{"id":131392,"date":"2013-11-30T19:03:42","date_gmt":"2013-11-30T18:03:42","guid":{"rendered":"http:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/2013\/11\/30\/131392"},"modified":"2013-11-30T19:03:42","modified_gmt":"2013-11-30T18:03:42","slug":"aprender-a-leer-el-genoma-fred-sanger","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/2013\/11\/30\/131392","title":{"rendered":"Aprender a leer el genoma: Fred Sanger"},"content":{"rendered":"

Fred Sanger falleci\u00f3<\/a> a los 95 a\u00f1os el pasado martes 19 de noviembre. Sus obituarios destacan que obtuvo dos premios Nobel. Prefiero decir que es sin duda una de las personas que m\u00e1s ha hecho por la salud y el bienestar de la humanidad.<\/strong> Sanger dise\u00f1\u00f3 primero procedimientos para obtener la secuencia de los amino\u00e1cidos que componen las prote\u00ednas y los utiliz\u00f3 para definir la estructura de la insulina, por ello, a los cuarenta a\u00f1os, obtuvo el Nobel en Qu\u00edmica<\/a> en 1958. Conocer en detalle la estructura de la insulina permiti\u00f3, antes de que se extendiesen las t\u00e9cnicas de Ingenier\u00eda Gen\u00e9tica, que la empresa Novo modificase la insulina porcina para inyectarla en los enfermos de diabetes sin que produjese efectos adversos. Para ello fue crucial el saber que solo se diferenciaban en un amino\u00e1cido.<\/p>\n

  \"Frederick-Sanger-620x330\"<\/a><\/p>\n

Fred Sanger.<\/strong> A su izquierda est\u00e1 montado un gel de secuenciaci\u00f3n de ADN como los usados para secuenciar en la d\u00e9cada de los 80.<\/span><\/p>\n

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Coment\u00e9 en otro lugar<\/a> c\u00f3mo en el verano de 1972, poco antes de doctorarme, asist\u00ed durante el congreso de la Federaci\u00f3n de Sociedades de Bioqu\u00edmica Europeas en Amsterdam a una conferencia de Charles Weissman, en ese momento la persona que m\u00e1s secuencias de ARN, el material gen\u00e9tico de algunos virus, hab\u00eda descifrado. Weissman iba sacando un largo rosario de cuentas blancas del interior de un bal\u00f3n que utilizaba como modelo del bacteri\u00f3fago Qbeta<\/a>, un virus de la bacteria Escherichia coli<\/em>. Con amplias brazadas iba literalmente sembrando el escenario de uno de los salones del RAI<\/a> con una larga ristra de cuentas, m\u00e1s y m\u00e1s cuentas blancas. De vez en cuando aparec\u00eda un corto trecho de cuentas de colores, las que en esos momentos hab\u00eda identificado como Adenina, Uracilo, Citosina o Guanina. Un alarde de luz y sonido seg\u00fan ca\u00eda el rosario blanco al suelo y aparec\u00edan los colores, nadie le podr\u00e1 negar a Weissman su habilidad como conferenciante. En su totalidad el genoma de Qbeta contiene 4217 bases. Por aqu\u00e9l tiempo parec\u00eda que descifrar la secuencia de un genoma, hasta el m\u00e1s sencillo, era poco menos que ciencia ficci\u00f3n.<\/p>\n

Obtuvo Sanger un segundo Nobel, tambi\u00e9n en Qu\u00edmica, en 1980<\/a>. Esta vez se le premi\u00f3 por dise\u00f1ar un procedimiento para determinar las secuencia de los ADNs con una sencillez y a una velocidad entonces revolucionaria, tanto que tras varias mejoras permiti\u00f3 en poco m\u00e1s de un cuarto de siglo la secuenciaci\u00f3n completa del genoma humano<\/a>. Compet\u00eda por esos a\u00f1os el m\u00e9todo propuesto por Sanger llamado tambi\u00e9n m\u00e9todo \u201cdideoxi\u201d con otro que desarroll\u00f3 Walter Gilbert, tambi\u00e9n premiado con el Nobel junto a Sanger. Parec\u00eda como la liga de f\u00fatbol, los expertos de uno u otro m\u00e9todo lo defend\u00edan casi como seguidores de un equipo. Sin embargo en poco tiempo el m\u00e9todo de Sanger mostr\u00f3 no solo que era m\u00e1s f\u00e1cil de realizar, sino que se pod\u00eda mejorar benefici\u00e1ndose de muchos avances que lo hac\u00edan m\u00e1s r\u00e1pido y menos peligroso. Uno de ellos fue el prescindir de compuestos radiactivos para detectar los productos de las reacciones necesarias para averiguar la secuencia.<\/p>\n

En cualquier caso el secuenciar un fragmento de ADN todav\u00eda era en la d\u00e9cada de los ochenta una tarea ardua, se necesitaban grandes geles para separar los fragmentos de diferente tama\u00f1o, cada uno de una base m\u00e1s, que indicaban si su final era Adenina, Timina, Citosina o Guanina y que permit\u00edan recomponer la composici\u00f3n y el orden de la secuencia formada por estos cuatro compuestos en el cromosoma del que proced\u00edan. La imagen de los cient\u00edficos recordaba en algunos momentos a la de los cristaleros, iban de una mesa a otra con dos grandes planchas de vidrio sujetas entre s\u00ed con pinzas y entre las que se encontraba una delgada l\u00e1mina de gel de poliacrilamida<\/a>. Al pasar una corriente el\u00e9ctrica por ella se separaban los fragmentos seg\u00fan su tama\u00f1o. Se avanzaba lentamente, unos cientos de bases cada d\u00eda, hab\u00eda que trocear primero el ADN de manera ordenada para luego secuenciar los fragmentos y tras ello colocar las secuencias en el orden correcto, fragmento tras fragmento.<\/p>\n

Secuenciar el genoma humano, que al final se ha visto est\u00e1 formado por unos tres mil millones de pares de bases, parec\u00eda en aquellos a\u00f1os una tarea herc\u00falea. En las reuniones sobre el Genoma que se celebraron en Valencia en 1988 y 1990, cuando ya se hab\u00eda avanzado casi una d\u00e9cada de trabajo en el proyecto Genoma Humano<\/a>, hubo un participante que propuso que, para avanzar m\u00e1s, durante el servicio militar cada recluta secuenciase un fragmento de genoma. Por entonces, aunque en muchos pa\u00edses la mili era obligatoria, todav\u00eda se pod\u00eda uno declarar pacifista sin correr peligro.<\/p>\n

  \"Neanderthal_couple\"<\/a><\/p>\n

Recreaci\u00f3n de una pareja de Neandertales.<\/strong> La secuencia de su genoma<\/span><\/a> difiere poco, un 0,3 %, de la del ser humano actual.<\/span><\/p>\n

Hoy basta con mirar cualquier peri\u00f3dico para enterarse de avances casi cotidianos en la secuenciaci\u00f3n del genoma de fuentes diversas, desde hombres prehist\u00f3ricos<\/a> a olivos monumentales<\/a> y en la investigaci\u00f3n de numerosas enfermedades gen\u00e9ticas. En el futuro pr\u00f3ximo, gracias a la nanotecnolog\u00eda<\/a>, ya se nos anuncian avances que convertir\u00e1n la secuenciaci\u00f3n de un genoma en algo casi rutinario y al alcance de cualquier laboratorio de tama\u00f1o medio, avances que para empezar permitir\u00e1n seguramente hasta diagnosticar las enfermedades hereditarias con m\u00e1s facilidad que una gripe.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Fred Sanger falleci\u00f3 a los 95 a\u00f1os el pasado martes 19 de noviembre. Sus obituarios destacan que obtuvo dos premios Nobel. Prefiero decir que es sin duda una de las personas que m\u00e1s ha hecho por la salud y el bienestar de la humanidad. Sanger dise\u00f1\u00f3 primero procedimientos para obtener la secuencia de los amino\u00e1cidos que componen las prote\u00ednas y los utiliz\u00f3 para definir la estructura de la insulina, por ello, a los cuarenta a\u00f1os, obtuvo el Nobel en Qu\u00edmica en 1958. Conocer en detalle la estructura de la insulina permiti\u00f3, antes de que se extendiesen las t\u00e9cnicas de Ingenier\u00eda\u2026<\/p>\n","protected":false},"author":87,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"ngg_post_thumbnail":0},"categories":[35309,11243,35312],"tags":[],"blocksy_meta":{"styles_descriptor":{"styles":{"desktop":"","tablet":"","mobile":""},"google_fonts":[],"version":4}},"aioseo_notices":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/131392"}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/wp-json\/wp\/v2\/users\/87"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=131392"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/131392\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=131392"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=131392"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=131392"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}