{"id":83856,"date":"2008-02-05T10:52:00","date_gmt":"2008-02-05T10:52:00","guid":{"rendered":"http:\/\/weblogs.madrimasd.org\/\/bioinformatica\/archive\/2008\/02\/05\/83856.aspx"},"modified":"2008-02-05T10:52:00","modified_gmt":"2008-02-05T10:52:00","slug":"biohackathon-2008","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/2008\/02\/05\/83856","title":{"rendered":"BioHackathon 2008"},"content":{"rendered":"<p>Como algunos sabreis, la semana que viene se va a celebrar en <a href=\"http:\/\/es.wikipedia.org\/wiki\/Valencia\">Valencia<\/a> las <a href=\"http:\/\/cbbl.imim.es:8080\/RNB\/events-1\/viii-jornadas-de-bioinformatica\">VIII Jornadas de Bioinform\u00e1tica<\/a>, a las cu\u00e1les iba a asistir (como he hecho cada a\u00f1o). Sin embargo, este a\u00f1o me han coincidido con <a href=\"http:\/\/hackathon.dbcls.jp\/\">BioHackathon 2008<\/a>, que se celebra este a\u00f1o en <a href=\"http:\/\/es.wikipedia.org\/wiki\/Tokio\">Tokio, Jap\u00f3n<\/a>, a las que voy a asistir en representaci\u00f3n del <a href=\"http:\/\/www.inab.org\/\">INB<\/a>. Indagando en la red, me he enterado que <a href=\"http:\/\/open-bio.org\/wiki\/Newsletter:2002_Summer#2002_BioHackathon_Report\">este congreso se celebr\u00f3 por primera vez en 2002<\/a>, siendo en <a href=\"http:\/\/es.wikipedia.org\/wiki\/Arizona\">Arizona (EEUU)<\/a> la primera sesi\u00f3n y en <a href=\"http:\/\/es.wikipedia.org\/wiki\/Ciudad_del_Cabo\">Ciudad del Cabo (Sud\u00e1frica)<\/a> la segunda, lo cu\u00e1l fue muy innovador para la fecha en la que se celebr\u00f3.<\/p>\n<p>B\u00e1sicamente, BioHackathon es una reuni\u00f3n de desarrolladores de software, protocolos, ontolog\u00edas y servicios bioinform\u00e1ticos, enfocando la tem\u00e1tica del congreso en distintas \u00e1reas seg\u00fan las necesidades. Este a\u00f1o BioHackathon est\u00e1 enfocado en el \u00e1mbito de <a href=\"http:\/\/es.wikipedia.org\/wiki\/Web_Service\"><i>web services<\/i><\/a> desde cuatro perspectivas distintas, con sus propios objetivos:<br \/><!--more--><\/p>\n<ul>\n<li><b>Proveedores de <a href=\"http:\/\/es.wikipedia.org\/wiki\/Web_Service\"><i>web services<\/i><\/a><\/b>: fomentar que los desarrolladores de servicios web usen est\u00e1ndares que faciliten la integraci\u00f3n y la interoperatividad de sus servicios. Adem\u00e1s, un objetivo principal es conseguir que haya un n\u00famero mayor de <a href=\"http:\/\/es.wikipedia.org\/wiki\/SOAP\">servicios SOAP<\/a> asociados a herramientas y bases de datos que no posean tal facilidad.<\/li>\n<li><b>Desarrolladores que usan las <a href=\"http:\/\/www.open-bio.org\/\">librer\u00edas Open Bio*<\/a><\/b>: que se pueda usar cada <i>web service<\/i> desde cualquiera de los 4 principales lenguajes de programaci\u00f3n usados en bioinform\u00e1tica: <a href=\"http:\/\/www.bioperl.org\/wiki\/Main_Page\">Perl<\/a>, <a href=\"http:\/\/biopython.org\/wiki\/Main_Page\">Python<\/a>, <a href=\"http:\/\/bioruby.org\/\">Ruby<\/a> y <a href=\"http:\/\/biojava.org\/wiki\/Main_Page\">Java<\/a>. Adem\u00e1s, otro objetivo principal es que se creen clases similares y compatibles en las librer\u00edas Open Bio* asociadas a todos los lenguajes mencionados, para el manejo de conceptos comunes como <a href=\"http:\/\/es.wikipedia.org\/wiki\/Secuencia_de_ADN\">secuencias<\/a>, <a href=\"http:\/\/es.wikipedia.org\/wiki\/Chip_de_ADN\">arrays de expresi\u00f3n<\/a>, <a href=\"http:\/\/es.wikipedia.org\/wiki\/Ruta_metab%C3%B3lica\">rutas metab\u00f3licas<\/a>, etc&#8230;<\/li>\n<li><b>Desarrolladores de clientes o ejecutores de <i>workflows<\/i> bioinform\u00e1ticos<\/b>: que dichos clientes sean capaces de usar de forma transparente servicios en <a href=\"http:\/\/es.wikipedia.org\/wiki\/Computaci%C3%B3n_grid\">grid<\/a>, <a href=\"http:\/\/es.wikipedia.org\/wiki\/Web_Service\"><i>web services<\/i><\/a>, recursos remotos y locales, <a href=\"http:\/\/es.wikipedia.org\/wiki\/REST\">llamadas REST<\/a>, conexiones s\u00edncronas y as\u00edncronas, etc&#8230;<\/li>\n<li><b>Desarrolladores del proyecto <a href=\"http:\/\/www.biomoby.org\/\">BioMOBY<\/a><\/b>: que se produzca una estandarizaci\u00f3n de los objetos y m\u00e9todos usados por los web services bioinform\u00e1ticos mediante <a href=\"http:\/\/www.biomoby.org\">BioMOBY<\/a>. Para ello, habr\u00e1 que discutir la mejor soluci\u00f3n para el marco de integraci\u00f3n y las ontolog\u00edas de ciencias de la vida a usar.<\/li>\n<\/ul>\n<p>Por un lado, me da la impresi\u00f3n de que este congreso va a ser muy productivo, pero por otro, estoy viendo que el teclado de mi port\u00e1til va a echar literalmente \u00abhumo\u00bb durante una semana&#8230;<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Como algunos sabreis, la semana que viene se va a celebrar en Valencia las VIII Jornadas de Bioinform\u00e1tica, a las cu\u00e1les iba a asistir (como he hecho cada a\u00f1o). Sin embargo, este a\u00f1o me han coincidido con BioHackathon 2008, que se celebra este a\u00f1o en Tokio, Jap\u00f3n, a las que voy a asistir en representaci\u00f3n del INB. Indagando en la red, me he enterado que este congreso se celebr\u00f3 por primera vez en 2002, siendo en Arizona (EEUU) la primera sesi\u00f3n y en Ciudad del Cabo (Sud\u00e1frica) la segunda, lo cu\u00e1l fue muy innovador para la fecha en la que\u2026<\/p>\n","protected":false},"author":25,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"ngg_post_thumbnail":0},"categories":[187,31],"tags":[],"blocksy_meta":{"styles_descriptor":{"styles":{"desktop":"","tablet":"","mobile":""},"google_fonts":[],"version":4}},"aioseo_notices":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/83856"}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/users\/25"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=83856"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/83856\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=83856"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=83856"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=83856"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}