{"id":131262,"date":"2011-06-26T22:19:32","date_gmt":"2011-06-26T21:19:32","guid":{"rendered":"http:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/?p=131262"},"modified":"2011-06-26T22:19:32","modified_gmt":"2011-06-26T21:19:32","slug":"y-el-formato-pdb-llega-a-su-version-4-0","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/2011\/06\/26\/131262","title":{"rendered":"Y el formato PDB llega a su versi\u00f3n 4.0"},"content":{"rendered":"

Como todo en el mundo de la bioinform\u00e1tica, los formatos de fichero siguen evolucionando. En este caso se trata el formato PDB, que llega a su versi\u00f3n 4.0 . Y con esa nueva versi\u00f3n, toda la base de datos de PDB ha sufrido una revisi\u00f3n profunda para adaptarse al nuevo formato. Dicha revisi\u00f3n se har\u00e1 p\u00fablica el pr\u00f3ximo 13 de Julio, justo antes del comienzo de las primeras reuniones de ISMB\/ECCB 2011<\/a>. La revisi\u00f3n profunda incluye, por ejemplo, la soluci\u00f3n de problemas con la representaci\u00f3n de complejos, inhibidores de p\u00e9ptidos o antibi\u00f3ticos. En total, poco menos de 17000 entradas se han visto afectadas por las correcciones de representaci\u00f3n en el nuevo formato.<\/p>\n

Ya hace casi cuatro a\u00f1os hubo bastante pol\u00e9mica cuando sali\u00f3 el formato PDB 3.1<\/a>, tambi\u00e9n parte de las entradas fueron revisadas y actualizadas, pero la comunidad de usuarios (bioinform\u00e1ticos, cristal\u00f3grafos, qu\u00edmicos, etc…) no estuvo de acuerdo con parte de esos cambios en los contenidos de las entradas. Ya veremos qu\u00e9 ocurre en esta ocasi\u00f3n.<\/p>\n

Enlaces<\/span><\/p>\n