![\"Metagenoma-virosfera-\"](\"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-content\/blogs.dir\/42\/files\/163\/Metagenoma-virosfera-.jpg\")
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Fuente: Colaje Im\u00e1genes Google<\/span><\/p>\n Ciertamente, cuando m\u00e1s diminutos son los organismos del suelo, m\u00e1s dif\u00edciles nos resulta identificarlos. Pero cuando, adicionalmente habitan ocultos en el seno de los eres vivos la tarea es tit\u00e1nica. Y para a\u00f1adir m\u00e1s le\u00f1a al fuego, gran parte de las bacterias no prosperan en cultivos de laboratorio, por lo que no pueden identificarse, y como corolario, tampoco los virus que albergan. Sabemos de su enorme abundancia, lo cual es l\u00f3gico. Existe una relaci\u00f3n negativa entre el tama\u00f1o de las especies y abundancia de estas<\/strong><\/span>. Por ejemplo, en nuestros cuerpos humanos contenemos m\u00e1s virus que bacterias y estas que c\u00e9lulas humanas<\/strong><\/span>.<\/p>\n Por lo tanto, ha existido una laguna en el conocimiento acerca de la virosfera ed\u00e1fica que comenzamos ahora a desvelar gracias<\/strong> a las t\u00e9cnicas que ahora nos permiten analizar sus<\/span> metagenomas<\/strong> y metatranscriptomas<\/strong><\/span>, extrayendo algunas conclusiones sobre su ecolog\u00eda<\/strong><\/span>. Otra cuesti\u00f3n bien distinta deviene de que, al leer los contenidos que os muestro abajo, unos autores \u00abpretenden\u00bb parecer que n los pioneros desde todos los puntos de vista. Ya hemos editado varios posts que versan sobre virus del suelo<\/span><\/strong> (abajo os dejo una relaci\u00f3n no exhaustiva), por lo que la literatura debe ser \u201cmodestamente extensa\u201d.<\/p>\n Los virus son determinantes en el control de las comunidades microbianas<\/strong><\/span>, por lo que, por pura l\u00f3gica, su papel en el reciclado de nutrientes (ciclos biogeoqu\u00edmicos), as\u00ed como en la estructura y din\u00e1mica del sistema suelo necesariamente debe ser esencial<\/span><\/strong>. Seguidamente os mostramos el material que hemos encontrado y que nos ha llegado principalmente de la denominada \u201cGlobal soil initiative<\/a>\u201d, <\/strong>pero la otra nota nos informa del mismo trabajo. Observareis que los autores generalizan a partir de tres muestras de pasto de los EE.UU., lo cual me parece una temeridad. \u00a1Ser cautos! Sin embargo tambi\u00e9n aportan informaci\u00f3n general de inter\u00e9s, al igual que algunas conjeturas m\u00e1s que temerarias, como<\/strong><\/span> la de que los virus en suelos secos atesoran \u201cgenes especiales\u201d que (\u2026.) \u00a1ser cautos a la hora de aceptar ideas acr\u00edticamente! Con el tiempo y las nuevas tecnolog\u00edas gen\u00f3micas iremos aprendiendo m\u00e1s, poco a poco. Os dejo pues con las noticias.<\/p>\n Juan Jos\u00e9 Ib\u00e1\u00f1ez<\/strong><\/span><\/p>\n Contin\u00faa\u2026\u2026.<\/em><\/span><\/p>\n <\/p>\n Global soil initiative<\/a><\/strong><\/p>\n JANET K. JANSSON, JEFA CIENT\u00cdFICA Y MIEMBRO DE LABORATORIO, DIVISI\u00d3N DE CIENCIAS BIOL\u00d3GICAS, LABORATORIO NACIONAL DEL NOROESTE DEL PAC\u00cdFICO<\/strong><\/p>\n El suelo es un h\u00e1bitat rico para la vida microbiana. Una comunidad muy diversa de microbios del suelo es responsable de muchas de las funciones que est\u00e1n relacionadas con la salud del suelo<\/strong>, incluido el ciclo de nutrientes del suelo y el apoyo al crecimiento de las plantas<\/strong>. Aunque estamos adquiriendo una comprensi\u00f3n cada vez mayor de c\u00f3mo los diferentes microorganismos celulares, como las bacterias y los hongos, contribuyen a las funciones vitales en el medio ambiente del suelo, las funciones llevadas a cabo por los virus del suelo siguen siendo en gran medida un enigma<\/strong>. Esta brecha de conocimiento es desconcertante teniendo en cuenta que los virus del suelo son reguladores clave de las poblaciones microbianas en todos los h\u00e1bitats de la Tierra, desde los oc\u00e9anos hasta los humanos. La raz\u00f3n por la que sabemos tan poco sobre los virus del suelo es que son dif\u00edciles de estudiar en el complejo entorno del suelo<\/strong>. Los virus libres a menudo absorben part\u00edculas del suelo y son dif\u00edciles de extraer. Algunos otros virus que atacan bacterias, o bacteri\u00f3fagos (fagos)<\/strong>, pueden esconderse dentro del genoma del hu\u00e9sped bacteriano<\/strong>. Esta estrategia de vida se conoce como lisogenia y los fagos se conocen como fagos templados<\/strong>. Afortunadamente, nuevas herramientas, como la secuenciaci\u00f3n del genoma completo (metagen\u00f3mica<\/strong>) est\u00e1n comenzando a descubrir las identidades de los virus del suelo. Muchos virus del suelo que se encuentran en los metagenomas del suelo son novedosos y diferentes a todo lo descrito anteriormente<\/strong>.<\/p>\n Los virus del suelo est\u00e1n influenciados por cantidades hist\u00f3ricas de precipitaci\u00f3n, como se muestra al comparar los tipos virales en suelos hist\u00f3ricamente secos, irrigados e hist\u00f3ricamente h\u00famedos. <\/em><\/strong><\/p>\n (Wu et al., 2021: https:\/\/doi.org\/10.1128\/mBio.02595-21<\/strong><\/a>)<\/strong><\/p>\n Curiosamente, las diferencias en el entorno del suelo, como un cambio en la humedad del suelo, pueden influir en los tipos de virus y sus estrategias de vida. Por ejemplo, investigaciones recientes sugieren que a medida que el suelo se vuelve m\u00e1s seco, como se espera que suceda en muchos suelos debido al cambio clim\u00e1tico, hay una transici\u00f3n del fago del suelo para ser lisog\u00e9nico en lugar de lisar a sus hu\u00e9spedes<\/strong>. Este cambio en la estrategia de vida viral tiene implicaciones en c\u00f3mo las poblaciones bacterianas del suelo est\u00e1n reguladas por virus. Por el contrario, cuando los suelos son m\u00e1s h\u00famedos, como en \u00e1reas con cantidades crecientes de precipitaci\u00f3n, muchos virus del suelo se vuelven l\u00edticos y matan a sus hu\u00e9spedes bacterianos<\/strong>. El proceso de lisado de las c\u00e9lulas bacterianas libera su contenido celular de nuevo en el h\u00e1bitat del suelo. Estos contenidos de c\u00e9lulas muertas pueden ser reciclados por otros microorganismos, un proceso conocido como derivaci\u00f3n viral. La derivaci\u00f3n viral mantiene los nutrientes microbianos dentro de la red alimentaria microbiana<\/strong>, en lugar de permitir que los nutrientes sean consumidos por organismos superiores como protozoos, gusanos y planta<\/strong>s. C\u00f3mo la derivaci\u00f3n viral afecta el ciclo del carbono del suelo es un \u00e1rea emocionante de la investigaci\u00f3n actual. Nuestra<\/strong> reciente publicaci\u00f3n<\/a> resume el conocimiento actual sobre la diversidad viral del suelo y c\u00f3mo los virus del suelo pueden verse afectados por el cambio clim\u00e1tico<\/strong>.<\/p>\n Referencia: <\/strong><\/p>\n Jansson, J.K., Wu, R. Diversidad viral del suelo, ecolog\u00eda y cambio clim\u00e1tico. Nat Rev Microbiol<\/em> (2022). https:\/\/doi.org\/10.1038\/s41579-022-00811-z<\/a><\/p>\n Nature Reviews Microbiolog\u00eda<\/em><\/a> volume 21<\/strong>, pages296\u2013311 (2023)Citar este art\u00edculo<\/a><\/p>\n <\/strong>Abstract<\/strong><\/p>\n Los virus del suelo son muy abundantes y tienen un papel importante en la regulaci\u00f3n de la din\u00e1mica del hu\u00e9sped y la ecolog\u00eda del suelo<\/strong>. El cambio clim\u00e1tico est\u00e1 dando lugar a cambios sin precedentes en los ecosistemas del suelo y las formas de vida que residen all\u00ed, incluidos los virus. En esta revisi\u00f3n, exploramos nuestra comprensi\u00f3n actual de la diversidad viral y la ecolog\u00eda del suelo, y discutimos c\u00f3mo el cambio clim\u00e1tico (como eventos de sequ\u00eda prolongada y extrema o m\u00e1s inundaciones y patrones de precipitaci\u00f3n alterados) est\u00e1 influyendo en los virus del suelo<\/strong>. Finalmente, proporcionamos nuestra perspectiva sobre las necesidades futuras de investigaci\u00f3n para comprender mejor c\u00f3mo el cambio clim\u00e1tico afectar\u00e1 la ecolog\u00eda viral del suelo<\/strong>.<\/p>\n El suelo es el h\u00e9roe an\u00f3nimo de nuestras vidas. Proporciona alimento a los cultivos para proporcionarnos alimentos, ofrece drenaje para el agua de lluvia en los acu\u00edferos y es un h\u00e1bitat para una variedad de organismos. <\/p>\n por Sarah Wong, Laboratorio Nacional del Noroeste del Pac\u00edfico<\/strong><\/p>\n A nivel microsc\u00f3pico, el suelo prospera con vida, albergando microbios, como hongos y bacterias, que trabajan en cooperaci\u00f3n con las plantas. A pesar de ser una parte tan importante de nuestras vidas, no se sabe mucho sobre lo que existe exactamente debajo de la superficie de la Tierra.<\/p>\n En una nueva investigaci\u00f3n del Laboratorio Nacional del Noroeste del Pac\u00edfico (PNNL), los cient\u00edficos utilizaron bioinform\u00e1tica y secuenciaci\u00f3n profunda para identificar virus del suelo y comprender mejor sus funciones en la Tierra<\/strong>. La mayor\u00eda de estos virus infectan bacterias y, por lo tanto, se cree que desempe\u00f1an un papel importante en el mantenimiento de las poblaciones microbianas<\/strong>.<\/p>\n \u201cLos virus abundan en la naturaleza\u201d, dijo Janet Jansson, cient\u00edfica jefe de biolog\u00eda y becaria de laboratorio de PNNL. \u201cDebido a que hay tantos de ellos en cada muestra de suelo, identificar diferentes virus se convierte en un desaf\u00edo<\/strong>\u201d.<\/p>\n Jansson trabaj\u00f3 con el cient\u00edfico computacional Ruonan Wu y la cient\u00edfica de la Tierra y l\u00edder del equipo de ciencia del microbioma Kirsten Hofmockel en la Divisi\u00f3n de Ciencias Biol\u00f3gicas de PNNL para enfrentar este desaf\u00edo.<\/p>\n Junto a colaboradores de la Universidad Estatal de Washington; Universidad de Ciencias y Salud de Oreg\u00f3n; Universidad del Estado de Iowa; y EMSL, el Laboratorio de Ciencias Moleculares Ambientales, una instalaci\u00f3n para usuarios de la Oficina de Ciencias del Departamento de Energ\u00eda en PNNL; Los cient\u00edficos del PNNL recolectaron muestras de suelo de pastizales en Washington, Iowa y Kansas y comenzaron una inmersi\u00f3n profunda en la composici\u00f3n del suelo<\/strong>. Aprovecharon las capacidades masivas de secuenciaci\u00f3n de ADN del Instituto Conjunto del Genoma, el poder de c\u00f3mputo del Centro Nacional de Computaci\u00f3n Cient\u00edfica de Investigaci\u00f3n Energ\u00e9tica y la experiencia multi\u00f3mica de EMSL para descubrir virus del suelo previamente desconocidos. Sus resultados fueron publicados en mBio<\/em> y Communications Biology<\/em> .<\/p>\n Diferentes virus para diferentes climas<\/strong>.<\/strong><\/p>\n Los cient\u00edficos eligieron Washington, Iowa y Kansas para sus muestras de suelo porque cada lugar recibe una cantidad diferente de lluvia<\/strong>. El este de Washington es mucho m\u00e1s seco en comparaci\u00f3n con Iowa, mientras que Kansas se encuentra en la encrucijada entre los dos en t\u00e9rminos de humedad del suelo.<\/p>\n \u201cElegimos tomar muestras de lugares con diferentes cantidades de humedad del suelo para ver si esto marcaba una diferencia en los tipos y cantidades de virus all\u00ed<\/strong>\u201d, dijo Wu. \u201cEl suelo m\u00e1s h\u00famedo contiene m\u00e1s bacterias, y muchos virus del suelo infectan a las bacterias<\/strong>\u201d.<\/p>\n Los cient\u00edficos notaron que ciertos virus son mucho m\u00e1s abundantes en suelo seco que en suelo h\u00famedo<\/strong>.<\/p>\n \u201cEn climas m\u00e1s secos, tiende a haber menos microbios, pero m\u00e1s diversos, en el suelo<\/strong>\u201d, dijo Wu. \u201cLa relativa escasez de hu\u00e9spedes bacterianos significa que lo mejor para el virus es mantener vivo al hu\u00e9sped<\/strong>\u201d.<\/p>\n Los investigadores tambi\u00e9n descubrieron que en suelos m\u00e1s secos, era m\u00e1s probable que los virus contuvieran genes especiales que potencialmente podr\u00edan transferir a sus anfitriones bacterianos<\/strong>.<\/p>\n \u201cEstos genes podr\u00edan potencialmente dar a sus anfitriones bacterianos \u2018superpoderes<\/strong>‘\u201d, dijo Jansson. \u201cEstos genes de virus podr\u00edan transmitirse a sus anfitriones bacterianos para ayudarlos a sobrevivir en suelos secos\u201d.<\/p>\n Aunque se necesita m\u00e1s investigaci\u00f3n para comprender mejor el papel de estos genes virales especiales<\/strong>, la posibilidad de que puedan ser \u00fatiles para las bacterias que viven en el suelo es emocionante. Estos genes podr\u00edan ser \u00fatiles para las bacterias al aumentar su capacidad para reciclar el carbono y, por lo tanto, mejorar la salud del suelo<\/strong>.<\/p>\n DOI: 10.1016\/J.Tim.2022.05.003. Epub 2022 26 de mayo.<\/p>\n El Viroma del Suelo<\/strong><\/p>\n Sim\u00f3n Roux<\/a> <\/sup>1<\/sup><\/a>, Joanne B Emerson<\/a> <\/sup>2<\/sup><\/a><\/p>\n Afiliaciones expandir: PMID: 35644779; DOI: 10.1016\/j.tim.2022.05.003<\/a><\/p>\n Abstracto<\/strong><\/p>\n Los virus son miembros clave de los microbiomas de la Tierra, dando forma a la composici\u00f3n y el metabolismo de la comunidad microbiana<\/strong>. Aqu\u00ed, describimos los avances recientes en \u00ab<\/strong>vir\u00f3mica del suelo\u00bb, es decir, an\u00e1lisis de metagenoma y metatranscriptoma <\/strong>centrados en virus que ofrecen ventanas sin precedentes a la virosfera del suelo<\/strong>. Dada la imagen emergente de alta actividad viral, diversidad y din\u00e1mica del suelo en escalas espaciotemporales cortas<\/strong>, luego describimos los procesos ecoevolutivos clave que hipotetizamos que son los principales impulsores de la diversidad de los virus del suelo<\/strong>. Argumentamos que se necesita un esfuerzo comunitario para establecer un \u00abatlas global de la virosfera del suelo<\/strong>\u00bb que pueda usarse para abordar los roles de los virus en los microbiomas del suelo y los ciclos biogeoqu\u00edmicos terrestres a trav\u00e9s de escalas espaciotemporales<\/strong>.<\/p>\n Palabras llave: <\/strong>bacteri\u00f3fagos; metagen\u00f3mica; microbiomas del suelo; virus del suelo; ecolog\u00eda viral; vir\u00f3mica.<\/p>\n La Virosfera, Los Suelos y la Biosfera<\/a><\/p>\n Las Bacterias del Suelo y sus Virus (Fagos): Estructuraci\u00f3n de las Comunidades Microbianas del Suelo<\/a><\/p>\n La R\u00e1pida Coevoluci\u00f3n Bacterias-Virus: Repercusiones Sobre la Estructura de las Comunidades Microbianas del Suelo<\/a><\/p>\n Estimaci\u00f3n de la Virosfera y sus Recorridos Planetarios: \u00bfcuantos virus llueven en un metro cuadrado del suelo diariamente?<\/a><\/p>\nDesenterrando el mundo oculto de los virus del suelo<\/a><\/h3>\n
Diversidad viral del suelo, ecolog\u00eda y cambio clim\u00e1tico<\/strong><\/a><\/h3>\n
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Cient\u00edficos descubren nuevos virus del suelo<\/strong><\/a><\/h4>\n
Diversidad en la virosfera del suelo: \u00bfhasta el infinito y m\u00e1s all\u00e1?<\/strong><\/a><\/h3>\n
alg\u00fan post precedente<\/strong><\/span><\/h4>\n