{"id":114641,"date":"2009-03-17T08:49:00","date_gmt":"2009-03-17T08:49:00","guid":{"rendered":"http:\/\/weblogs.madrimasd.org\/\/universo\/archive\/2009\/03\/17\/114641.aspx"},"modified":"2010-01-22T03:51:21","modified_gmt":"2010-01-22T02:51:21","slug":"los-microbios-del-suelo-nuestros-esclavos-desconocidos-ii","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/2009\/03\/17\/114641","title":{"rendered":"Los Microbios del suelo, Nuestros Esclavos Desconocidos II"},"content":{"rendered":"

R\u00e9gulo Le\u00f3n-Arteta<\/o:p><\/SPAN><\/I><\/B><\/P>

Bacterias      <\/SPAN><\/o:p><\/SPAN><\/B><\/P>

Las bacterias, junto con las arqueas, son los organismos m\u00e1s peque\u00f1os y numerosos que viven libremente en el suelo<\/SPAN><\/B>. Sus actividades autotr\u00f3ficas y heterotr\u00f3ficas sobrepasan en relevancia a las de los dem\u00e1s seres vivientes<\/SPAN><\/B> del medio ed\u00e1fico, y aunque las descubrimos hace algunos siglos, como lo sentenci\u00f3 S\u00f3crates, es m\u00e1s lo que ignoramos que lo que conocemos. As\u00ed, estos microorganismos los clasificamos como eubacterias y archaea, siendo al parecer m\u00e1s numerosas y activas las primeras que la segundas en el suelo. Su poblaci\u00f3n var\u00eda de <\/SPAN><\/B><\/SPAN>106<\/SUP> a<\/SPAN><\/B><\/st1:metricconverter> 1010<\/SUP> por gr. De suelo, mientras su peso alcanza en un suelo agr\u00edcola los <\/SPAN><\/B>4,500 Kg<\/SPAN><\/B><\/st1:metricconverter> ha-1<\/SUP>. <\/SPAN><\/B>Se desarrollan muy bien entre un amplio rango de pH, que va de de <\/SPAN>4 a<\/SPAN><\/st1:metricconverter> 10. Las Eubacteriales m\u00e1s abundantes son peque\u00f1os bastones cocoides, de morfolog\u00eda variable incluidos en<\/SPAN><\/B> el g\u00e9nero Arthrobacter<\/I>, Familia Corynebacteriaceae<\/I> y el g\u00e9nero Cellulomonas<\/I>,  <\/SPAN>que descompone a la celulosa<\/SPAN><\/B>. Los bacilos esporulados constituyen el 25% del total, Clark (1979).<\/o:p><\/SPAN><\/P>

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Otras bacterias <\/SPAN><\/B>que desempe\u00f1an un papel importante en la circulaci\u00f3n de nutrimentos como el nitr\u00f3geno, son<\/SPAN><\/B> las pertenecientes al g\u00e9nero Azotobacter, <\/I>cuya imagen mostramos en el post anterior<\/FONT><\/A>, <\/I>si bien su contribuci\u00f3n al total de la poblaci\u00f3n bacteriana no suele sobrepasar el 1%<\/SPAN>. Sum\u00e1ndolas a las contribuciones de los taxa Agrobacterium, Nitrosomonas, Nitrobacter, Rhizobium, Pseudomonas <\/I>y Achromobacter <\/I>no exceden m\u00e1s del diez por ciento. Otras como<\/SPAN><\/B> <\/SPAN>Thiobacillus thioxidans <\/SPAN><\/I>es capaz de oxidar azufre y su pH \u00f3ptimo es 2.5<\/SPAN><\/B> (Waksman y Joffe, 1922).<\/o:p><\/SPAN><\/P>

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Thiobacillus thioxidans <\/SPAN><\/I>Fuente:<\/B><\/SPAN> <\/SPAN><\/B>usuarios.lycos.es<\/SPAN><\/B><\/o:p><\/SPAN><\/B><\/P>

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 <\/SPAN>Sin embargo, algunas especies de Pseudomonas<\/I> se encuentran involucradas en la descomposici\u00f3n de la celulosa, hemicelulosas, lignina, sustancias p\u00e9cticas, polis\u00e1caridos, hidrocarburos, prote\u00ednas, urea, inmovilizaci\u00f3n del f\u00f3sforo org\u00e1nico, oxidaci\u00f3n del azufre, formaci\u00f3n de compuestos org\u00e1nicos de fierro, reducci\u00f3n del hierro, movilizaci\u00f3n del potasio, oxidaci\u00f3n y reducci\u00f3n del manganeso y metabolismo del mercurio<\/SPAN><\/B>. Las bacterias tambi\u00e9n han jugado un papel importante <\/SPAN><\/B>en la formaci\u00f3n de agregados estables<\/SPAN><\/B>, la cual puede ser inducida por el papel cementante de los  <\/SPAN>polisac\u00e1ridos que desprenden al suelo<\/SPAN><\/B>. Entre ellas sobresale Bacillus polymyxa<\/I>, seg\u00fan van Veen y Heijnen (1994). <\/o:p><\/SPAN><\/P>

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Pseudomonas putida;<\/SPAN><\/I> <\/SPAN>Fuente: <\/o:p><\/I><\/SPAN><\/P>

www.microbelibrary.org\/asmonly\/details.asp?id<\/FONT><\/A><\/SPAN><\/B><\/o:p><\/SPAN><\/B><\/P>

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Aunque Winogradsky<\/SPAN><\/B><\/SPAN> comenz\u00f3 identificando y clasificando <\/SPAN>los g\u00e9neros Aerobacter<\/I> y Azotobacter,<\/U><\/I> actualmente para llevar a cabo la rutina establecida por \u00e9l y muchos de sus seguidores padecen serias dificultades con vistas a identificar su <\/SPAN>enorme diversidad taxon\u00f3mica<\/SPAN><\/B>. M\u00e1s a\u00fan, muchas especies no prosperan in vitro (es decir en condiciones de laboratorio) por lo que no pueden ser identificadas. Parece como si su biodiversidad fuera casi ilimitada.<\/o:p><\/SPAN><\/P>

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Azotobacter<\/SPAN><\/I>, bacteria fijadora de nitr\u00f3geno y <\/o:p><\/SPAN><\/P>

Aerobacter_aerogenes<\/SPAN><\/I> Fuentes<\/SPAN>:<\/SPAN> sigma.ontologyportal.org<\/o:p><\/SPAN><\/B><\/P>

y www.biofarmag.com.au\/root.gif<\/SPAN><\/SPAN><\/B><\/o:p><\/SPAN><\/B><\/P>

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Tambi\u00e9n son innegables sus otras contribuciones al metabolismo del suelo, entras las que podemos destacar, sin ser exhaustivos las que describiremos a continuaci\u00f3n.<\/o:p><\/SPAN><\/P>

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El descubrimiento de la quimioautotrof\u00eda<\/FONT><\/A>: proceso por el cual los organismos derivan energ\u00eda de un n\u00famero de compuestos inorg\u00e1nicos<\/FONT><\/A> diferentes, obteniendo carbono<\/FONT><\/A> en la forma de CO2<\/SPAN><\/FONT><\/A>. Antes, se supon\u00eda que los organismos aut\u00f3trofos<\/FONT><\/A> obten\u00edan su energ\u00eda solamente de la luz<\/FONT><\/A>, sin sospechar que en tal proceso tambi\u00e9n acaecen numerosas reacciones bioqu\u00edmicas qque afectan a compuestos inorg\u00e1nicos. Winogradski fue uno de los primeros investigadores en entender y descifrar a los<\/SPAN><\/B> microorganismos<\/FONT><\/A> fuera del contexto de la medicina, siendo realmente pionero de la<\/SPAN><\/B> ecolog\u00eda microbiana<\/FONT><\/A> y de la microbiolog\u00eda ambiental<\/FONT><\/A>. La columna de Vinogradski<\/FONT><\/A> permite una fascinante observaci\u00f3n de la ecolog\u00eda de la quimioautotrof\u00eda<\/SPAN><\/B> y de los microbios, demostr\u00e1ndolo en diversas conferencias de microbiolog\u00eda que imparti\u00f3 por el mundo (wikipedia 31-01-2009).<\/SPAN><\/o:p><\/SPAN><\/P>

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Winogradsky (1856-1946). Fuente: <\/SPAN>Sterling Memorial Library<\/FONT><\/SPAN><\/A><\/SPAN><\/o:p><\/SPAN><\/P>

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En la microbiolog\u00eda<\/SPAN><\/B>, y especialmente todo aquello relacionado con el estudio de las bacterias, puede parecer un recurso m\u00e1s novedoso que real, <\/SPAN>la necesidad del acercamiento hol\u00edstico<\/SPAN><\/B>. Tal v<\/SPAN>isi\u00f3n integradora<\/SPAN><\/B> se sustenta en la divisi\u00f3n de los sistemas y la medida de los flujos que ligan los subsistemas que lo componen. Tal perspectiva, a la que podemos denominar <\/SPAN>ecolog\u00eda funcional<\/SPAN><\/B>, resulta m\u00e1s eficaz que el reduccionismo tradicional que ha venido imperando en el an\u00e1lisis de las <\/SPAN>comunidades microbianas del suelo<\/SPAN><\/B>. Una comprensi\u00f3n mejor de las<\/SPAN> relaciones entre la diversidad y las  <\/SPAN>funciones microbianas del suelo<\/SPAN><\/B>, requiere de la misma informaci\u00f3n de las c\u00e9lulas microbianas en la matriz del suelo, Nannipieri et al (2003).<\/o:p><\/SPAN><\/P>

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Si bien<\/SPAN> la determinaci\u00f3n del contenido microbiano de C, N, P y S por t\u00e9cnicas de fumigaci\u00f3n, ha permitido una mejor cuantificaci\u00f3n de la din\u00e1mica de nutrientes en el medio ed\u00e1fico, tambi\u00e9n se requiere de la determinaci\u00f3n de los nuevos reservorios, tales como biomasa microbiana activa<\/SPAN><\/B> con t\u00e9cnicas moleculares. La separaci\u00f3n recientemente 13C- y 12C-DNA, nos debe permitir calcular el reservorio microbiano activo de C. Sin embargo, <\/SPAN>la caracterizaci\u00f3n taxon\u00f3mica y funcional de 13C-DNA nos permite entender los cambios proporcionales en<\/SPAN><\/B> las comunidades microbianas por la adici\u00f3n al suelo del sustratos de carbono (C-sustrato) Nannipieri et al (2003). <\/o:p><\/SPAN><\/P>

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Del conjunto <\/SPAN>de las bacterias que viven en el suelo, menos del 1% son cultivables in vitro<\/SPAN><\/B>, habi\u00e9ndose identificado tan solo <\/SPAN>unas 6,000 especies<\/SPAN><\/B>. Por lo tanto se desconocen todas las dem\u00e1s y como corolario, su autoecolog\u00eda, nutrici\u00f3n y el papel que desempe\u00f1an en el ecosistema suelo. M\u00e1s a\u00fan, <\/SPAN>tampoco sabemos casi nada de las relaciones simbi\u00f3ticas, comensales o parasitarias entre las comunidades microbianas<\/SPAN><\/B>. . Es obvio que tanta laguna en nuestros conocimientos impide el an\u00e1lisis tanto de las redes tr\u00f3ficas y ecol\u00f3gicas, como de su biodiversidad. <\/o:p><\/SPAN><\/P>

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Actualmente, disponemos de herramientas que como la ingenier\u00eda gen\u00e9tica molecular o tecnolog\u00eda del ADN recombinante que nos permiten avanzar m\u00e1s en nuestros conocimientos<\/SPAN><\/B><\/A>. Mediante esta \u00faltima <\/SPAN><\/SPAN>Borneman et al (1996), determinaron en un suelo agr\u00edcola, que el 98.4% de las secuencias del ADNr 16S identificadas del material geon\u00f3mico pertenec\u00edan al dominio Bacteria<\/SPAN><\/B><\/SPAN>; de ellas, 16.1% son Protobacterias, 2.18% del grupo Cytiphaga-Flexibacter-Bacteroides<\/I>, 21.8% del grupo de bacterias Gram + con bajo porcentaje de G+C, 39.4% est\u00e1n en grupos desconocidos dentro del susodicho Dominio Bacteria. En otro estudio, Liles et al (2003), encontraron una baja proporci\u00f3n de Firmicutes<\/I>, a-Protobacterias<\/I> en comparaci\u00f3n con la representaci\u00f3n de las subdivisiones \u00df–<\/I>y ?-Protobacteria<\/I>; y subdivisiones sin representantes cultivables. <\/SPAN><\/SPAN>Dichas herramientas y las comparaciones filogen\u00e9ticas se complementan con el estudio de las propiedades metab\u00f3licas y actividades enzim\u00e1ticas<\/SPAN><\/B><\/SPAN>, seg\u00fan Escalante-Lozada et al (2004). Sin embargo, <\/SPAN><\/SPAN>aun queda mucho por saber, m\u00e1s aun cuando <\/SPAN><\/B><\/SPAN>ni el concepto de especie resulta adecuado para explicar el mundo de los microbios y la transferencia de genes entre taxa distintos es abrumadora. <\/SPAN><\/SPAN><\/o:p><\/SPAN><\/P><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

R\u00e9gulo Le\u00f3n-Arteta Bacterias      Las bacterias, junto con las arqueas, son los organismos m\u00e1s peque\u00f1os y numerosos que viven libremente en el suelo. Sus actividades autotr\u00f3ficas y heterotr\u00f3ficas sobrepasan en relevancia a las de los dem\u00e1s seres vivientes del medio ed\u00e1fico, y aunque las descubrimos hace algunos siglos, como lo sentenci\u00f3 S\u00f3crates, es m\u00e1s lo que ignoramos que lo que conocemos. As\u00ed, estos microorganismos los clasificamos como eubacterias y archaea, siendo al parecer m\u00e1s numerosas y activas las primeras que la segundas en el suelo. Su poblaci\u00f3n var\u00eda de 106 a 1010 por gr. De suelo, mientras su peso alcanza en\u2026<\/p>\n","protected":false},"author":26,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"ngg_post_thumbnail":0},"categories":[596,608],"tags":[],"blocksy_meta":{"styles_descriptor":{"styles":{"desktop":"","tablet":"","mobile":""},"google_fonts":[],"version":4}},"aioseo_notices":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/114641"}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/users\/26"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=114641"}],"version-history":[{"count":2,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/114641\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":134871,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/114641\/revisions\/134871"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=114641"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=114641"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=114641"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}