{"id":90691,"date":"2008-05-02T08:56:00","date_gmt":"2008-05-02T08:56:00","guid":{"rendered":"http:\/\/weblogs.madrimasd.org\/\/universo\/archive\/2008\/05\/02\/90691.aspx"},"modified":"2010-01-22T03:47:26","modified_gmt":"2010-01-22T02:47:26","slug":"los-microorganismos-del-suelo-y-su-inmensa-diversidad-sobre-bacterias-hongos-arqueas-y-virus","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/2008\/05\/02\/90691","title":{"rendered":"Los Microorganismos del suelo y su Inmensa Diversidad: Sobre Bacterias, Hongos, Arqueas y Virus"},"content":{"rendered":"

Como veremos posteriormente, y ya indicamos en numerosos post, como el que llevaba el t\u00edtulo<\/SPAN> <\/FONT><\/SPAN>\u201c<\/SPAN>Bioprospecci\u00f3n de Suelos<\/FONT><\/A><\/SPAN>\u201d<\/SPAN> <\/SPAN><\/FONT>la biodiversidad que atesora el medio ed\u00e1fico apenas ha sido explorada<\/SPAN> (<\/SPAN>que poco sabemos de el mundo que tenemos bajo nuestros pies)<\/FONT><\/A> <\/FONT><\/SPAN>, en contra de lo que ocurre con la marina y la de ambientes aun mucho m\u00e1s singulares o ex\u00f3ticos. Ya os comentamos tambi\u00e9n los numerosos <\/SPAN>problemas para estimar su biodiversidad <\/FONT><\/A><\/SPAN>. Tambi\u00e9n hemos reiterado que, a falta de tax\u00f3nomos, comienzan a utilizarse <\/SPAN>t\u00e9cnicas gen\u00f3micas y metagen\u00f3micas<\/SPAN>. <\/SPAN>Expusimos nuestras reservas<\/SPAN> a la hora de hacer uso de la<\/SPAN> <\/FONT>gen\u00f3mica, <\/FONT><\/A><\/SPAN> <\/SPAN>ya que <\/SPAN>no se debe jam\u00e1s confundir la riqueza y abundancia de especies con un <\/SPAN>c\u00f3digo de barras gen\u00e9tico<\/FONT><\/A>. <\/FONT><\/SPAN>Ahora bien<\/SPAN>, cuando no se quiere vender mala ciencia y se aceptan las limitaciones de estas metodolog\u00edas, <\/SPAN>los resultados que pueden aportar son sumamente importantes, y tanto m\u00e1s cuando<\/SPAN> no hay otros medios, o intereses pol\u00edtico-cient\u00edficos, como para iniciar estudios m\u00e1s profundos de naturaleza taxon\u00f3mica. Este es el caso de una noticia aparecida en <\/SPAN> <\/FONT><\/SPAN><\/SPAN>Sciencedaily<\/SPAN>,<\/SPAN> <\/SPAN>y que llevaba por t\u00edtulo: \u201c<\/SPAN>New Study Suggests Many Unknown Microbes in Soil<\/SPAN><\/A><\/SPAN>\u201d (<\/SPAN>\u201cNuevos Estudios sugieren que el suelo alberga muchos microbios desconocidos\u201d<\/SPAN>). La verdad es que este \u00faltimo es, por lo que os hemos contado, <\/SPAN>un elogio a la trivialidad<\/SPAN>. Pero no ocurre lo mismo con la noticia en s\u00ed, que reproducimos al final del texto en suahili. <\/o:p><\/SPAN><\/H1>

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Arqueas en suelos boreales forestales<\/FONT><\/SPAN><\/A><\/SPAN><\/o:p><\/SPAN><\/H1>

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La mayor parte la las investigaciones sobre biodiversidad microbiana del medio ed\u00e1fico se ha centrado en los an\u00e1lisis bacterianos<\/SPAN><\/B>.  <\/SPAN>Sin embargo, los autores del art\u00edculo al que nos referiremos hoy, publicado en la revista American Society for Microbiology<\/FONT><\/A> han ido mucho m\u00e1s lejos y, mediante an\u00e1lisis metagen\u00f3micos del RNA mitocondrial <\/SPAN><\/B>han puesto en evidencia que, al contrario de lo que se presupon\u00eda, las bacterias no constituyen la mayor parte de la biodiversidad microbiana del suelo<\/SPAN><\/B>, ni mucho menos. Y eso s\u00ed que es una novedad.  <\/SPAN>Estos investigadores norteamericanos analizaron indirectamente la diversidad de bacterias, arqueas, hongos y virus, demostrando que cualquiera de estos \u00faltimos tres grupos taxon\u00f3micos resulta ser tanto o m\u00e1s diverso que el primero<\/SPAN><\/B>. <\/o:p><\/SPAN><\/P>

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Hongos del Suelo: Aureobasidium pullalans.<\/FONT><\/A><\/o:p><\/SPAN><\/P>

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De tal hallazgo los autores concluyen que, al ocurrir en suelos de ecosistemas tan contrastados como <\/SPAN><\/B>lo son los bosques tropicales, praderas y desiertos, gran parte de la diversidad terrestre del planeta aun es desconocida<\/SPAN><\/B>. Se\u00f1alamos tambi\u00e9n que est\u00e1s t\u00e9cnicas no ofrecen el n\u00famero real de especies <\/SPAN><\/B>(como otros vendemotos se\u00f1alan), sin<\/SPAN><\/B>o la diversidad relativa entre estos taxa. <\/o:p><\/SPAN><\/P>

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Levaduras del Suelo<\/FONT><\/A><\/o:p><\/SPAN><\/P>

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M\u00e1s aun, detectaron que la diversidad-<\/SPAN><\/B>variabilidad gen\u00f3mica era completamente distinta en cada una de las muestras analizadas<\/SPAN><\/B>, por lo que no se trata <\/SPAN><\/B>en general de especies<\/SPAN><\/B> ubicuas o cosmopolitas<\/SPAN><\/B>, como otros han llegado a postular sin conocimiento de causa, sino idiosincr\u00e1sicas de cada muestra de suelo<\/SPAN><\/B>. Del mismo modo, de sus an\u00e1lisis infieren que las comunidades de virus son muy diferentes de las detectadas en otros recursos<\/SPAN><\/B>. Como ya comentamos, la bioprospecci\u00f3n de suelos no deparar\u00e1 exclusivamente datos de inter\u00e9s ecol\u00f3gico, sino <\/SPAN><\/B>que ser\u00e1 de gran ayuda para la obtenci\u00f3n de productos de inter\u00e9s comercial<\/SPAN><\/B>, como nuevos f\u00e1rmacos<\/SPAN><\/B>, entre otros muchos. Tan solo hace falta que los pol\u00edticos y la comunidad cient\u00edfica act\u00faen guiados por la l\u00f3gica cient\u00edfica, y no por las modas o los intereses medi\u00e1ticos, como viene ocurriendo por desgracia.  <\/SPAN> <\/SPAN> <\/SPAN> <\/SPAN><\/o:p><\/SPAN><\/P>

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Bacteria dot the surface of strands of fungal hyphae.
Credit: R. Campbell. In R. Campbell. 1985. <\/o:p><\/FONT><\/SPAN><\/A><\/SPAN><\/P>

Plant Microbiology. Edward Arnold; London.<\/FONT><\/A><\/SPAN><\/SPAN><\/o:p><\/SPAN><\/P>

Bacterias sobre hifas de hongos en el suelo<\/o:p><\/SPAN><\/B><\/P>

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Virus bacteriofagos (infectan bacterias) del suelo<\/o:p><\/SPAN><\/B><\/P><\/o:p><\/SPAN><\/B>

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New Study Suggests Many Unknown Microbes in Soil<\/o:p><\/SPAN><\/B><\/P>

ScienceDaily (<\/SPAN><\/B><\/SPAN>Nov. 12, 2007<\/SPAN><\/B><\/SPAN><\/st1:date>)<\/SPAN><\/B><\/SPAN><\/EM> <\/SPAN><\/B>\u2014 <\/SPAN>Metagenomic analysis of microbial biodiversity in soil <\/SPAN><\/B>samples suggest that <\/SPAN>non-bacterial species greatly outnumber bacterial species<\/SPAN><\/B>. <\/SPAN>This means the majority of microorganisms on the Earth remain undiscovered<\/SPAN><\/B>, according to researchers from the University of <\/SPAN>Colorado<\/SPAN><\/st1:place><\/st1:State>, <\/SPAN>University of South<\/SPAN><\/st1:City> <\/SPAN>Florida<\/SPAN><\/st1:State><\/st1:place>, <\/SPAN>San Diego<\/SPAN><\/st1:PlaceName> <\/SPAN>State<\/SPAN><\/st1:PlaceType> <\/SPAN>University<\/SPAN><\/st1:PlaceType><\/st1:place> and <\/SPAN>Duke<\/SPAN><\/st1:PlaceName> <\/SPAN>University<\/SPAN><\/st1:PlaceType><\/st1:place>. <\/o:p><\/SPAN><\/P>

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Soil microorganisms represent a significant portion of living matter on Earth and play a key role in ecosystem functions. Bacteria, fungi, archaea and viruses<\/SPAN><\/B> are the four microbial groups currently known to man. <\/SPAN>Bacterial presence in soil has been the most extensively studied, however <\/SPAN><\/B>with the environment at the forefront of worldwide focus, expanded research on fungal, archaeal, and viral communities is much needed<\/SPAN><\/B>. <\/o:p><\/SPAN><\/SPAN><\/FONT><\/P>

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In the study researchers used an <\/SPAN>RNA-based analysis<\/SPAN><\/B> <\/SPAN>technique to examine the richness of bacteria, fungi, archaea, and viruses in samples collected from prairie, desert, and rainforest soils<\/SPAN><\/B>. These sites were specifically targeted because they represent globally dominated ecosystem types and are broad in aridity and productivity. <\/SPAN>Results showed that unique archaeal or fungal units appeared to rival or exceed unique bacterial <\/SPAN><\/B>units in each of the soil samples.<\/o:p><\/SPAN><\/FONT><\/P>

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\u00ab<\/SPAN>In this first study, to comprehensively survey rival communities using a metagenomic approach<\/SPAN><\/B>, we found that <\/SPAN>soil viruses are taxonomically diverse and distinct from the communities of viruses found in other environments<\/SPAN><\/B> that have been surveyed using a similar approach,\u00bb say the researchers. \u00ab<\/SPAN>Within each of the four microbial groups, we observed minimal taxonomic overlap between sites, suggesting that soil archaea, bacteria, fungi, and viruses are globally as well as locally diverse<\/SPAN><\/B>.\u00bb<\/o:p><\/SPAN><\/FONT><\/P>

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Journal reference: N. Fierer, M. Breitbart, J. Nulton, P. Salamon, C. Lozupone, R. Jones, M. Robeson, R.A. Edwards, B. Felts, S. Rayhawk, R. Knight, F. Rohwer, R.B. Jackson. 2007. Metagenomic and small-subunit rRNA analyses reveal the genetic diversity of bacteria, archaea, fungi, and viruses in soil. Applied and Environmental Microbiology, 73. 21: 7059-7066.<\/o:p><\/FONT><\/SPAN><\/P>

Adapted from materials provided by <\/SPAN><\/EM>American Society for Microbiolog<\/SPAN>y<\/SPAN><\/FONT><\/SPAN><\/A><\/SPAN><\/EM>, via <\/SPAN><\/EM>EurekAlert!<\/FONT><\/SPAN><\/A><\/SPAN><\/EM>, a service of AAAS<\/SPAN><\/EM>.<\/o:p><\/SPAN><\/FONT><\/P>

 <\/FONT><\/o:p><\/SPAN>Post previos sobre biodiversidad del suelo<\/o:p><\/SPAN><\/B><\/P>

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Que Poco Sabemos del Suelo: \u00bfCuales son los Organismos m\u00e1s Grandes del Mundo?<\/FONT><\/A><\/o:p><\/SPAN><\/P>

Aspectos Generales de la Biolog\u00eda y Biodiversidad del Suelo<\/FONT><\/A><\/o:p><\/SPAN><\/P>

Problemas para Estimar la Biodiversidad del Suelo<\/FONT><\/SPAN><\/A><\/SPAN><\/o:p><\/SPAN><\/P>

Los Suelos: Banco de Semillas \u201cin situ\u201d por Antonomasia<\/FONT><\/SPAN><\/A><\/SPAN><\/o:p><\/SPAN><\/P>

La Rizosfera: Universos Dentro de Universos<\/FONT><\/SPAN><\/A><\/o:p><\/SPAN><\/P>

El Asombroso Entramado de la Vida en los Suelos<\/FONT><\/SPAN><\/A><\/o:p><\/SPAN><\/P>

Individuos y Ecosistemas o Individuos-Ecosistemas: la Ambig\u00fcedad de la Vida y la Importancia del Suelo<\/FONT><\/SPAN><\/A><\/o:p><\/SPAN><\/P>

Clasificaci\u00f3n de los Organismos del Suelo por Tama\u00f1os<\/FONT><\/A> <\/o:p><\/SPAN><\/P>

Diversidad y Escalas en Biota y Suelos<\/FONT><\/SPAN><\/A><\/o:p><\/SPAN><\/P>

Contraste Taxon\u00f3mico y Diversidad<\/FONT><\/SPAN><\/A><\/o:p><\/SPAN><\/P>

Biodiversidad y El C\u00f3digo de Barras Gen\u00e9tico: \u00bfCient\u00edficos o Comerciantes?<\/FONT><\/SPAN><\/A><\/o:p><\/SPAN><\/P>

Gen\u00f3mica y Suelos: \u00bfUna Revoluci\u00f3n?<\/FONT><\/SPAN><\/A><\/o:p><\/SPAN><\/P>

Bioprospecci\u00f3n de Suelos, Enfermedades Intrahospitalarias y Biocombustibles<\/FONT><\/SPAN><\/A><\/o:p><\/SPAN><\/P>

Comunidades Microbianas del Suelo: Relaciones Biodiversidad-\u00c1rea<\/FONT><\/SPAN><\/A><\/o:p><\/SPAN><\/P>

\u00bfCu\u00e1l es el Grupo Taxon\u00f3mico m\u00e1s Diversificado del Mundo?<\/FONT><\/A> <\/o:p><\/SPAN><\/P>

Diversidad de Sustratos, Diversidad de H\u00e1bitats y Biodiversidad<\/FONT><\/SPAN><\/A><\/o:p><\/SPAN><\/P>

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Juan Jos\u00e9 Ib\u00e1\u00f1ez<\/o:p><\/SPAN><\/P><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Como veremos posteriormente, y ya indicamos en numerosos post, como el que llevaba el t\u00edtulo \u201cBioprospecci\u00f3n de Suelos\u201d la biodiversidad que atesora el medio ed\u00e1fico apenas ha sido explorada (que poco sabemos de el mundo que tenemos bajo nuestros pies) , en contra de lo que ocurre con la marina y la de ambientes aun mucho m\u00e1s singulares o ex\u00f3ticos. Ya os comentamos tambi\u00e9n los numerosos problemas para estimar su biodiversidad . Tambi\u00e9n hemos reiterado que, a falta de tax\u00f3nomos, comienzan a utilizarse t\u00e9cnicas gen\u00f3micas y metagen\u00f3micas. Expusimos nuestras reservas a la hora de hacer uso de la gen\u00f3mica,  ya\u2026<\/p>\n","protected":false},"author":26,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"ngg_post_thumbnail":0},"categories":[596,586,601],"tags":[],"blocksy_meta":{"styles_descriptor":{"styles":{"desktop":"","tablet":"","mobile":""},"google_fonts":[],"version":4}},"aioseo_notices":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/90691"}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/users\/26"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=90691"}],"version-history":[{"count":3,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/90691\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":134655,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/90691\/revisions\/134655"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=90691"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=90691"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/universo\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=90691"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}