Hace un par de d\u00edas escribi\u00f3 Esteban, un estudiante de Venezuela, preguntando sobre las limitaciones de la Bioinform\u00e1tica (que, por cierto, no son pocas). Empezar\u00e9 primero por incluir su pregunta completa:
Saludos, soy estudiante de inform\u00e1tica en Venezuela y estoy realizando un investigaci\u00f3n sobre BioInform\u00e1tica. A esta investigaci\u00f3n le quiero agregar una parte que incluya las limitaciones de esta ciencia, agradecer\u00eda si me pueden indicar alguna fuente de donde pueda sacar informaci\u00f3n.
Actualmente la bioinform\u00e1tica tiene muchas limitaciones, pensando en los objetivos \u00faltimos que pretende alcanzar: identificaci\u00f3n perfecta de los genes dentro de cualquier genoma, junto con todas las posibles traducciones a prote\u00edna; predicci\u00f3n perfecta de la estructura tridimensional de las prote\u00ednas, junto con sus propiedades (motivos, sitios de uni\u00f3n, din\u00e1mica molecular); interacciones entre prote\u00ednas y otros partifipantes (ADN, ARN, peque\u00f1as mol\u00e9culas, toxinas), y descubrimiento y comprensi\u00f3n de las rutas metab\u00f3licas existentes en las que participan en influyen; identificaci\u00f3n de las funciones de las distintas prote\u00ednas, interacciones y rutas metab\u00f3licas, etc… B\u00e1sicamente, la bioinform\u00e1tica est\u00e1 todav\u00eda en pa\u00f1ales.
Resumiendo mucho (y perd\u00f3n por adelantado por las posibles barbaridades que vaya a escribir), la mayor parte de las t\u00e9cnicas y sistemas encontrados en bioinform\u00e1tica se basan en interpolar informaci\u00f3n a partir de la ya existente. Son muy comunes t\u00e9cnicas del estilo de anotaci\u00f3n por semejanza y ‘culpable por asociaci\u00f3n’. Eso funcionar\u00eda bien si dispusieramos de bastante informaci\u00f3n biol\u00f3gica significativa, organizada de forma coherente. Pero la realidad es que por un lado nuestros repositorios de informaci\u00f3n son incompletos, parte de su informaci\u00f3n est\u00e1 desfasada o es incorrecta y est\u00e1n sesgados, y por otro lado, que los actuales experimentos de laboratorio generan m\u00e1s informaci\u00f3n de la que podemos procesar satisfactoriamente con nuestros algoritmos y programas.
A estos hechos se une que no comprendemos con suficiente detalle el comportamiento de los distintos sistemas biol\u00f3gicos, y que cuando los comprendemos no somos capaces de simularlos con suficiente detalle. Para colmo, buena parte de la informaci\u00f3n que poseemos no est\u00e1 lo suficientemente cohesionada (a pesar de estar relacionada), est\u00e1 representada bas\u00e1ndose en paradigmas conceptuales ligeramente distintos entre s\u00ed y se encuentra distribu\u00edda.
Muchas veces el problema es tener acceso a la informaci\u00f3n adecuada, porque simplemente no sabemos que existe ni d\u00f3nde est\u00e1. Otras tantas veces el problema es disponer de la capacidad computacional necesaria para procesar la informaci\u00f3n relacionada con el problema que queremos resolver. Y el resto de veces simplemente no disponemos de las t\u00e9cnicas adecuadas.
Siento haber sido tan pesimista. Pero mir\u00e1ndolo por el lado positivo, s\u00f3lo podemos mejorar.
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