{"id":142869,"date":"2013-05-07T12:49:14","date_gmt":"2013-05-07T11:49:14","guid":{"rendered":"http:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/?p=142869"},"modified":"2013-05-07T12:49:14","modified_gmt":"2013-05-07T11:49:14","slug":"comunidades-microbianas-del-suelo-huellas-dactilares-y-potencial-descontaminante","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/2013\/05\/07\/142869","title":{"rendered":"Comunidades Microbianas del Suelo: Huellas Dactilares y Potencial Descontaminante"},"content":{"rendered":"

Las comunidades microbianas de los suelos<\/strong><\/span>, as\u00ed como su fauna de peque\u00f1os bichitos ha metabolizado y degradado durante cientos de millones de a\u00f1os todo lo que ha ido deposit\u00e1ndose sobre los mismos por la biomasa, aunque tambi\u00e9n mediante otros procesos naturales de naturaleza abi\u00f3tica. Con independencia de que se denomine a los recursos ed\u00e1ficos como biomanto<\/a>, ente vivo<\/span>, \u00a0<\/a><\/strong>reactor<\/a>, etc., o peor aun, que se le atribuyan funciones<\/a> (este \u00faltimo vocablo ineludiblemente implica\u00a0intencionalidad que estos bichitos no atesoran), el sistema ed\u00e1fico resulta ser\u00a0el aparato metab\u00f3lico de Gaia por antonomasia<\/strong>,<\/span><\/span>si entendemos tambi\u00e9n como suelos los sedimentos marinos<\/a>. Una biodiversidad incalculable de formas vivas<\/strong><\/span>, cuyo papel en los ecosistemas ed\u00e1ficos aun es escasamente conocida, llevan a cabo tales procesos<\/strong><\/span>. \u00bfSe imaginan ustedes su cuerpo sin estomago e intestinos? \u00bfVerdad que no? Pues esta es justamente una de las analog\u00edas m\u00e1s apropiadas que podemos ofrecer con vistas a que se entienda la vital importancia de la edafosfera en la biosfera. La noticia que os vamos a ofrecer hoy posee dos aristas, una positiva y otra negativa<\/span><\/strong>. La primera deviene de lo que \u201cpersonalmente\u201d considero un buen uso de la biotecnolog\u00eda<\/strong><\/span>. Por el contrario, la segunda genera falsas expectativas<\/strong> <\/span>al propiciar que el ciudadano crea que los expertos conocemos, en buena medida, todos los seres, compuestos y procesos implicados en el metabolismo del suelo. La biotecnolog\u00eda no implica exclusivamente tocar los genes de todo lo natural y sobrenatural. Y el contenido de la nota de prensa as\u00ed lo atestigua. Por su parte, el potencial de la base de datos<\/strong> <\/span>que los autores dicen haber obtenido no deja de ser pretenciosa, ya que aun sabemos muy poco para predecir todos los mecanismos y procesos biogeoqu\u00edmicos que acaecen en el seno del suelo<\/strong><\/span>. Como casi siempre, advertimos que nuestras cr\u00edticas van dirigidas contra el texto de la nota de prensa, no al art\u00edculo original de los autores, cuyo contenido exacto descocemos. El estudio informa de que se ha elaborado una base de datos con \u201ctoda\u201d la informaci\u00f3n disponible de las encimas del suelo y los organismos que las producen<\/strong><\/span>. Empero reitero que, sabemos muy poco, por mucho que ciertos investigadores se empecinen obstinadamente en vender lo contrario. \u00a0Seguidamente se defiende que\u00a0tal modo de proceder permite obtener una huella dactilar de cada uno de los ecosistemas-suelo<\/strong> <\/span>de la superficie terrestre. Mediante esta, los investigadores alegan poder predecir el potencial descontaminador de cada suelo<\/span><\/strong> (biorremedaci\u00f3n<\/a>), aunque a la postre tan solo se mentan vertidos de petr\u00f3leo y \u201cciertos hidrocarburos arom\u00e1ticos\u201d.\u00a0 Vaya por delante que la idea me parece interesante. Sin embargo, afirmo que no existe, hoy por hoy, manera alguna de obtener huellas dactilares cient\u00edficamente incontestables<\/strong>. Desconocemos la mayor parte de las especies que hay en el suelo. Ignoramos una buena parte de las reacciones qu\u00edmicas que all\u00ed se producen. En consecuencia, no atesoramos de la informaci\u00f3n cient\u00edfica necesaria como para predecir con precisi\u00f3n\u00a0su estructura y din\u00e1mica<\/strong><\/span>. No obstante si nos centramos vertidos de petr\u00f3leo y \u201cciertos hidrocarburos arom\u00e1ticos\u201d quiz\u00e1s la base de datos disponible sea una herramienta interesante a la hora de\u00a0evaluar \u201cinicialmente\u201d el potencial descontaminante en un sitio de tales productos. Cabr\u00eda recordar que, en el medio ed\u00e1fico, las reacciones dependen del tama\u00f1o y forma de los compuestos, pero tambi\u00e9n de otra serie de procesos que conciernen a la estructura del suelo en un momento dado y lugar. En la naturaleza, todo es mucho m\u00e1s complejo de lo que acaece en las condiciones simples y controladas de laboratorio<\/strong><\/span>. Y mientras tanto, la ecolog\u00eda del suelo, clave en todos estos asuntos, sigue sin llamar la atenci\u00f3n de nuestros responsables en materia de pol\u00edtica cient\u00edfica, alrededor de todo el mundo. Si no nos interesamos por avanzar en su conocimiento aportando los recursos humanos y dot\u00e1ndoles de la financiaci\u00f3n y tecnolog\u00eda necesaria, todo lo dem\u00e1s se me antojan cantos de sirena, por mucho que no dude en la buena voluntad de los investigadores. Por desgracia, tocar los genes sigue fascinando a nuestros gestores m\u00e1s que usar los conocimientos biotecnol\u00f3gicos para otros fines, tan interesante como este<\/strong><\/span>. Para terminar me veo obligado a comentar que la ciencia del suelo en el CSIC ha sido paulatinamente desmantelada desde los a\u00f1os 80, mientras que estas investigaciones son llevadas a cabo por expertos de la instituci\u00f3n que, en principio, no deben saber mucho sobre los recursos ed\u00e1ficos. Trabajamos con una mesa a la que le falta m\u00e1s de una pata en un ente p\u00fablico que se autodenomina multidisciplinar. A pesar de todo, debe agradecerse este tipo de estudios, aunque no abrazar sus conclusiones hasta que la tozuda realidad pueda corroborar\/refutar los asertos que m\u00e1s abajo pod\u00e9is leer. Y me temo que (\u2026.)<\/p>\n

\u00a0\"microbias-soil-organisms\"<\/p>\n

Comunidades microbianas del suelo. Fuente: The PIRE Mongolia blog<\/a><\/p>\n

Este tipo de exclamaciones me recuerdan a algunos aspectos que ya comente en un post acerca de las dudosas<\/strong><\/span> profetas de la ciencia<\/a>. Cuando se secuenci\u00f3 el genoma humano se habl\u00f3 de que se hab\u00eda logrado obtener un mapa del genoma, cuando no era cierto<\/strong><\/span>. Una cartograf\u00eda explicita las relaciones espaciales de los elementos inventariados. Una cuesti\u00f3n es atesorar los millones de piezas de un puzle y otra bien distinta ordenarlas correctamente y determinar sus disposiciones espaciales con precisi\u00f3n. Por aqu\u00e9l entonces los expertos pensaban, para mi asombro, que el genoma humano atesoraba muchos genes basura. Hoy se reconoce que aquella \u201cbasura\u201d es esencial para el correcto funcionamiento de lo que no era \u201cbasura\u201d. No se trata de criticar por criticar, sino de ser humildes y no vender gato por liebre<\/strong><\/span>, eso que tanto adoran los plumillas de los medios de comunicaci\u00f3n. \u00a0Los autores del estudio han recopilado \u201calgunas piezas de un puzle\u201d enormemente complejo, constituido por miles o cientos de miles de genomas distintos. Por lo que (\u2026.)\u00a0\u00a0 \u00a1Por favor humildad!<\/p>\n

Juan Jos\u00e9 Ib\u00e1\u00f1ez\u00a0 <\/strong><\/span><\/p>\n

Un sistema predice la capacidad de un suelo para autodescontaminarse<\/strong><\/a> <\/strong><\/h3>\n

Un equipo multidisciplinar de investigadores del<\/strong> Consejo Superior de Investigaciones Cient\u00edficas<\/strong><\/a> (CSIC), la <\/strong>Universidad de Oviedo<\/strong><\/a> y la <\/strong>Universidad de las Islas Baleares<\/strong><\/a> ha desarrollado <\/strong>una plataforma bioinform\u00e1tica <\/strong>que analiza la capacidad de un ecosistema para asimilar cientos de contaminantes. <\/strong><\/p>\n

FUENTE | CSIC<\/a> 30\/08\/2012<\/p>\n

El trabajo, publicado en la revista ISME J<\/a> del grupo Nature<\/em>, abre nuevas perspectivas para determinar la capacidad de autodescontaminaci\u00f3n de un suelo afectado por vertidos como el petr\u00f3leo o ciertos hidrocarburos arom\u00e1ticos, a partir de la secuenciaci\u00f3n del ADN de microorganismos<\/strong>.<\/p>\n

Los cient\u00edficos han elaborado una base de datos espec\u00edfica que re\u00fane <\/strong>toda la informaci\u00f3n disponible hasta el momento sobre las enzimas y los posibles microorganismos que las contienen y que, de forma natural, son capaces de destruir ciertos contaminantes<\/strong>. El sistema permite establecer la huella dactilar de cada ecosistema y<\/strong> predice en qu\u00e9 suelos puede ser m\u00e1s eficaz la biorremediaci\u00f3n, basada en utilizar elementos naturales del propio h\u00e1bitat para revertir la degradaci\u00f3n de un suelo contaminado<\/strong>.<\/p>\n

\u00abLa plataforma explora el material gen\u00f3mico de organismos vivos en busca de informaci\u00f3n sobre reacciones de biodegradaci\u00f3n y ofrece un perfil \u00fanico para cada ecosistema<\/strong>. En otras palabras, da una visi\u00f3n en tiempo real de las capacidades biodegradativas de un ecosistema, y por tanto, de su capacidad para autodescontaminarse<\/strong>\u00ab, explica el investigador del CSIC en el Instituto de Cat\u00e1lisis y Petroleoqu\u00edmica Manuel Ferrer.<\/p>\n

Para monitorizar la presencia o ausencia de estos microorganismos y las propiedades que cada uno posee en suelos con diferentes condiciones, los investigadores han aplicado distintas t\u00e9cnicas de biolog\u00eda de sistemas como la gen\u00f3mica, basada en la secuenciaci\u00f3n del ADN del suelo, la prote\u00f3mica, que supone la secuenciaci\u00f3n de las prote\u00ednas en cada momento del proceso, y la bioestad\u00edstica, que consiste en la sistematizaci\u00f3n y el cruce de datos<\/strong>.<\/p>\n

\u00abCada ecosistema contiene millones de bacterias que a su vez contienen miles de enzimas y evaluar la presencia o ausencia de las mismas es casi imposible si empleamos los m\u00e9todos de an\u00e1lisis gen\u00f3micos convencionales usados hasta la fecha<\/strong>\u00ab, se\u00f1ala Jes\u00fas S\u00e1nchez, investigador del Instituto de Biotecnolog\u00eda de la Universidad de Oviedo.<\/p>\n

UN PROCESO SOSTENIBLE Y M\u00c1S BARATO
\n<\/strong>
\nLas aproximaciones metodol\u00f3gicas seguidas en el trabajo, incluida la base de datos elaborada, supone para los cient\u00edficos \u00abuna oportunidad sin precedentes\u00ab. El estudio ha descubierto tambi\u00e9n que las capacidades metab\u00f3licas de las enzimas y los microorganismos cambian cuando el suelo se somete a distintos tratamientos de limpieza<\/strong>.<\/p>\n

\u00abDe esta forma, podremos diferenciar ecosistemas que podr\u00e1n ser m\u00e1s f\u00e1cilmente descontaminados de aquellos que no<\/strong>, es decir, permitir\u00e1 establecer diferencias en las capacidades descontaminantes y, por tanto, predecir la eficacia de los tratamientos de biorremediaci\u00f3n<\/strong>\u00ab, asegura Ram\u00f3n Rossell\u00f3\u2010Mora, investigador del CSIC en el Instituto Mediterr\u00e1neo de Estudios Avanzados, centro mixto del CSIC y la Universidad de las Islas Baleares.<\/p>\n

Seg\u00fan el investigador del CSIC en el Centro Nacional de Biotecnolog\u00eda Javier Tamames, \u00ablas t\u00e9cnicas de biorremediaci\u00f3n permiten afrontar la descontaminaci\u00f3n de suelos aprovechando el potencial metab\u00f3lico de algunos de sus componentes para la limpieza<\/strong>. Se convierten as\u00ed en una alternativa m\u00e1s sostenible y barata que otros m\u00e9todos para eliminar residuos y contaminantes<\/strong>\u00ab.<\/p>\n

El estudio, resultado de cinco a\u00f1os de trabajo, forma parte de un proyecto Consolider financiado por el Ministerio de Econom\u00eda y Competitividad, que tiene como objetivo estudiar la biodiversidad de poblaciones de distintos h\u00e1bitats dentro de la geograf\u00eda espa\u00f1ola, dos proyectos europeos (MAGICPAH y ULIXES), centrados en la investigaci\u00f3n de la biodiversidad de poblaciones en suelos y ambientes marinos de la geograf\u00eda europea de distintos h\u00e1bitats, y un proyecto CENIT\u201007\u2010CLEAM de la Universidad de Oviedo, dirigido al desarrollo de t\u00e9cnicas innovadoras de biorremediaci\u00f3n y limpieza de suelos contaminados.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Las comunidades microbianas de los suelos, as\u00ed como su fauna de peque\u00f1os bichitos ha metabolizado y degradado durante cientos de millones de a\u00f1os todo lo que ha ido deposit\u00e1ndose sobre los mismos por la biomasa, aunque tambi\u00e9n mediante otros procesos naturales de naturaleza abi\u00f3tica. Con independencia de que se denomine a los recursos ed\u00e1ficos como biomanto, ente vivo, \u00a0reactor, etc., o peor aun, que se le atribuyan funciones (este \u00faltimo vocablo ineludiblemente implica\u00a0intencionalidad que estos bichitos no atesoran), el sistema ed\u00e1fico resulta ser\u00a0el aparato metab\u00f3lico de Gaia por antonomasia,si entendemos tambi\u00e9n como suelos los sedimentos marinos. Una biodiversidad incalculable de\u2026<\/p>\n","protected":false},"author":26,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"ngg_post_thumbnail":0},"categories":[596,594],"tags":[47344,46949,47343,47342],"blocksy_meta":{"styles_descriptor":{"styles":{"desktop":"","tablet":"","mobile":""},"google_fonts":[],"version":4}},"aioseo_notices":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/142869"}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/users\/26"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=142869"}],"version-history":[{"count":7,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/142869\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":144240,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/142869\/revisions\/144240"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=142869"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=142869"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=142869"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}