{"id":82423,"date":"2008-01-15T07:30:00","date_gmt":"2008-01-15T07:30:00","guid":{"rendered":"http:\/\/weblogs.madrimasd.org\/\/bioinformatica\/archive\/2008\/01\/15\/82423.aspx"},"modified":"2008-01-15T07:30:00","modified_gmt":"2008-01-15T07:30:00","slug":"fold-space-navigator","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/2008\/01\/15\/82423","title":{"rendered":"Fold Space navigator"},"content":{"rendered":"<p>Acaba de llegarme informaci\u00f3n por el lado de <a href=\"http:\/\/www.anacita.com\/\">Ana Rojas<\/a> sobre un sitio web relacionado con la <a href=\"http:\/\/en.wikipedia.org\/wiki\/Structural_bioinformatics\">bioinform\u00e1tica estructural<\/a>. Se trata del <a href=\"http:\/\/www.came.sbg.ac.at\/typo3\/\">C.A.M.E.<\/a> (<a href=\"http:\/\/www.came.sbg.ac.at\/typo3\/\"><i>Center of Applied Molecular Engineering<\/i><\/a>), donde hay disponible un <a href=\"http:\/\/www.came.sbg.ac.at\/typo3\/index.php?id=services\">cat\u00e1logo interesante de servicios bioinform\u00e1ticos<\/a>. Entre ellos, el que m\u00e1s le llam\u00f3 la atenci\u00f3n a Ana fue el <a href=\"http:\/\/qscop-new.services.came.sbg.ac.at\/FoldSpaceNavigator\/bin\/FoldSpaceNavigator.html\"><i>Fold Space navigator<\/i><\/a>, que es una aplicaci\u00f3n basada en Flash que te permite estudiar el espacio conocido de plegamientos de prote\u00ednas, y las interrelaciones existentes estos plegamientos por sus coocurrencias en estructuras. La aplicaci\u00f3n usa la informaci\u00f3n proveniente de las bases de datos estructurales COPS, <a href=\"http:\/\/scop.mrc-lmb.cam.ac.uk\/scop\/\">SCOP<\/a> y <a href=\"http:\/\/www.cathdb.info\/\">CATH<\/a>. La aplicaci\u00f3n permite ver, mediante un identificador de <a href=\"http:\/\/www.wwpdb.org\/\">PDB<\/a>, toda la informaci\u00f3n que posee relacionada con esa entrada mediante el visor integrado en forma de \u00e1rbol. Adem\u00e1s, permite lanzar el servicio <a href=\"http:\/\/topmatch.services.came.sbg.ac.at\/\">TopMatch<\/a> de superposici\u00f3n de estructuras, para comparar las diferencias entre las estructuras mediante <a href=\"http:\/\/www.jmol.org\/\">Jmol<\/a>, y que proporciona informaci\u00f3n detallada a varios niveles.<\/p>\n<p><u>Enlaces<\/u>:<\/p>\n<ul>\n<li><a href=\"http:\/\/www.came.sbg.ac.at\/typo3\/index.php?id=services\">Servicios del C.A.M.E.<\/a><\/li>\n<\/ul>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Acaba de llegarme informaci\u00f3n por el lado de Ana Rojas sobre un sitio web relacionado con la bioinform\u00e1tica estructural. Se trata del C.A.M.E. (Center of Applied Molecular Engineering), donde hay disponible un cat\u00e1logo interesante de servicios bioinform\u00e1ticos. Entre ellos, el que m\u00e1s le llam\u00f3 la atenci\u00f3n a Ana fue el Fold Space navigator, que es una aplicaci\u00f3n basada en Flash que te permite estudiar el espacio conocido de plegamientos de prote\u00ednas, y las interrelaciones existentes estos plegamientos por sus coocurrencias en estructuras. La aplicaci\u00f3n usa la informaci\u00f3n proveniente de las bases de datos estructurales COPS, SCOP y CATH. La aplicaci\u00f3n\u2026<\/p>\n","protected":false},"author":25,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"ngg_post_thumbnail":0},"categories":[189],"tags":[],"blocksy_meta":{"styles_descriptor":{"styles":{"desktop":"","tablet":"","mobile":""},"google_fonts":[],"version":4}},"aioseo_notices":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/82423"}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/users\/25"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=82423"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/82423\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=82423"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=82423"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=82423"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}