{"id":130958,"date":"2010-04-27T22:33:47","date_gmt":"2010-04-27T21:33:47","guid":{"rendered":"http:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/?p=130958"},"modified":"2010-04-27T22:45:18","modified_gmt":"2010-04-27T21:45:18","slug":"ibis-un-prototipo-resulton","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/2010\/04\/27\/130958","title":{"rendered":"iBIS, un prototipo result\u00f3n"},"content":{"rendered":"

Hace ya casi un mes David Gonz\u00e1lez me mand\u00f3 el enlace a una noticia publicada en el blog OpenHelix<\/a> el pasado 15 de Marzo. Dicha noticia se hac\u00eda eco de la creaci\u00f3n de un portal online de herramientas y tutoriales bioinform\u00e1ticos<\/a> por parte del Center for Computational Science<\/em><\/a> de la University of Miami<\/a>. Dicho portal se llama i<\/em>BIS<\/a>, ahora que he encontrado un peque\u00f1o hueco, me he puesto a probarlo, y he de decir que, aunque todav\u00eda lo considero un prototipo, tiene mucho potencial si lo terminan de desarrollar.<\/p>\n

La p\u00e1gina principal de i<\/em>BIS<\/a> proporciona la t\u00edpica bienvenida de este tipo de portales, advirtiendo adem\u00e1s de los requisitos de plugins<\/em> necesarios para usar dicho portal. Son b\u00e1sicamente tener activo JavaScript, tener el plugin<\/em> de Flash instalado (mala suerte para buena parte de los usuarios de smartphones<\/em> y iPads) y un visor de documentos PDF. En esa misma p\u00e1gina aparece el bot\u00f3n de acceso al portal como tal<\/a>, que lleva a un escritorio web donde se tiene acceso a todos los materiales y herramientas disponibles, as\u00ed como a un sistema de widgets<\/em>.<\/p>\n

Y aqu\u00ed llego a la parte de que es un prototipo. Por un lado, tienen en su listado multitud de widgets<\/em> de herramientas de NGS y an\u00e1lisis de secuencia, pero dichos widgets<\/em> una vez puestos en el \u00e1rea de trabajo se parecen m\u00e1s a post-its<\/em> que a otra cosa. Cada post-it puede contener una breve descripci\u00f3n de la herramienta, un enlace a una p\u00e1gina web relacionada, y opcionalmente un ejemplo de entrada y un tutorial. Al intentar un par de veces ver el tutorial, el sistema al final ha fallado debido a un timeout<\/em>.<\/p>\n

Por otro lado, los desarrolladores del sistema tienen como objetivo proporcionar la funcionalidad de flujos de trabajo guiados, de forma que permita de forma guiada usar las distintas herramientas, y trasvasar la informaci\u00f3n de salida de una a la entrada de otra siguiendo las indicaciones del sistema.<\/p>\n

Que disfrut\u00e9is de la herramienta.<\/p>\n

Enlaces<\/span><\/p>\n