{"id":13322,"date":"2006-02-11T02:04:00","date_gmt":"2006-02-11T02:04:00","guid":{"rendered":"http:\/\/weblogs.madrimasd.org\/\/bioinformatica\/archive\/2006\/02\/11\/13322.aspx"},"modified":"2006-02-11T02:04:00","modified_gmt":"2006-02-11T02:04:00","slug":"copias-congeladas-en-el-tiempo-de-la-base-de-datos-pdb","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/2006\/02\/11\/13322","title":{"rendered":"Copias congeladas en el tiempo de la base de datos PDB"},"content":{"rendered":"<p>Acabo de descubrir que los responsables de <a href=\"http:\/\/www.rcsb.org\/pdb\">PDB<\/a> van a empezar a proporcionar anualmente copias congeladas en el tiempo de su base de datos. El sitio FTP donde se almacenan esas copias es: <a href=\"ftp:\/\/snapshots.rcsb.org\/\">ftp:\/\/snapshots.rcsb.org\/<\/a>. Actualmente est\u00e1n disponibles dos copias, correspondientes al 6 de Enero de 2005 y 3 de Enero de 2006, y sirven como referencia estable a tod@s aquell@s que trabajeis con estructuras de prote\u00ednas. Por ejemplo, a partir de ahora ser\u00e1 m\u00e1s f\u00e1cil saber cu\u00e1ndo un nuevo programa de predicci\u00f3n de estructura tridimensional basado en threading es mejor que uno m\u00e1s antiguo, debido a la existencia de un conjunto de referencia estable, o si una red neuronal de reconocimento de sitios de uni\u00f3n sesga demasiado sus resultados para estructuras no existentes cuando fue entrenada.<\/p>\n<p>Los responsables de <a href=\"http:\/\/www.uniprot.org\/\">UniProt<\/a> tambi\u00e9n mantienen copias hist\u00f3ricas, aunque con una frecuencia mayor que PDB. El sitio FTP es <a href=\"ftp:\/\/ftp.ebi.ac.uk\/pub\/databases\/uniprot\/previous_major_releases\/\">ftp:\/\/ftp.ebi.ac.uk\/pub\/databases\/uniprot\/previous_major_releases\/<\/a>.<\/p>\n<p>En definitiva, una buena iniciativa.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Acabo de descubrir que los responsables de PDB van a empezar a proporcionar anualmente copias congeladas en el tiempo de su base de datos. El sitio FTP donde se almacenan esas copias es: ftp:\/\/snapshots.rcsb.org\/. Actualmente est\u00e1n disponibles dos copias, correspondientes al 6 de Enero de 2005 y 3 de Enero de 2006, y sirven como referencia estable a tod@s aquell@s que trabajeis con estructuras de prote\u00ednas. Por ejemplo, a partir de ahora ser\u00e1 m\u00e1s f\u00e1cil saber cu\u00e1ndo un nuevo programa de predicci\u00f3n de estructura tridimensional basado en threading es mejor que uno m\u00e1s antiguo, debido a la existencia de un\u2026<\/p>\n","protected":false},"author":25,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"ngg_post_thumbnail":0},"categories":[31,189],"tags":[],"blocksy_meta":{"styles_descriptor":{"styles":{"desktop":"","tablet":"","mobile":""},"google_fonts":[],"version":4}},"aioseo_notices":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/13322"}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/users\/25"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=13322"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/13322\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=13322"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=13322"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=13322"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}