{"id":130966,"date":"2010-04-28T23:52:56","date_gmt":"2010-04-28T22:52:56","guid":{"rendered":"http:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/?p=130966"},"modified":"2010-04-28T23:52:56","modified_gmt":"2010-04-28T22:52:56","slug":"comienza-la-andadura-de-la-plataforma-andaluza-de-bioinformatica","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/2010\/04\/28\/130966","title":{"rendered":"Comienza la andadura de la Plataforma Andaluza de Bioinform\u00e1tica"},"content":{"rendered":"<p style=\"text-align: left;\">De forma similar a lo que pas\u00f3 con <a title=\"Entrada sobre CVUB la Comunidad Biotecnol\u00f3gica\" href=\"\/blogs\/bioinformatica\/2010\/04\/20\/130952\">CVUB<\/a>, hace unos d\u00edas se puso en contacto conmigo <a title=\"M. Gonzalo Claros\" href=\"http:\/\/mgclaros.bubok.com\/\" target=\"_blank\">M. Gonzalo Claros<\/a> de la Universidad de M\u00e1laga, para hablarme sobre los primeros pasos de la <a title=\"Ir a la Plataforma Andaluza de Bioinform\u00e1tica\" href=\"http:\/\/www.scbi.uma.es\/pab\" target=\"_blank\">Plataforma Andaluza de Bioinform\u00e1tica<\/a>. Esta plataforma, est\u00e1 administrada y hospedada f\u00edsicamente por el <a href=\"http:\/\/www.scbi.uma.es\/scbi\/portal\/\" target=\"_blank\">SCBI (Centro de Supercomputaci\u00f3n y Bioinform\u00e1tica de la Universidad de M\u00e1laga)<\/a>, el cu\u00e1l tambi\u00e9n es un nodo de la <a href=\"http:\/\/es.wikipedia.org\/wiki\/Red_Espa%C3%B1ola_de_Supercomputaci%C3%B3n\" target=\"_blank\">Red Espa\u00f1ola de Supercomputaci\u00f3n<\/a>. La plataforma permite a los usuarios utilizar, entre otros, muchos de los programas necesarios para realizar an\u00e1lisis sobre resultados de experimentos de <a href=\"http:\/\/en.wikipedia.org\/wiki\/Next-generation_sequencing#New_sequencing_methods\" target=\"_blank\"><em>deep-sequencing<\/em><\/a> o de <a href=\"http:\/\/es.wikipedia.org\/wiki\/Microarray\" target=\"_blank\">microarrays<\/a>.<br \/>\n<a href=\"http:\/\/www.scbi.uma.es\/bio\/portal\/\" target=\"_blank\"><img decoding=\"async\" class=\"aligncenter\" src=\"http:\/\/www.scbi.uma.es\/bio\/portal\/e107_images\/scbi\/logo-pab125H.png\" alt=\"\" \/><\/a><br \/>\nTras echarle un vistazo al <a href=\"http:\/\/www.scbi.uma.es\/bio\/portal\/e107_plugins\/scbi_resources\/software.php\" target=\"_blank\">listado de servicios que proporciona esta plataforma<\/a>, algunos de los programas que hay disponibles en el entorno virtual son<!--more--> <a href=\"http:\/\/pbil.univ-lyon1.fr\/cap3.php\" target=\"_blank\">CAP3<\/a>, <a href=\"http:\/\/www.chevreux.org\/projects_mira.html\" target=\"_blank\">MIRA<\/a>, <a href=\"http:\/\/bioinf.wehi.edu.au\/limma\/\" target=\"_blank\">BioConductor Limma<\/a>, <a href=\"http:\/\/ambermd.org\/\">AMBER<\/a>, etc&#8230; Parte de estas herramientas pueden ser usadas de forma an\u00f3nima v\u00eda web, pero para sacarle el m\u00e1ximo provecho al entorno y sus herramientas, y poder gestionar sesiones, hay que utilizar usuario y contrase\u00f1a. Los requisitos m\u00ednimos para usar la plataforma son usar un navegador con soporte para Java 1.4.2 o superior para la transferencia de archivos desde y hacia las sesiones de las m\u00e1quinas virtuales, y un cliente de escritorio remoto compatible con el est\u00e1ndar <a href=\"http:\/\/es.wikipedia.org\/wiki\/Remote_Desktop_Protocol\" target=\"_blank\">Microsoft Remote Desktop<\/a> (como, por ejemplo, <a href=\"http:\/\/www.rdesktop.org\/\">rdesktop<\/a>).<\/p>\n<p style=\"text-align: left;\">Adem\u00e1s, la plataforma organiza cursos de uso y aprovechamiento de las herramientas disponibles en su entorno, como por ejemplo <a href=\"http:\/\/www.scbi.uma.es\/bio\/portal\/e107_plugins\/scbi_resources\/cursos.php\" target=\"_blank\">el curso de an\u00e1lisis de microarrays<\/a> que se celebrar\u00e1 el pr\u00f3ximo 1 de Julio en el <a href=\"http:\/\/www.pta.es\/\" target=\"_blank\">Parque Tecnol\u00f3gico de Andaluc\u00eda (PTA)<\/a>. Su plazo de preinscripci\u00f3n termina el pr\u00f3ximo 11 de Junio.<\/p>\n<p style=\"text-align: left;\"><span style=\"text-decoration: underline;\">Enlaces<\/span><\/p>\n<ul>\n<li><a href=\"http:\/\/www.scbi.uma.es\/pab\">Plataforma Andaluza de Bioinform\u00e1tica<\/a><\/li>\n<\/ul>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>De forma similar a lo que pas\u00f3 con CVUB, hace unos d\u00edas se puso en contacto conmigo M. Gonzalo Claros de la Universidad de M\u00e1laga, para hablarme sobre los primeros pasos de la Plataforma Andaluza de Bioinform\u00e1tica. Esta plataforma, est\u00e1 administrada y hospedada f\u00edsicamente por el SCBI (Centro de Supercomputaci\u00f3n y Bioinform\u00e1tica de la Universidad de M\u00e1laga), el cu\u00e1l tambi\u00e9n es un nodo de la Red Espa\u00f1ola de Supercomputaci\u00f3n. La plataforma permite a los usuarios utilizar, entre otros, muchos de los programas necesarios para realizar an\u00e1lisis sobre resultados de experimentos de deep-sequencing o de microarrays. Tras echarle un vistazo al\u2026<\/p>\n","protected":false},"author":25,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"ngg_post_thumbnail":0},"categories":[1,31,189],"tags":[],"blocksy_meta":{"styles_descriptor":{"styles":{"desktop":"","tablet":"","mobile":""},"google_fonts":[],"version":4}},"aioseo_notices":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/130966"}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/users\/25"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=130966"}],"version-history":[{"count":3,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/130966\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":130969,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/130966\/revisions\/130969"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=130966"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=130966"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=130966"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}