{"id":131285,"date":"2011-08-01T17:50:55","date_gmt":"2011-08-01T16:50:55","guid":{"rendered":"http:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/?p=131285"},"modified":"2011-08-01T17:50:55","modified_gmt":"2011-08-01T16:50:55","slug":"la-importancia-de-los-mirrors-en-bioinformatica","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/2011\/08\/01\/131285","title":{"rendered":"La importancia de los mirrors en Bioinform\u00e1tica"},"content":{"rendered":"<p>Es 1 de Agosto, fecha oficial de comienzo de las vacaciones de muchas personas en el mundo. Justo el peor momento para que algo catastr\u00f3fico le ocurra a vuestro sitio web favorito. \u00bfCu\u00e1ntos de vosotros os hab\u00e9is tirado de los pelos cuando s\u00f3lo por unos minutos hab\u00e9is sido incapaces de acceder a vuestras cuentas de GMail, a vuestros perfiles de Facebook, o a la web de vuestro banco?<\/p>\n<div style=\"text-align:center\"><a href=\"http:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/files\/2011\/08\/taverna-down.png\"><img decoding=\"async\" title=\"taverna-down\" src=\"http:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/files\/2011\/08\/taverna-down.png\" alt=\"\" \/><\/a><\/div>\n<p>Como dicen los angloparlantes, <a href=\"http:\/\/en.wikipedia.org\/wiki\/Shit_happens\" target=\"_blank\"><em>Shit happens<\/em><\/a>, y la bioinform\u00e1tica no iba a ser un \u00e1rea intocable por <a href=\"http:\/\/en.wikipedia.org\/wiki\/Murphy%27s_law\" target=\"_blank\">la mano de Murphy<\/a>, \u00bfno? Justo ahora mismo varios sitios relacionados con la bioinform\u00e1tica como <a href=\"http:\/\/www.mygrid.org.uk\/\" target=\"_blank\">MyGrid<\/a>, <a href=\"http:\/\/www.taverna.org.uk\/\" target=\"_blank\">Taverna<\/a> o <a href=\"http:\/\/www.biomart.org\/\" target=\"_blank\">BioMart<\/a> no est\u00e1n disponibles porque est\u00e1n sufriendo problemas de alg\u00fan tipo (los dos primeros, por ejemplo, est\u00e1 confirmado que de hardware). Algo muy com\u00fan en bioinform\u00e1tica es la existencia de <em>mirrors<\/em>, lugares donde se encuentran replicados servicios o datos de uso generalizado entre la comunidad bioinform\u00e1tica.<\/p>\n<p>Por ejemplo, sitios como <a href=\"http:\/\/www.ensembl.org\/\" target=\"_blank\">Ensembl<\/a> o <a href=\"http:\/\/www.wwpdb.org\/\" target=\"_blank\">PDB<\/a>, que proporcionan una serie de servicios imprescindibles a d\u00eda de hoy para la bioinform\u00e1tica, se encuentran replicados f\u00edsicamente en distintos puntos geogr\u00e1ficos del planeta. Y algo parecido sucede con las bases de datos biol\u00f3gicas m\u00e1s usadas en bioinform\u00e1tica, que se encuentran disponibles en sitios FTP. Los primeros <em>mirrors<\/em> que nacieron en bioinform\u00e1tica, en la \u00e9poca en que internet estaba casi en pa\u00f1ales y su ancho de banda era baj\u00edsimo, fueron creados por la necesidad de tener un acceso local m\u00e1s r\u00e1pido a los recursos que proporcionaban. Otros motivos fueron m\u00e1s pol\u00edticos, porque a principios de los a\u00f1os 90 el acceso a los sitios y servidores del NIH (donde se encuentran las copias primarias de <a href=\"http:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/genbank\/\" target=\"_blank\">GenBank<\/a>, <a href=\"http:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/RefSeq\/\" target=\"_blank\">RefSeq<\/a> y otras bases de datos) quedaba restringido cada vez que Estados Unidos entraba en alg\u00fan conflicto b\u00e9lico, y no por ello los proyectos que dependieran de esas bases de datos en Europa o Jap\u00f3n deb\u00edan pararse.<\/p>\n<p>La realidad es que a d\u00eda de hoy el n\u00famero de recursos bioinform\u00e1ticos disponibles a trav\u00e9s de la web es enorme, pero pocos de ellos disponen de un <em>mirror<\/em> que pueda usarse en caso de que el sitio principal se caiga, o est\u00e9 inaccesible por problemas en la conexi\u00f3n de red.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Es 1 de Agosto, fecha oficial de comienzo de las vacaciones de muchas personas en el mundo. 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