{"id":122067,"date":"2009-07-20T21:41:00","date_gmt":"2009-07-20T21:41:00","guid":{"rendered":"http:\/\/weblogs.madrimasd.org\/\/bioinformatica\/archive\/2009\/07\/20\/122067.aspx"},"modified":"2009-07-20T21:41:00","modified_gmt":"2009-07-20T21:41:00","slug":"benchmarking-linux-distros-y-bioinformatica","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/2009\/07\/20\/122067","title":{"rendered":"Benchmarking, Linux distros y bioinform\u00e1tica"},"content":{"rendered":"<p>Hace unos pocos a\u00f1os era casi imposible encontrar herramientas bioinform\u00e1ticas en los paquetes est\u00e1ndar de las distintas distribuciones Linux, pero a d\u00eda de hoy es tan com\u00fan que las podemos encontrar integradas incluso en sistemas de <i>benchmarking<\/i> como el <a href=\"http:\/\/www.phoronix-test-suite.com\/\">Phoronix Test Suite<\/a>. Hace un par de d\u00edas aparecieron en <a href=\"http:\/\/www.phoronix.com\/\">Phoronix<\/a> los resultados de comparar las \u00faltimas versiones de las distribuciones <a href=\"http:\/\/www.opensuse.org\/\">OpenSuSE<\/a>, <a href=\"http:\/\/www.ubuntu.com\/\">Ubuntu<\/a>, <a href=\"http:\/\/fedoraproject.org\/\">Fedora<\/a> y <a href=\"http:\/\/www.mandriva.com\/\">Mandriva<\/a> (mirad el <a href=\"http:\/\/www.phoronix.com\/scan.php?page=article&amp;item=distro_four_way\">siguiente enlace<\/a>), y en la <a href=\"http:\/\/www.phoronix.com\/scan.php?page=article&amp;item=distro_four_way&amp;num=3\">p\u00e1gina 3 del informe<\/a> dos de los benchmarks \u00a1est\u00e1n basados en <a href=\"http:\/\/align.bmr.kyushu-u.ac.jp\/mafft\/software\/\">MAFFT<\/a> y <a href=\"http:\/\/hmmer.janelia.org\/\">HMMer 2.3.2<\/a>!<\/p>\n<p>A este paso tarde o temprano terminar\u00e1n por incluir un test extensivo relacionado con bioinform\u00e1tica, como alg\u00fan programa de din\u00e1mica molecular, que estrese sobremanera el sistema operativo y el hardware de cualquier ordenador.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Hace unos pocos a\u00f1os era casi imposible encontrar herramientas bioinform\u00e1ticas en los paquetes est\u00e1ndar de las distintas distribuciones Linux, pero a d\u00eda de hoy es tan com\u00fan que las podemos encontrar integradas incluso en sistemas de benchmarking como el Phoronix Test Suite. Hace un par de d\u00edas aparecieron en Phoronix los resultados de comparar las \u00faltimas versiones de las distribuciones OpenSuSE, Ubuntu, Fedora y Mandriva (mirad el siguiente enlace), y en la p\u00e1gina 3 del informe dos de los benchmarks \u00a1est\u00e1n basados en MAFFT y HMMer 2.3.2! A este paso tarde o temprano terminar\u00e1n por incluir un test extensivo relacionado\u2026<\/p>\n","protected":false},"author":25,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"ngg_post_thumbnail":0},"categories":[31],"tags":[],"blocksy_meta":{"styles_descriptor":{"styles":{"desktop":"","tablet":"","mobile":""},"google_fonts":[],"version":4}},"aioseo_notices":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/122067"}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/users\/25"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=122067"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/122067\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=122067"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=122067"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=122067"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}