{"id":13324,"date":"2006-02-11T02:20:00","date_gmt":"2006-02-11T02:20:00","guid":{"rendered":"http:\/\/weblogs.madrimasd.org\/\/bioinformatica\/archive\/2006\/02\/11\/13324.aspx"},"modified":"2006-02-11T02:20:00","modified_gmt":"2006-02-11T02:20:00","slug":"ficheros-pdb-ahora-tambien-en-xml","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/2006\/02\/11\/13324","title":{"rendered":"Ficheros PDB, ahora tambi\u00e9n en XML"},"content":{"rendered":"

Hace ya tiempo que los responsables de PDB<\/a> proporcionaban de forma experimental el contenido de su base de datos en XML, en el denominado formato PDBML<\/a>. Sin embargo, hasta hace poco no han considerado que estuviera lo suficiente maduro su sistema de consolidaci\u00f3n de datos, por  lo que usaban el servidor de proyectos beta de PDB<\/a> para ello. Hoy en d\u00eda todas las estructuras almacenadas en PDB se encuentran publicadas en XML en el servidor FTP oficial de PDB<\/a>, usando tres variantes del formato PDBML: formato completo, formato sin la definici\u00f3n de los \u00e1tomos y formato con la definici\u00f3n de los \u00e1tomos compactada.<\/p>\n

El esquema del formato PDBML es una traducci\u00f3n directa y automatizada del formato mmCIF<\/a> (macromolecular Crystallographic Information File<\/i>), lo que asegura la coherencia y equivalencia de los datos almacenados en ambos formatos.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Hace ya tiempo que los responsables de PDB proporcionaban de forma experimental el contenido de su base de datos en XML, en el denominado formato PDBML. Sin embargo, hasta hace poco no han considerado que estuviera lo suficiente maduro su sistema de consolidaci\u00f3n de datos, por  lo que usaban el servidor de proyectos beta de PDB para ello. Hoy en d\u00eda todas las estructuras almacenadas en PDB se encuentran publicadas en XML en el servidor FTP oficial de PDB, usando tres variantes del formato PDBML: formato completo, formato sin la definici\u00f3n de los \u00e1tomos y formato con la definici\u00f3n de\u2026<\/p>\n","protected":false},"author":25,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"ngg_post_thumbnail":0},"categories":[187,31],"tags":[],"blocksy_meta":{"styles_descriptor":{"styles":{"desktop":"","tablet":"","mobile":""},"google_fonts":[],"version":4}},"aioseo_notices":[],"aioseo_head":"\n\t\t\n\t\n\t\n\t\n\t\n\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t\n\t\t