{"id":105010,"date":"2008-10-27T10:46:00","date_gmt":"2008-10-27T10:46:00","guid":{"rendered":"http:\/\/weblogs.madrimasd.org\/\/microbiologia\/archive\/2008\/10\/27\/105010.aspx"},"modified":"2010-01-26T23:37:51","modified_gmt":"2010-01-26T22:37:51","slug":"proyecto-microbioma-censando-los-microbios-que-viven-en-el-cuerpo","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/2008\/10\/27\/105010","title":{"rendered":"Proyecto MICROBIOMA: Censando los microbios que viven en el cuerpo"},"content":{"rendered":"
autor: Miguel Vicente<\/a> <\/strong><\/p>\n

Es sabido, desde ya hace mucho, que de cada diez c\u00e9lulas que llevamos en el cuerpo tan s\u00f3lo una es humana, las otras nueve son microbios de diverso tipo. Para ellos nuestro cuerpo es su casa e intentan vivir en armon\u00eda desde la piel hasta en el intestino. Hace unos d\u00edas se ha anunciado la formaci\u00f3n de un consorcio<\/a> mundial<\/a> de grupos de investigaci\u00f3n cuyo objetivo es identificar los microbios que habitan en el ser humano mediante la secuenciaci\u00f3n de sus ADNs. Muchos, si no la mayor parte de ellos no se han podido cultivar por lo que se propone una aproximaci\u00f3n metagen\u00f3mica, es decir amplificar los ADNs de origen microbiano que se obtengan del cuerpo, averiguar sus secuencias y por comparaci\u00f3n predecir a qu\u00e9 tipo de microbios debe corresponder para finalmente recomponer en el ordenador el cat\u00e1logo de los min\u00fasculos habitantes del cuerpo humano.
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<\/strong>Los sitios que le gustan a los microbios para vivir en el cuerpo humano. <\/strong>La piel, el aparato digestivo, el respiratorio y el urogenital albergan, en el individuo sano, florecientes colonias de muy diversos microbios.
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Ya en febrero de este a\u00f1o la revista Microbiology today<\/em><\/a> nos daba un resumen de los diversos tipos de microbios que habitan en el cuerpo humano, desde las bifidobacterias del intestino infantil que ayudan a asimilar la leche, hasta los Staphylococcus aureus<\/em> de la piel y v\u00edas respiratorias que cuando se rompe el equilibrio entre el cuerpo y la poblaci\u00f3n de microbios pueden producir complicaciones letales. Normalmente los microbios que nos habitan no solo no son un peligro sino que nos ayudan a mantenernos sanos, en primer lugar compitiendo entre ellos de manera que ninguno predomina sobre los otros. Tambi\u00e9n el cuerpo produce sustancias con propiedades antibi\u00f3ticas, suelen ser peque\u00f1os p\u00e9ptidos<\/a> que a las c\u00e9lulas humanas no les hacen da\u00f1o, pero que cuando se integran a las membranas de las bacterias las alteran de forma que la bacteria no logra sobrevivir.<\/p>\n

Est\u00e1n, aunque no los sepamos cultivar<\/strong>
\nSe calcula que de todos los microbios que normalmente habitan en la boca la mitad no se han podido cultivar, y se sabe que de sus interacciones y capacidad para pegarse al esmalte dental depende la salud de los dientes y de las enc\u00edas. Las nuevas t\u00e9cnicas de secuenciaci\u00f3n de ADNs<\/a>, as\u00ed como los avances inform\u00e1ticos permiten plantear el proyecto de identificar a casi todos los microbios que nos colonizan. El principio b\u00e1sico es lo que se ha venido en llamar \u201cmetagen\u00f3mica\u201d y a grandes rasgos consiste en obtener todos los posibles fragmentos del ADN total que existe en una muestra de una determinada procedencia, sin importar para nada en este momento la identidad del organismo del que pueda proceder cada fragmento y secuenciarlo por la t\u00e9cnica llamada \u201cwhole genome shotgun<\/em>\u201d (que quiere decir algo as\u00ed como fragmentar el genoma completo en trocitos) que permite una gran rapidez en la obtenci\u00f3n de secuencias. Una vez obtenidas las secuencias se encarga al ordenador que las clasifique, las compare unas con otras y con las secuencias ya conocidas, las reagrupe si es posible determinando su pertenencia a un mismo o a diferentes organismos, sean o no conocidos, y les asigne una posible funci\u00f3n. Con toda esa informaci\u00f3n se dispone de una instant\u00e1nea de lo que debe ser la poblaci\u00f3n que habita en el lugar de donde se tom\u00f3 la muestra, ya sea del cuerpo humano o de un vertedero. Es como si dij\u00e9semos obtener el padr\u00f3n de un municipio, en el que hemos apuntado las edades, las profesiones, los niveles sociales de cada individuo y el tipo de vivienda que habita.<\/p>\n

\u00bfQu\u00e9 hacer con todos esos datos? <\/strong>
\nEs la misma pregunta con la que se encuentran todos los proyectos de obtenci\u00f3n masiva de datos. Al igual que el padr\u00f3n, que no puede relatar lo que los ciudadanos sienten y padecen, el proyecto microbioma no responder\u00e1 todas las inc\u00f3gnitas de la fisiolog\u00eda de la flora microbiana que nos usa como vivienda, pero s\u00ed que puede dar informaci\u00f3n muy valiosa sobre su composici\u00f3n en el individuo sano, y permitir\u00e1 averiguar las variaciones que ocurren en personas enfermas. Para llegar a entender c\u00f3mo interaccionan los diferentes microbios entre s\u00ed y con las c\u00e9lulas del cuerpo seguir\u00e1 siendo imprescindible continuar el trabajo, a veces menos espectacular de estudiar uno a uno el comportamiento de cada especie de microbio que sea posible analizar en el laboratorio, las que s\u00ed podemos cultivar, y seguir intentando cultivar en el tubo de ensayo las que a\u00fan no sabemos hacerlo. Tambi\u00e9n de estos estudios podemos obtener datos muy importantes para preservar la salud si averiguamos las condiciones precisas para que un microbio prolifere.<\/p>\n

Guiones paralelos para un mismo argumento <\/strong>
\nM\u00e1s que enfoques contrapuestos, la metagen\u00f3mica hay que verla como complementaria a la microbiolog\u00eda molecular y a la celular que respectivamente nos informan del funcionamiento de una bacteria y de c\u00f3mo se comporta en su interacci\u00f3n con las c\u00e9lulas humanas. Ser\u00eda deseable que no se redujesen los esfuerzos de investigaci\u00f3n, y por consiguiente de financiaci\u00f3n, de los proyectos que podr\u00edamos llamar intensivos, los que estudian un proceso de un organismo en todo su detalle, para favorecer a los proyectos, como el del microbioma, extensivos. Siempre es peligroso favorecer en demas\u00eda lo que en un momento se pone de moda, y en estos temas creo que es preciso la cooperaci\u00f3n entre ambos enfoques si se quiere obtener el m\u00e1ximo rendimiento. El objetivo final en todos los casos es conservar la salud.<\/p>\n

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autor: Miguel Vicente Es sabido, desde ya hace mucho, que de cada diez c\u00e9lulas que llevamos en el cuerpo tan s\u00f3lo una es humana, las otras nueve son microbios de diverso tipo. Para ellos nuestro cuerpo es su casa e intentan vivir en armon\u00eda desde la piel hasta en el intestino. Hace unos d\u00edas se ha anunciado la formaci\u00f3n de un consorcio mundial de grupos de investigaci\u00f3n cuyo objetivo es identificar los microbios que habitan en el ser humano mediante la secuenciaci\u00f3n de sus ADNs. Muchos, si no la mayor parte de ellos no se han podido cultivar por lo\u2026<\/p>\n","protected":false},"author":87,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"ngg_post_thumbnail":0},"categories":[256,250,31,252],"tags":[862,46171],"blocksy_meta":{"styles_descriptor":{"styles":{"desktop":"","tablet":"","mobile":""},"google_fonts":[],"version":4}},"aioseo_notices":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/105010"}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/wp-json\/wp\/v2\/users\/87"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=105010"}],"version-history":[{"count":2,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/105010\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":130555,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/105010\/revisions\/130555"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=105010"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=105010"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=105010"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}