{"id":130978,"date":"2010-05-06T18:11:44","date_gmt":"2010-05-06T17:11:44","guid":{"rendered":"http:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/?p=130978"},"modified":"2010-05-06T18:11:44","modified_gmt":"2010-05-06T17:11:44","slug":"otra-competicion-bioinformatica-predict-hiv-progression","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/2010\/05\/06\/130978","title":{"rendered":"Otra competici\u00f3n bioinform\u00e1tica: Predict HIV Progression"},"content":{"rendered":"<p>En el mundo de la bioinform\u00e1tica hay desde hace tiempo muchas competiciones que sirven para medir el estado del arte de las t\u00e9cnicas existentes en determinadas \u00e1reas, como por ejemplo miner\u00eda de textos (<a href=\"http:\/\/www.biocreative.org\/\" target=\"_blank\">BioCreAtIvE<\/a>) o predicci\u00f3n de estructura tridimensional de prote\u00ednas (<a href=\"http:\/\/www.predictioncenter.org\/casp9\/\" target=\"_blank\">CASP<\/a>).<\/p>\n<p><a href=\"http:\/\/kaggle.com\/hivprogression\"><img decoding=\"async\" class=\"alignnone\" title=\"Predict HIV Progression Contest\" src=\"http:\/\/kaggle.com\/images\/logos\/2435\/logo\/hiv.png\" alt=\"\" width=\"100\" height=\"100\" \/><\/a>Acabo de descubrir una nueva competici\u00f3n, llamada <a href=\"http:\/\/kaggle.com\/hivprogression\" target=\"_blank\"><em>Predict HIV Progression<\/em><\/a>, tambi\u00e9n en el campo de la bioinform\u00e1tica. La competici\u00f3n requiere que se prediga la probabilidad de la infecci\u00f3n de un paciente de <a href=\"http:\/\/es.wikipedia.org\/wiki\/VIH\" target=\"_blank\">VIH<\/a> se vuelva menos severa, tomando como punto de partida un peque\u00f1o conjunto de datos e informaci\u00f3n cl\u00ednica limitada.<\/p>\n<p>Tal como aparece en la <a href=\"http:\/\/kaggle.com\/hivprogression\" target=\"_blank\">descripci\u00f3n de la competici\u00f3n<\/a>, seg\u00fan la <a href=\"http:\/\/www.who.int\/es\/\" target=\"_blank\">Organizaci\u00f3n Mundial de la Salud<\/a> el virus del <a href=\"http:\/\/es.wikipedia.org\/wiki\/VIH\" target=\"_blank\">VIH<\/a> ha causado m\u00e1s de 25 millones de muertes en todo el mundo desde que se reconociese como enfermedad desde 1981. Aunque desde entonces han surgido multitud de tratamientos, el virus ha ido evolucionando desde las cepas originalmente descubiertas, volvi\u00e9ndose paulatinamente resistente a ellos.<\/p>\n<p>Disponer del mapa gen\u00e9tico de cada cepa del virus siempre ha sido un paso importante para su comprensi\u00f3n. Y por ello, el objetivo principal de la competici\u00f3n es hacer que los participantes encuentren dentro de las secuencias gen\u00f3micas de cepas del VIH marcadores que predigan un cambio en la severidad de la infecci\u00f3n, mediante la medida de la carga viral y la cuenta de mol\u00e9culas <a href=\"http:\/\/es.wikipedia.org\/wiki\/CD4\" target=\"_blank\">CD4<\/a>.<\/p>\n<p>El conjunto de entrenamiento proporcionado por la organizaci\u00f3n del concurso est\u00e1 compuesto de 1000 registros de pacientes, mientras que el conjunto de datos a ponderar son 692 registros de pacientes distintos de los del conjunto de entrenamiento. Como en todas estas competiciones, los ganadores de la competici\u00f3n tendr\u00e1n asegurada al menos una publicaci\u00f3n.<\/p>\n<p>Todos los detalles los podr\u00e9is encontrar en el sitio web de la competici\u00f3n.<\/p>\n<p><span style=\"text-decoration: underline;\">Enlaces<\/span><\/p>\n<ul>\n<li><a href=\"http:\/\/science.slashdot.org\/story\/10\/05\/05\/1947209\/Crowdsourcing-HIV-Research?from=rss&amp;utm_source=feedburner&amp;utm_medium=feed&amp;utm_campaign=Feed%3A+Slashdot%2Fslashdot+%28Slashdot%29\" target=\"_blank\">Noticia en publicada 6 de Mayo de 2010 en Slashdot<\/a>.<\/li>\n<li><a href=\"http:\/\/kaggle.com\/hivprogression\" target=\"_blank\">Sitio web de la competici\u00f3n <em>Predict HIV Progress<\/em><\/a>.<\/li>\n<\/ul>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>En el mundo de la bioinform\u00e1tica hay desde hace tiempo muchas competiciones que sirven para medir el estado del arte de las t\u00e9cnicas existentes en determinadas \u00e1reas, como por ejemplo miner\u00eda de textos (BioCreAtIvE) o predicci\u00f3n de estructura tridimensional de prote\u00ednas (CASP). Acabo de descubrir una nueva competici\u00f3n, llamada Predict HIV Progression, tambi\u00e9n en el campo de la bioinform\u00e1tica. La competici\u00f3n requiere que se prediga la probabilidad de la infecci\u00f3n de un paciente de VIH se vuelva menos severa, tomando como punto de partida un peque\u00f1o conjunto de datos e informaci\u00f3n cl\u00ednica limitada. 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