es\/VisualOmics\/aGEM\/query.html\">proporciona un visor de consultas<\/a> que empieza a partir de los nombres de un conjunto de genes o los identificadores de un conjunto de estructuras anat\u00f3micas (provenientes de una serie de bases de datos, como <a href=\"http:\/\/genex.hgu.mrc.ac.uk\/\">EMAP<\/a>). A partir de ah\u00ed se obtiene toda la informaci\u00f3n relacionada, con la posibilidad de inspeccionar cada uno de los datos encontrados (p.ej. estados de desarrollo, enfermedades de <a href=\"http:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/Omim\/\">OMIM<\/a>, genes relacionados, mapas de expresi\u00f3n, etc&#8230;).<\/p>\n<p>Si quereis probar, o bien leer m\u00e1s sobre el proyecto en el que est\u00e1 enmarcado aGEM, os recomiendo visitar los siguientes enlaces:<\/p>\n<ul>\n<li><a temp_href=\"# http:\/\/bioweb.cnb.csic.es\/VisualOmics\/aGEM\/query.html\" href=\"#%20http:\/\/bioweb.cnb.csic.es\/VisualOmics\/aGEM\/query.html\">http:\/\/bioweb.cnb.csic.es\/VisualOmics\/aGEM\/query.html<\/a><\/li>\n<li><a temp_href=\"# http:\/\/bioweb.cnb.csic.es\/VisualOmics\/aGEM\/home.html\" href=\"#%20http:\/\/bioweb.cnb.csic.es\/VisualOmics\/aGEM\/home.html\">http:\/\/bioweb.cnb.csic.es\/VisualOmics\/aGEM\/home.html<\/a><\/li>\n<li><a href=\"http:\/\/bioweb.cnb.csic.es\/VisualOmics\/index_VO.html\">http:\/\/bioweb.cnb.csic.es\/VisualOmics\/index_VO.html<\/a><\/li>\n<\/ul>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Mis colegas del INB Natalia y Joan me pidieron que le echara un vistazo a su nuevo sistema. aGEM (anatomical Gene Expression Mapping) es una plataforma concebida para integrar informaci\u00f3n fenot\u00edpica con la distribuci\u00f3n espacial y temporal de conjuntos de genes expresados en rat\u00f3n. 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