Durante esta semana y la que viene se celebra en Madrid la V Semana de la Ciencia<\/a> (un poco contradictorio que una semana de la ciencia dure dos), y con motivo de la misma se van a celebrar representaciones de teatro, charlas coloquio, mesas redondas y jornadas de puertas abiertas en los distintos centros de investigaci\u00f3n y entidades que participen. Actualmente trabajo para el CSIC<\/a> en el CNB<\/a>, este centro de investigaci\u00f3n va a tener el 15 de Noviembre su jornada de puertas abiertas para preuniversitarios (4 grupos de 10 chavales cada uno), y hace unas semanas me pidieron que impartiera la charla de Computaci\u00f3n Cient\u00edfica y Bioinform\u00e1tica.<\/p>\n Pensando en qu\u00e9 contarle a los muchachos, surgi\u00f3 la reflexi\u00f3n que estoy escribiendo ahora. Hay una pregunta que todos los que trabajamos en ciencia podemos responder f\u00e1cil o d\u00edficilmente, dependiendo de con qui\u00e9n estemos hablando, y es \u00aben qu\u00e9 estamos trabajando<\/span>\u00ab. En mi caso, respuestas como \u00abSoy Bioinform\u00e1tico\u00bb o \u00abTrabajo en Bioinform\u00e1tica\u00bb pueden ser entendidas as\u00ed:<\/p>\n
<\/span><\/td>\n<\/tr>\n<\/tbody>\n<\/table>\n \u00a1Y aqu\u00ed es donde comienza el problema! Muchas veces he explicado en qu\u00e9 consiste la bioinform\u00e1tica, y muchas de ellas les ha sonado a chino a quien se lo haya explicado. Ya os habreis dado cuenta que los casos anteriores no son excluyentes entre s\u00ed. M\u00e1s de uno ha pasado por los casos b), c) y d) en una misma explicaci\u00f3n. Todav\u00eda recuerdo que al poco de empezar a trabajar me tocaba hacer la defensa de mi Proyecto Fin de Carrera, y al hablar con mi director de proyecto y contarle que trabajaba en Bioinform\u00e1tica con bases de datos, me respondi\u00f3 algo as\u00ed como:<\/p>\n \u00abVale, de acuerdo, esa es la explicaci\u00f3n oficial, pero ahora dime, \u00bfest\u00e1s haciendo de administrador de m\u00e1quinas?\u00bb<\/span><\/p>\n Expres\u00e1ndolo claramente \u00a1esa respuesta me jodi\u00f3 mucho en aquel momento! \u00a1Mi propio tutor estim\u00f3 por una simple palabra que mi reci\u00e9n obtenido t\u00edtulo no serv\u00eda para nada! Al poco me di cuenta de que, simplemente, estaba trabajando en algo tan nuevo que apenas unos pocos en Espa\u00f1a sab\u00edan explicar qu\u00e9 es la Bioinform\u00e1tica. Desde entonces, como se dice vulgarmente, \u00abha llovido mucho\u00bb, y con la secuenciaci\u00f3n del genoma humano, la clonaci\u00f3n de la oveja Dolly, y otros hitos, la gente, aunque no entiende o sabe qu\u00e9 es la biotecnolog\u00eda y la bioinform\u00e1tica, ya tiene la sensaci\u00f3n de que trabajas en algo importante del mundo de la investigaci\u00f3n. La \u00faltima persona hasta la fecha que me ha preguntado sobre qu\u00e9 es la bioinform\u00e1tica ha sido el periodista de La Flecha que se puso en contacto conmigo, y que tambi\u00e9n me ha inspirado para escribir esta reflexi\u00f3n. Porque, \u00bfqu\u00e9 es la Bioinform\u00e1tica? En todos los a\u00f1os que llevo trabajando en esto todav\u00eda no he encontrado una respuesta corta que me satisfaga. En Wikipedia podemos encontrar una definici\u00f3n bastante concisa, pero algo sesgada.<\/p>\n Aunque la bioinform\u00e1tica es una rama de la ciencia que se puede considerar en sus comienzos, est\u00e1 repleta de \u00e1reas de investigaci\u00f3n muy dispares en constante ebullici\u00f3n. Por ejemplo, anotaci\u00f3n de la funci\u00f3n de prote\u00ednas, predicci\u00f3n de estructura tridimensional de prote\u00ednas, predicci\u00f3n de interacciones, definici\u00f3n y anotaci\u00f3n de dominios funcionales mediante HMM (Hidden Markov Models), an\u00e1lisis automatizado de textos cient\u00edficos para la realizaci\u00f3n de inferencias, simulaci\u00f3n de la din\u00e1mica de plegamiento de una prote\u00edna, simulaciones de din\u00e1mica molecular… Y as\u00ed, un largo, largo etc\u00e9tera. Por eso creo que el t\u00e9rmino bioinform\u00e1tica s\u00f3lo lo puedo definir vagamente, algo muy parecido a \u00abla inform\u00e1tica al servicio de la biolog\u00eda y la biotecnolog\u00eda\u00bb. Y por esa raz\u00f3n hay trabajando en bioinform\u00e1tica gente de disciplinas muy diversas: matem\u00e1ticos, f\u00edsicos, bioqu\u00edmicos, ingenieros en inform\u00e1tica, ingenieros en telecomunicaci\u00f3n, alg\u00fan ling\u00fc\u00edsta, bi\u00f3logos (por supuesto), etc. En nuestro trabajo se suelen aplicar y usar muchos de los desarrollos originados en otras disciplinas, y lo m\u00e1s importante, se trata de un trabajo colaborativo, en equipo<\/span>.<\/p>\n Muchas de las herramientas que se desarrollan en bioinform\u00e1tica tienen como objetivo predecir propiedades f\u00edsicas de sistemas biol\u00f3gicos o de alguno de sus elementos, ya sea a bajo nivel (estructura de una prote\u00edna, por ejemplo) o a un nivel mayor (inferencia de la influencia de una familia de prote\u00ednas sobre las rutas metab\u00f3licas de un organismo). Muchos de los algoritmos usados en bioinform\u00e1tica necesitan analizar vol\u00famenes de datos del orden de decenas o cientos de gigabytes (109<\/sup> bytes) para una sola entrada, \u00a1y normalmente pueden recibir miles de una sola tacada! Estos datos tienen su origen en informaci\u00f3n experimental recopilada de los distintos experimentos que realizan los bi\u00f3logos en los distintos organismos, y el volumen de los mismos crece de forma exponencial (a un ritmo mayor que la ley de Moore) por la creciente automatizaci\u00f3n y ejecuci\u00f3n masiva de muchos experimentos que antes s\u00f3lo se pod\u00edan hacer a mano, uno a uno. S\u00f3lo la Astronom\u00eda y la F\u00edsica de Altas Energ\u00edas generan un volumen datos mayor que la Bioinform\u00e1tica (y las Ciencias de la Vida en general).<\/p>\n Terminando de escribir esta reflexi\u00f3n me he puesto a pensar en el papel de la inform\u00e1tica en la bioinform\u00e1tica, pero eso lo dejo para otro d\u00eda. Para terminar, me viene a la mente la cara que puso la chica del Carrefour encargada de compras a plazos cuando compr\u00e9 un frigor\u00edfico, me pregunt\u00f3 d\u00f3nde trabajaba, y le respond\u00ed \u00abEn el CSIC<\/a>\u00bb y le ense\u00f1\u00e9 la n\u00f3mina. \u00a1Se pensaba que era un esp\u00eda del CESID<\/a>!<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Durante esta semana y la que viene se celebra en Madrid la V Semana de la Ciencia (un poco contradictorio que una semana de la ciencia dure dos), y con motivo de la misma se van a celebrar representaciones de teatro, charlas coloquio, mesas redondas y jornadas de puertas abiertas en los distintos centros de investigaci\u00f3n y entidades que participen. 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