{"id":131395,"date":"2012-12-29T02:06:32","date_gmt":"2012-12-29T01:06:32","guid":{"rendered":"http:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/?p=131395"},"modified":"2012-12-29T02:06:32","modified_gmt":"2012-12-29T01:06:32","slug":"chemdner-la-subcompeticion-de-identificacion-de-nombres-de-compuestos-y-drogas","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/2012\/12\/29\/131395","title":{"rendered":"CHEMDNER, la subcompetici\u00f3n de identificaci\u00f3n de nombres de compuestos y drogas"},"content":{"rendered":"

Bajo el acr\u00f3nimo que inicia esta entrada de blog (CHEMDNER<\/a>, Chemical compound and drug name recognition task<\/em>) se encuentra\u00a0una de las subcompeticiones de la pr\u00f3xima edici\u00f3n de BioCreative IV<\/a> (Critical Assessment of Information Extraction in Biology<\/em>). Lo primero que se le viene a uno a la mente cuando lee ese acr\u00f3nimo es la frase \u00abPero eso \u00bfqu\u00e9 es?\u00bb, con el acento m\u00e1s basto y cateto con el que identificamos nuestra propia ignorancia.<\/p>\n

BioCreative es una competici\u00f3n que se celebra para ver c\u00f3mo se encuentra el estado del arte de la miner\u00eda de textos en los campos de la biolog\u00eda, biomedicina, bioinform\u00e1tica, … y otros afines. CHEMDNER es una de las 5 subcompeticiones de BioCreative IV, y est\u00e1 enfocada en el reconocimiento de nombres de compuestos qu\u00edmicos y drogas\/f\u00e1rmacos dentro de textos cient\u00edficos y patentes, y de sus roles sem\u00e1nticos en el contexto de las oraciones, p\u00e1rrafos y manuscritos donde participan. Como el lenguaje natural es bastante ambiguo, a\u00fan en el subconjunto usado para el lenguaje cient\u00edfico, los sistemas autom\u00e1ticos creados por los participantes tienen que ser capaces, por ejemplo, de identificar que \u00abaspirina\u00bb,\u00a0C6<\/sub>H4<\/sub>(OCOCH3<\/sub>)COOH,\u00a0CHEBI:15365<\/a> y \u00ab\u00e1cido acetilsalic\u00edlico<\/a>\u00bb son la misma cosa (y es una droga), o que \u00abcloruro s\u00f3dico\u00bb, \u00abNaCl\u00bb y \u00absal\u00bb se refieren a compuestos qu\u00edmicos, pero que el t\u00e9rmino \u00absal\u00bb puede ser o no sin\u00f3nimo de los dos primeros seg\u00fan el contexto.<\/p>\n

As\u00ed que, si os dedic\u00e1is a la miner\u00eda de textos, tal vez os interese participar en \u00e9sta u otras de las subcompeticiones de BioCreative. Para el caso de CHEMDNER, os pod\u00e9is registrar como grupo participante en http:\/\/www.biocreative.org\/news\/biocreative-iv\/team\/<\/a> , y pod\u00e9is encontrar m\u00e1s detalles de la competici\u00f3n en http:\/\/www.biocreative.org\/tasks\/biocreative-iv\/chemdner\/<\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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