{"id":131639,"date":"2016-07-10T19:54:08","date_gmt":"2016-07-10T18:54:08","guid":{"rendered":"http:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/?p=131639"},"modified":"2016-07-11T15:40:28","modified_gmt":"2016-07-11T14:40:28","slug":"dando-el-sorpasso-a-escherichia-coli-vibrio-natriegens-como-nuevo-modelo","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/2016\/07\/10\/131639","title":{"rendered":"\u00bfDando el sorpasso a Escherichia coli? Vibrio natriegens como nuevo modelo."},"content":{"rendered":"<p style=\"text-align: justify;\"><strong><em>Escherichia coli<\/em> no solo habita normalmente en nuestro intestino, la descripci\u00f3n de sus propiedades ocupa multitud de p\u00e1ginas de trabajos cient\u00edficos, y su estudio ha servido para que se concedieran una docena de premios Nobel.<\/strong> Avances tan importantes como la manipulaci\u00f3n gen\u00e9tica en el tubo de ensayo no se podr\u00edan haber realizado sin su participaci\u00f3n. Un descubrimiento por el que se merecer\u00eda se le dedicase una plaza en cada aldea. \u00bfLe ha llegado a<em> E. coli<\/em>, como se abrevia su nombre, la hora de jubilarse? Esto es lo que aventura un grupo de investigadores de Boston. En su lugar abogan por encumbrar a la cima del Olimpo de la Microbiolog\u00eda Molecular a <em>Vibrio natriegens<\/em>, casi una desconocida.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">\u00a0<a href=\"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/files\/2016\/07\/1-vibrio-natriegens.jpg\"><img decoding=\"async\" class=\"alignnone  wp-image-131640\" title=\"1-vibrio-natriegens\" src=\"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/files\/2016\/07\/1-vibrio-natriegens-300x300.jpg\" alt=\"\" width=\"500\" height=\"500\" srcset=\"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/files\/2016\/07\/1-vibrio-natriegens-300x300.jpg 300w, https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/files\/2016\/07\/1-vibrio-natriegens-150x150.jpg 150w, https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/files\/2016\/07\/1-vibrio-natriegens.jpg 334w\" sizes=\"(max-width: 500px) 100vw, 500px\" \/><\/a><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #993366;\"><strong>Una imagen art\u00edstica de <em>Vibrio natriegens<\/em>.<\/strong> Fuente: <a href=\"http:\/\/america.pink\/vibrio-natriegens_4659283.html\" target=\"_blank\"><span style=\"color: #993366;\">enlace<\/span><\/a>.<\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><!--more-->\u00a0\u00bfPor qu\u00e9 <em>V. natriegens<\/em>? La respuesta es sencilla y simple, por las prisas. <em>V. natriegens<\/em> utiliza la estrategia de la casa del pobre, mejor reventar antes que sobre, pero lo hace a la inversa. Es una bacteria que por estar adaptada a los estuarios necesita vivir en agua salada y si no tiene la concentraci\u00f3n de sal que precisa estalla, pero si encuentra las condiciones ambientales adecuadas puede propagarse con tiempos de duplicaci\u00f3n algo menores de 10 minutos. Por eso su uso podr\u00eda acortar la duraci\u00f3n de numerosos procedimientos de aislamiento y manipulaci\u00f3n de ADN en el tubo de ensayo. Tambi\u00e9n puede crecer utilizando la sacarosa como fuente de carbono, una alternativa m\u00e1s barata a la glucosa que precisa <em>E. coli<\/em>, bacteria cuyo crecimiento en condiciones \u00f3ptimas es algo m\u00e1s lento.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">A m\u00ed los datos que da este trabajo para el crecimiento de <em>E. coli<\/em>, 30 minutos de tiempo de duplicaci\u00f3n, no acaban de encajarme. En mi experiencia, cuando no contienen muchas mutaciones, las estirpes de <em>E. coli<\/em> que manejamos en el laboratorio se duplican cada 20 minutos en condiciones \u00f3ptimas de nutrientes, aireaci\u00f3n y temperatura. De todas formas hay que reconocer que\u00a0<em>V. natriegens<\/em> va m\u00e1s acelerada, y los autores del trabajo que comento se han dedicado a proporcionar los datos y las herramientas que pueden facilitar su utilizaci\u00f3n en el laboratorio.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Lo fundamental es que han obtenido la secuencia completa de su genoma. algo que, cuando se dispone de suficiente dinero, la tecnolog\u00eda actual permite hacer como si fuese coser y cantar. Tambi\u00e9n han puesto a punto el procedimiento de introducirle ADN por medio de un pl\u00e1smido que porta un gen que confiere resistencia para un antibi\u00f3tico, por lo que se puede seleccionar a\u00f1adiendo ese antibi\u00f3tico, y desde el que a la vez se produce una prote\u00edna fluorescente verde. Un vector lanzadera lo han construido combinado el origen de replicaci\u00f3n de un bacteri\u00f3fago de <em>Vibrio cholerae<\/em> (el bacilo del c\u00f3lera) con el origen de R6k, un pl\u00e1smido de <em>E. coli<\/em>.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Ya con estas herramientas han mutagenizado el genoma de <em>V. natriegens<\/em> utilizando la inactivaci\u00f3n g\u00e9nica por inserci\u00f3n, es decir interrumpiendo la secuencia de los genes integr\u00e1ndoles un elemento gen\u00e9tico m\u00f3vil y tambi\u00e9n por medio de la novedosa t\u00e9cnica <a href=\"http:\/\/www.the-scientist.com\/?articles.view\/articleNo\/45549\/title\/CRISPRi-Controlled-Gene-Expression\/\" target=\"_blank\">CRISPRi de edici\u00f3n de genes<\/a>, \u00a0que usando los ARNs de interferencia tiene mayor potencia que el famoso sistema CRISPR\/Cas9\u00a0para eliminar la expresi\u00f3n de los genes que se desee.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Por \u00faltimo han evaluado los aspectos de seguridad biol\u00f3gica de <em>V. natriegens<\/em> no encontrando genes que puedas codificar toxinas por lo que puede considerarse carente de riesgos biol\u00f3gicos, lo que facilita su manipulaci\u00f3n rutinaria en laboratorios sin medidas especiales de seguridad.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">\u00bfQuiere todo esto decir que vamos a abandonar a <em>E. coli<\/em>, nuestra fiel amiga de toda la vida? Yo creo que no, porque lo que sabemos sobre su vida y milagros no se puede repetir con otra bacteria de la noche a la ma\u00f1ana.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><a href=\"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/files\/2016\/07\/Slide121.jpg\"><img decoding=\"async\" class=\"alignnone  wp-image-131642\" title=\"Slide12\" src=\"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/files\/2016\/07\/Slide121-1024x767.jpg\" alt=\"\" width=\"524\" height=\"393\" srcset=\"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/files\/2016\/07\/Slide121-1024x767.jpg 1024w, https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/files\/2016\/07\/Slide121-300x224.jpg 300w\" sizes=\"(max-width: 524px) 100vw, 524px\" \/><\/a><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><strong><span style=\"color: #993366;\">Descubrimientos que han merecido un premio Nobel y que tuvieron a <em>E. coli<\/em> como protagonista.<\/span><\/strong><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Pero para ser justos con <em>V. natriegens<\/em> no es en realidad una advenediza, antes se la conoc\u00eda como <em>Pseudomonas natriegens<\/em> y ya en 1962 Robert Eagon hab\u00eda publicado que en un medio de cultivo conteniendo extracto de coraz\u00f3n y cerebro y un 1.5% de sal se duplica cada 9,8 minutos. El profesor Robert Garfield Eagon estuvo a cargo de redactar las actualizaciones anuales de Microbiolog\u00eda en el libro del a\u00f1o de la Enciclopedia Brit\u00e1nica, y tuve el honor de conocerle y de que me invitase a comer hace treinta a\u00f1os en una visita a la Universidad de Georgia en Athens, (<a href=\"https:\/\/en.wikipedia.org\/wiki\/Athens,_Georgia#Notable_people\" target=\"_blank\">la ciudad de<\/a> Kim Basinger y del grupo R.E.M.).<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><a href=\"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/files\/2016\/07\/image5661c3bb2991a5.99404946.jpg\"><img decoding=\"async\" class=\"alignnone  wp-image-131643\" title=\"image5661c3bb2991a5.99404946\" src=\"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/files\/2016\/07\/image5661c3bb2991a5.99404946.jpg\" alt=\"\" width=\"492\" height=\"327\" srcset=\"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/files\/2016\/07\/image5661c3bb2991a5.99404946.jpg 615w, https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/files\/2016\/07\/image5661c3bb2991a5.99404946-300x199.jpg 300w\" sizes=\"(max-width: 492px) 100vw, 492px\" \/><\/a><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><strong><span style=\"color: #993366;\">Mickey Rourke y Kim Basinger, dos s\u00edmbolos er\u00f3ticos en la pel\u00edcula \u201cNueve semanas y media\u201d<\/span><\/strong>. <span style=\"color: #993366;\">Fuente: <a href=\"http:\/\/www.losandes.com.ar\/article\/el-tiempo-pasa-asi-estan-hoy-los-protagonistas-de-9-semanas-y-media\" target=\"_blank\"><span style=\"color: #993366;\">enlace<\/span><\/a>.<\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><span style=\"color: #993366;\"><strong>REFERENCIAS:<\/strong><\/span><\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><a href=\"http:\/\/biorxiv.org\/content\/biorxiv\/early\/2016\/06\/12\/058487.full.pdf\" target=\"_blank\">Lee <em>et al<\/em>. 2016<\/a> doi: http:\/\/dx.doi.org\/10.1101\/058487.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">R. G. Eagon 1962.<a href=\"http:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pmc\/articles\/PMC279347\/pdf\/jbacter00467-0058.pdf\" target=\"_blank\"> <em>J Bacteriol.<\/em> <strong>83<\/strong>: 736\u2013737<\/a>.<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\">Blog del d\u00eda en notiweb 11 de julio de 2016<\/p>\n<p style=\"text-align: justify;\"><a href=\"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/files\/2016\/07\/logo_notiweb3.jpg\"><img decoding=\"async\" class=\"alignnone  wp-image-131660\" title=\"logo_notiweb3\" src=\"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/files\/2016\/07\/logo_notiweb3.jpg\" alt=\"\" width=\"315\" height=\"53\" srcset=\"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/files\/2016\/07\/logo_notiweb3.jpg 492w, https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/microbiologia\/files\/2016\/07\/logo_notiweb3-300x50.jpg 300w\" sizes=\"(max-width: 315px) 100vw, 315px\" \/><\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Escherichia coli no solo habita normalmente en nuestro intestino, la descripci\u00f3n de sus propiedades ocupa multitud de p\u00e1ginas de trabajos cient\u00edficos, y su estudio ha servido para que se concedieran una docena de premios Nobel. 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