{"id":137368,"date":"2011-01-04T11:41:59","date_gmt":"2011-01-04T10:41:59","guid":{"rendered":"http:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/?p=137368"},"modified":"2011-01-04T11:43:47","modified_gmt":"2011-01-04T10:43:47","slug":"las-bacterias-del-suelo-y-sus-virus-fagos-estructuracion-de-las-comunidades-microbianas-del-suelo","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/2011\/01\/04\/137368","title":{"rendered":"Las Bacterias del Suelo y sus Virus (Fagos): Estructuraci\u00f3n de las Comunidades Microbianas del Suelo"},"content":{"rendered":"

Como casi todos sab\u00e9is, ni un ser vivo se libra de ser infectado por los virus<\/span><\/strong>. Las bacterias del suelo no son una excepci\u00f3n<\/span>, <\/strong>mientras <\/strong>que <\/strong>los canijos (no siempre malvados, ni mucho menos) se denominan bacteri\u00f3fagos o<\/strong><\/span> simplemente fagos<\/a>. Sabemos poco de ellos, pero se presume que su papel en suelos, aguas incluso en la flora bacteriana humana resulta ser de capital importancia<\/strong>.<\/span> Todo apunta a que constituyen uno de los principales reguladores y estructuradotes de las comunidades microbianas sobre las que se asienta toda la vida (biosfera)<\/strong>.<\/span> Obviamente las bacterias del suelo padecen de otros muchos enemigos que las depredan, como por ejemplo ciertos grupos de nematodos. La noticia de hoy me deja un tanto fr\u00edo aunque sea interesante. Los autores del estudio han demostrado que los fagos de una muestra de suelo infectan u hospedan mejor a estos procariotas que se encuentran a su alrededor que a los que se encuentren en el mismo suelo a 25 cm de distancia. Y de tal hecho concluyen que<\/span><\/strong>: (i)<\/strong><\/span> La evoluci\u00f3n estructura los ecosistemas (diversidad gen\u00e9tica microbiana) a escalas muy detalladas; (ii)<\/strong><\/span> que los fagos controlan las poblaciones bacterianas del suelo; (iii)<\/strong><\/span> que estos virus se adaptan localmente, (iv)<\/span><\/strong> en el caso de que las \u00faltimas tambi\u00e9n se adaptaran a las primeras cabr\u00eda hablar de coevoluci\u00f3n (algo que consideran bastante probable) y (v)<\/span><\/strong> las poblaciones de microorganismos no se distribuyen aleatoriamente. Ufff: demasiadas conclusiones para un simple estudio<\/span><\/strong>. Vayamos por parte. \u00a0<\/p>\n

\u00a0\"fagos-infectando-a-una-bacteria-del-suelo-fuente-campus-william-and-mary-usa\"<\/p>\n

Fagos infectando una bacteria. Fuente: Campus William & Mary USA<\/a><\/p>\n

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\u00a0No resulta ninguna novedad el aserto de que los virus<\/span><\/strong> (en esta caso fagos) atesoran un papel capital en la din\u00e1mica de poblaciones y comunidades microbianas<\/span><\/strong>. Existen muchas referencias bibliogr\u00e1ficas al respecto, aunque la magnitud en cifras, as\u00ed como los mecanismos aun distan de ser conocidos. Eso s\u00ed la direcci\u00f3n de la flecha en la relaci\u00f3n: \u201cevoluci\u00f3n condiciona ecosistemas\u201d es m\u00e1s que discutible \u00bfY porque no al rev\u00e9s, o ambas a la vez?<\/p>\n

\u00a0Veinticinco cent\u00edmetros puede ser una distancia insignificante para el ser humano, pero no as\u00ed si en el caso de los microorganismos<\/span><\/strong>. Aqu\u00ed los autores resbalan estrepitosamente. Un pu\u00f1adito de tierra es una inmensidad espacial ecosist\u00e9mica para \u201cesos peque\u00f1os bichitos<\/a>\u201d, como nos dir\u00edan Miguel Vicente desde el blog que lleva tal nombre<\/span><\/strong>. Se trata de un aserto con un marcado tinte antropom\u00f3rfico. Del mismo modo, parece l\u00f3gico pensar<\/span><\/strong> (tambi\u00e9n se han aportado evidencias en<\/span><\/strong> otros ambientes, como lo son\u00a0las aguas y sedimentos (\u00bfsuelos?) oce\u00e1nicos, que los fagos controlan las comunidades bacterianas<\/strong>. Reitero que soy de la misma opini\u00f3n, aunque se trata de un tema muy amplio que a penas ha comenzado a ser explorado. Hablamos pues de meras evidencias, m\u00e1s que de datos concluyentes<\/span><\/strong> aunque todo apunta a que as\u00ed sea. En el blog de Miguel Vicente se especifica claramente que no deben entenderse a los virus<\/span><\/strong> (tampoco a las bacterias) como meros agentes infecciosos, atesorando otros papeles mucho m\u00e1s relevante en la biosfera<\/span><\/strong>. No abundar\u00e9 sobre el tema. Que virus y bacterias \u201casociadas\u201d, aunque sea por razones de vecindad, co-evolucionen ya que de una u otra manera interactuar\u00e1n en muchos casos<\/span><\/strong> (el vocablo especie resulta m\u00e1s confundente que esclarecedor para el universo microbiano) parece\u00a0l\u00f3gico y presumible. Recordemos el rol de los virus en la transferencia horizontal de genes, entre otros asuntos.<\/p>\n

\u00a0El que los microorganismos, como ninguna otra comunidad biol\u00f3gica, se distribuye aleatoriamente es un asunto archiconocido<\/span><\/strong>, y del que hemos hablado reiteradamente en este post. El patr\u00f3n m\u00e1s rampl\u00f3n (al que suele apelarse en estos casos) recibe el nombre de distribuciones contagiosas<\/a>, pudiendo analizarse estructuras espaciales mucho m\u00e1s precisas y mejor formuladas matem\u00e1ticamente. En el caso del suelo tal ausencia de aleatoriedad es palmaria y se ha demostrado multitud de ocasiones<\/span><\/strong>. No resulta pues una aportaci\u00f3n digna de menci\u00f3n. Sin embargo si lo ser\u00eda su inversa. \u00a1Sin comentarios!<\/p>\n

\u00a0Sin embargo, el hecho de que se constate experimentalmente que los fagos se \u201crelacionan\u201d m\u00e1s estrechamente con sus bacterias vecinas que con las que se encuentran alejadas no deja de tener inter\u00e9s, mostrando<\/strong> la enorme variedad de micro-h\u00e1bitats, biocenosis y ecosistemas que atesora un suelo (terrestre y marino) a nivel centim\u00e9trico<\/strong><\/span>. El suelo es un medio poroso heterog\u00e9neo muy complejo, pudiendo albergar un universo de organismos en tal solo 1 cm3<\/sup>. De ah\u00ed la gran biodiversidad que alberga de esos bichitos peque\u00f1os.<\/p>\n

\u00a0Juan Jos\u00e9 Ib\u00e1\u00f1ez \u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0<\/span>\u00a0\u00a0\u00a0<\/strong><\/p>\n

\u00a0<\/p>\n

Evolutionary Arms Race Between Bacteria and Their Viruses in Soil<\/a><\/strong><\/strong><\/p>\n

\u00a0ScienceDaily (<\/strong>Dec. 1, 2009<\/strong>)<\/strong><\/span> \u2014 Viruses of soil bacteria (phages) evolve to improve their ability to infect the bacterial hosts that surround them<\/strong>. This is shown in a new study by Dutch researcher Michiel Vos, published in the journal Science. Phages appear to be better able to infect bacteria from the same small soil sample than bacteria from just a few centimetres away. Evolution can therefore restructure ecosystems on a very small scale<\/strong>.<\/p>\n

\u00a0Working at the University of Oxford, Michiel Vos took 5 lots of 5 samples from an area of soil measuring 25cm by 25cm. <\/strong>From each sample, he isolated Stenotrophomonas bacteria and their associated phages. Phages infect bacteria, proliferate, burst out of the cell and then go on to infect new bacteria. More than a third of the bacteria were found to be sensitive to infection by phages from the same area of soil. Phages can therefore markedly control populations of soil bacteria<\/strong>.<\/p>\n

\u00a0Vos went on to investigate whether the phages were better at infecting their surrounding bacteria than bacteria from a few centimetres (further) away. This turned out to be the case: phages were better at infecting bacteria from the same soil sample than those from other soil samples. In the language of evolutionary ecologists, the phages are ‘locally adapted’. Whether the bacteria in turn adapted to the phages (co-evolution) was not investigated in the experiment, but this is quite likely<\/strong>.<\/p>\n

\u00a0This study demonstrates the importance of interactions between different types of soil microbes in structuring of biodiversity. <\/strong>While microorganisms in the soil are tremendously abundant and diverse, and are key to ecosystem functioning<\/strong>, relatively little is known about them — certainly compared with our knowledge of animals and plants.<\/p>\n

\u00a0The research undertaken by Vos and his colleagues shows that even at a scale of just a few centimetres, populations of microorganisms are not distributed at random. <\/strong>Instead, phages are found alongside the bacteria that they can best infect<\/strong>, by the process of natural selection. This is especially remarkable because tiny and numerous microorganisms could be expected to be easily dispersed, erasing such spatial structure<\/strong>.<\/p>\n

The article on this research was published in Science on 14 August 2009. The research was funded by a Rubicon grant from NWO, which Michiel Vos received in 2006.<\/p>\n

\u00a0Story Source<\/span><\/strong>: The above story is reprinted (with editorial adaptations by ScienceDaily staff) from materials provided by NWO (Netherlands Organization for Scientific Research)<\/a>, via AlphaGalileo<\/a>.<\/p>\n

\u00a0Journal Reference<\/span><\/strong>: Michiel Vos, Philip J. Birkett, Elizabeth Birch, Robert I. Griffiths, and Angus Buckling. Local Adaptation of Bacteriophages to Their Bacterial Hosts in Soil. Science, 2009; 325 (5942): 833 DOI: 10.1126\/science.1174173<\/a><\/p>\n

\u00a0Resumen del trabajo original<\/span><\/strong><\/p>\n

\u00a0Science 14 August 2009<\/strong>: Vol. 325. no. 5942, p. 833., DOI: 10.1126\/science.1174173\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0<\/p>\n

\u00a0Local Adaptation of Bacteriophages to Their Bacterial Hosts in Soil<\/span><\/strong><\/p>\n

Michiel Vos, et al.<\/span><\/strong><\/p>\n

\u00a0Microbes are incredibly abundant and diverse and are key to ecosystem functioning, yet relatively little is known about the ecological and evolutionary mechanisms that shape their distributions<\/strong>. Bacteriophages, viral parasites that lyse their bacterial hosts, exert intense and spatially varying selection pressures on bacteria and vice versa<\/strong>. We measured local adaptation of bacteria and their associated phages in a centimeter-scale soil population. We first demonstrate that a large proportion of bacteria is sensitive to locally occurring phages. We then show that sympatric phages (isolated from the same 2-gram soil samples as the bacteria) are more infective than are phages from samples some distance away. This study demonstrates the importance of biotic interactions for the small-scale spatial structuring of microbial genetic diversity in soil<\/strong>.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Como casi todos sab\u00e9is, ni un ser vivo se libra de ser infectado por los virus. Las bacterias del suelo no son una excepci\u00f3n, mientras que los canijos (no siempre malvados, ni mucho menos) se denominan bacteri\u00f3fagos o simplemente fagos. Sabemos poco de ellos, pero se presume que su papel en suelos, aguas incluso en la flora bacteriana humana resulta ser de capital importancia. Todo apunta a que constituyen uno de los principales reguladores y estructuradotes de las comunidades microbianas sobre las que se asienta toda la vida (biosfera). Obviamente las bacterias del suelo padecen de otros muchos enemigos que\u2026<\/p>\n","protected":false},"author":26,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"ngg_post_thumbnail":0},"categories":[596,590,615],"tags":[],"blocksy_meta":{"styles_descriptor":{"styles":{"desktop":"","tablet":"","mobile":""},"google_fonts":[],"version":4}},"aioseo_notices":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/137368"}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/users\/26"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=137368"}],"version-history":[{"count":8,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/137368\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":137855,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/137368\/revisions\/137855"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=137368"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=137368"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=137368"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}