{"id":97945,"date":"2008-07-31T11:07:00","date_gmt":"2008-07-31T11:07:00","guid":{"rendered":"http:\/\/weblogs.madrimasd.org\/\/bioinformatica\/archive\/2008\/07\/31\/97945.aspx"},"modified":"2008-07-31T11:07:00","modified_gmt":"2008-07-31T11:07:00","slug":"la-bioinformatica-y-los-sistemas-operativos-v-dnalinux","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/2008\/07\/31\/97945","title":{"rendered":"La Bioinform\u00e1tica y los Sistemas Operativos (V): DNALinux"},"content":{"rendered":"<p>Como ya he mencionado en varias entradas de este blog a lo largo de un par de a\u00f1os, hay disponibles en internet varios <a href=\"http:\/\/es.wikipedia.org\/wiki\/LiveCD\">LiveCD y LiveDVD<\/a> repletos de herramientas bioinform\u00e1ticas. Y tal es el caso de <a href=\"http:\/\/www.dnalinux.com\/\">DNALinux<\/a>, que se encuentra referenciado desde la p\u00e1gina inglesa de Wikipedia relacionada con el t\u00e9rmino <a href=\"http:\/\/en.wikipedia.org\/wiki\/BioLinux\"><i>BioLinux<\/i><\/a>.<\/p>\n<div align=\"center\"><a href=\"http:\/\/www.dnalinux.com\/\"><img decoding=\"async\" src=\"\/blogs\/bioinformatica\/wp-content\/blogs.dir\/41\/files\/167\/o_dnalogo-small.jpg\"><br \/><\/a><\/div>\n<p>DNALinux se encuentra disponible en formato de LiveCD, y la imagen del mismo se distribuye comprimida en formato <a href=\"http:\/\/en.wikipedia.org\/wiki\/Tar_%28file_format%29\">tar<\/a> + <a href=\"http:\/\/en.wikipedia.org\/wiki\/7z\">7z<\/a> tanto mediante mirrors distribuidos por el mundo como mediante el popular <a href=\"http:\/\/en.wikipedia.org\/wiki\/BitTorrent_%28protocol%29\">protocolo BitTorrent<\/a>. La versi\u00f3n actual se denomina <i>Virtual Desktop Edition<\/i>, y seg\u00fan su p\u00e1gina web actualmente contiene:<br \/><!--more--><\/p>\n<ul>\n<li>NCBI BLAST 2.2.16<\/li>\n<li>NCBI NetBLAST 2.2.16<\/li>\n<li>EMBOSS 4.1.0<\/li>\n<li>ESIM4 (EMBOSS SIM4)<\/li>\n<li>MSE 1.0.0<\/li>\n<li>Phylip 3.6b<\/li>\n<li>Biopython 1.43<\/li>\n<li>BioPerl<\/li>\n<li>Kalign 1.04<\/li>\n<li>Clustalx and Clustalw 1.83<\/li>\n<li>njplot<\/li>\n<li>Polyxmass 0.9.7<\/li>\n<li>Primer3<\/li>\n<li>Rasmol 2.7.2.1.1<\/li>\n<li>Sigma-align 1.0<\/li>\n<li>t_coffe 2.50<\/li>\n<li>xviewg<\/li>\n<li>Treeviewx 0.5.1<\/li>\n<li>hmmer 2.3.2<\/li>\n<li>NCBI-epcr<\/li>\n<li>Cn3D NCBI Database Viewer<\/li>\n<li>DDV Sequence Alignment Viewer<\/li>\n<li>Entrez NCBI Database Querying Tool<\/li>\n<li>OneD Biological Sequence Viewer<\/li>\n<li>PyMOL Molecular Graphics System<\/li>\n<li>Sequin DNA Sequence Submission Tool<\/li>\n<\/ul>\n<p>Si echais en falta alguna aplicaci\u00f3n, los autores de este LiveCD admiten sugerencias a trav\u00e9s de correo electr\u00f3nico, para as\u00ed incluirla en la siguiente <i>release<\/i>.<\/p>\n<p>Esperemos que a DNALinux no le pase como a otras iniciativas, que terminan qued\u00e1ndose congeladas con el paso del tiempo. La buena noticia es que cada vez hay m\u00e1s aplicaciones bioinform\u00e1ticas integradas en las distribuciones de Linux, y que para otros sistemas como Mac OS X hay paquetes de programas disponibles listos para instalar.<\/p>\n<p>\u00a1Felices vacaciones!<\/p>\n<div align=\"justify\"><\/div>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Como ya he mencionado en varias entradas de este blog a lo largo de un par de a\u00f1os, hay disponibles en internet varios LiveCD y LiveDVD repletos de herramientas bioinform\u00e1ticas. Y tal es el caso de DNALinux, que se encuentra referenciado desde la p\u00e1gina inglesa de Wikipedia relacionada con el t\u00e9rmino BioLinux. DNALinux se encuentra disponible en formato de LiveCD, y la imagen del mismo se distribuye comprimida en formato tar + 7z tanto mediante mirrors distribuidos por el mundo como mediante el popular protocolo BitTorrent. La versi\u00f3n actual se denomina Virtual Desktop Edition, y seg\u00fan su p\u00e1gina web actualmente\u2026<\/p>\n","protected":false},"author":25,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"ngg_post_thumbnail":0},"categories":[187],"tags":[],"blocksy_meta":{"styles_descriptor":{"styles":{"desktop":"","tablet":"","mobile":""},"google_fonts":[],"version":4}},"aioseo_notices":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/97945"}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/users\/25"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=97945"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/97945\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=97945"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=97945"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/bioinformatica\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=97945"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}