{"id":5218,"date":"2020-09-06T20:00:03","date_gmt":"2020-09-06T19:00:03","guid":{"rendered":"http:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/virusemergentes\/?p=5218"},"modified":"2020-09-07T18:43:24","modified_gmt":"2020-09-07T17:43:24","slug":"que-sabemos-del-origen-del-sars-cov-2","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/virusemergentes\/2020\/09\/06\/5218\/","title":{"rendered":"\u00bfQu\u00e9 sabemos del origen del SARS-CoV-2?"},"content":{"rendered":"

El origen del SARS-CoV2, causante de la actual pandemia de COVID-19 es una cuesti\u00f3n que suscita un enorme inter\u00e9s. Hace unos d\u00edas se public\u00f3 un excelente podcast en The Naked Scientist, un popular programa brit\u00e1nico de radio, podcast y web de divulgaci\u00f3n que se emite desde 1999, en el que los presentadores Chris Smith y Phil Sansom entrevistan durante 1 hora a los mejores especialistas cient\u00edficos del momento y que destacan por sus estudios en relaci\u00f3n con este tema, cuyas publicaciones se citan en el podcast. Pueden escucharlo en el enlace siguiente: https:\/\/www.thenakedscientists.com\/podcasts\/naked-scientists-podcast\/where-did-covid-come<\/a><\/strong><\/p>\n

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Para los que no tengan tiempo o tengan dificultades con el ingl\u00e9s, he preparado un resumen que acabo de publicar como hilo de Twitter (https:\/\/twitter.com\/Virusemergentes\/status\/1302607754784313344?s=20). Aqu\u00ed tienen la adaptaci\u00f3n de este hilo como post<\/em> del blog:<\/p>\n

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Este post se centrar\u00e1 en los 4 grandes puntos que se abordan en el podcast, que son:<\/p>\n

–\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0 Murci\u00e9lagos y coronavirus<\/p>\n

–\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0 SARS-1: antecedente de SARS-2<\/p>\n

–\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0 Wuhan y el SARS-2<\/p>\n

–\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0 \u00bfQu\u00e9 nos dicen las secuencias?<\/p>\n

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1.\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0\u00a0 <\/strong>Murci\u00e9lagos y coronavirus<\/strong><\/p>\n

Se conocen unos 5000 coronavirus (CoVs) distintos, de los que 2000 se hospedan en murci\u00e9lagos. Deben existir muchos m\u00e1s, pero a\u00fan no los conocemos. Los murci\u00e9lagos son buenos hospedadores de virus en general, y de CoVs en particular. No sufren da\u00f1o al infectarse y los excretan en gran cantidad. Estos CoVs de murci\u00e9lagos est\u00e1n perfectamente adaptados a sus hospedadores fruto de una co-evoluci\u00f3n producida durante milenios. Entre ellos hay un grupo o \u201clinaje\u201d conocido como \u201cSARS-like\u201d que engloba al SARS-1 y al SARS-2 entre otros. Es decir: tanto SARS-1 como SARS-2 pertenecen a un linaje gen\u00e9tico de CoVs cuyos reservorios naturales son murci\u00e9lagos, concretamente Rhinolophinae<\/em> (murci\u00e9lagos de herradura). Es l\u00f3gico pues se\u00f1alar a \u00e9stos como el origen de ambos SARS.<\/p>\n

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Ahora bien, SARS-1 y SARS-2 se han detectado sobre todo en humanos. Del primero se ha podido trazar su origen hasta el murci\u00e9lago que act\u00faa de reservorio natural y se conoce bastante bien qu\u00e9 pudo ocurrir para que saltara a los humanos. Del segundo, a\u00fan no.<\/p>\n

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2.<\/strong> SARS-1: antecedente de SARS-2<\/strong><\/p>\n

\u00bfQu\u00e9 sabemos del SARS-1? Pues 1) que es un \u201cprimo hermano\u201d gen\u00e9ticamente hablando del SARS-2 y 2) que eclosion\u00f3 en 2001 en Guandong, al sur de China, en un mercado \u201cmojado\u201d enorme que hay en esa ciudad. En estos mercados se juntan una gran diversidad de animales vivos y se sacrifican all\u00ed mismo. Dicen que en China comen \u201ccualquier cosa que tenga cuatro patas y no sea una mesa y cualquier cosa que tenga alas y no sea un avi\u00f3n\u201d. Detr\u00e1s de estos mercados est\u00e1 el tr\u00e1fico de animales salvajes. Al mercado llegan animales tra\u00eddos a veces de zonas lejanas. Y all\u00ed se re\u00fanen, se sacrifican, se venden y se consumen. \u00a1Una fiesta para los virus emergentes! Se ha visto que la incidencia de ciertos CoV en roedores silvestres aumenta a medida que se suceden etapas en el camino desde la captura en su h\u00e1bitat hasta el mercado. El estr\u00e9s que sufren en ese tr\u00e1nsito puede provocar m\u00e1s infecciones.<\/p>\n

En concreto, los murci\u00e9lagos reservorio del SARS-1 viven en Hunan, al norte de Guandong. Se ha trazado todo el proceso que dio lugar a SARS-1 desde el origen en las cuevas de Hunan hasta el mercado de Guandong (pero no vayan a pensar que esto es normal: es muy extraordinario saber cu\u00e1ndo y d\u00f3nde se origin\u00f3 un virus,; de la inmensa mayor\u00eda de los virus no conocemos su origen ni por asomo). Lo que es muy relevante es que conocemos el origen del \u201cprimo hermano\u201d del SARS-2. Y la l\u00f3gica nos lleva a pensar que si eso pas\u00f3 una vez con SARS-1, pudo perfectamente volver a pasar 20 a\u00f1os despu\u00e9s con SARS-2. Vamos pues a examinar esta hip\u00f3tesis, que propone un origen natural para el virus SARS-2. Para ello hay que tener presente la geograf\u00eda de China: Wuhan est\u00e1 en el centro de China, provincia de Hubei. La prov. de Hunan linda al sur con Hubei.<\/p>\n

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Los murci\u00e9lagos reservorios de los CoV \u201cSARS-like\u201d no viven en Wuhan. Ni siquiera en Hubei. Viven m\u00e1s al sur (en Hunan y provincias m\u00e1s al sur de China, pero tambi\u00e9n en Vietnam, Laos, Myammar\u2026).<\/p>\n

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3. Wuhan y el SARS-2<\/strong><\/p>\n

\u00bfC\u00f3mo lleg\u00f3 el virus SARS-2 hasta Wuhan? \u00bfEn un murci\u00e9lago? \u00bfEn un ser humano infectado? \u00bfEn otro animal? \u00bfY qu\u00e9 papel tuvo el famoso mercado de Wuhan? \u00bfEs cierto que fue la \u201czona cero\u201d de la pandemia? Vamos por partes:<\/p>\n

I) El mercado de Wuhan<\/strong>: No es cierto que este mercado fuera el origen de la pandemia, ni siquiera fue el lugar donde se detectaron los primeros casos. El primer caso detectado (diciembre de 2019) no pis\u00f3 el mercado en su vida. Como tampoco tuvieron vinculaci\u00f3n con el mercado m\u00e1s de 1000 casos detectados en las primeras fases de la epidemia. En el mercado hubo casos, si, pero ni fueron los primeros ni los \u00fanicos. El origen no estaba all\u00ed. Estudios de evoluci\u00f3n molecular sugieren que las variantes gen\u00e9ticas \u201cancestrales\u201d del SARS-2 no estaban en Wuhan, sino en lugares m\u00e1s al sur de China (estos estudios, publicados en un art\u00edculo en PNAS, han recibido cr\u00edticas). Varios estudios filogen\u00e9ticos y de evoluci\u00f3n del virus mediante calibrado de un \u201creloj molecular\u201d sugieren que el ancestro com\u00fan de SARS-2 pudo surgir entre septiembre y diciembre de 2019. El primer paciente fue detectado el 1 de diciembre. Es decir, mucho antes de los casos detectados en el mercado de Wuhan. Hay evidencia m\u00e1s que suficiente para descartar al mercado como origen. Entonces\u2026 \u00bfde donde sali\u00f3 en SARS-2? Sigamos con la hip\u00f3tesis del origen natural\u2026<\/p>\n

II) Sur de China:<\/strong> \u00bfEst\u00e1 el origen en otras provincias al sur de Wuhan (ej: Hunan) donde viven murci\u00e9lagos de herradura? Si fuera as\u00ed \u00bfpor qu\u00e9 no se detectaron casos all\u00ed primero? Puede que no sea tan f\u00e1cil reconocer los primeros casos\u2026 Hay estudios que sugieren que los \u201csaltos\u201d (\u201cspillover\u201d) de CoV de murci\u00e9lagos a humanos no son tan infrecuentes. En Hunan un 3% de la gente tiene anticuerpos frente a un CoV (no relacionado con SARS-2) presente en murci\u00e9lagos locales. Esto significa que un % relevante de la poblaci\u00f3n ha estado expuesta y se ha infectado con ese CoV. Esto podr\u00eda indicar que estos saltos de animal a humano se dan con frecuencia, si bien ese CoV no parece haber generado brotes de enfermedad\u2026O quiz\u00e1 s\u00ed: a veces es dif\u00edcil reconocer un brote: \u00bfCu\u00e1ntas neumon\u00edas, por ejemplo, quedan en los hospitales sin diagnosticar el agente etiol\u00f3gico? Para cuando se detecta un primer caso, el virus ha podido estar circulando ya un tiempo.<\/p>\n

\u00a0<\/strong><\/p>\n

4. \u00bfQu\u00e9 nos dicen las secuencias?<\/strong><\/p>\n

Est\u00e1 claro que la naturaleza se basta y se sobra para producir virus de este tipo. Pero el SARS-2 tiene dos caracter\u00edsticas que lo diferencian y lo han convertido en pand\u00e9mico: 1) su alta capacidad de transmitirse entre humanos (HxH) y 2) su habilidad para pasar desapercibido por su alta capacidad de contagiarse por a- y pre-sintom\u00e1ticos. Todo ello nos indica una alta adaptaci\u00f3n humanos \u00bfQu\u00e9 nos dicen los estudios de secuenciaci\u00f3n gen\u00e9tica acerca de estas caracter\u00edsticas? Se ha comparado la divergencia gen\u00e9tica existente entre los diferentes virus SARS (1 y 2) detectados en los primeros 3 meses de sus respectivas epidemias. Las secuencias de SARS-1 fueron mucho m\u00e1s divergentes que las de SARS-2. \u00bfEsto qu\u00e9 supone? Pues supone que el SARS-1 fue detectado en momentos muy tempranos de su adaptaci\u00f3n a humanos, lo que explicar\u00eda esa mayor divergencia. Ello permiti\u00f3 ver \u201ctoda la pel\u00edcula\u201d de esa adaptaci\u00f3n. Pero del SARS-2 nos hemos perdido esa pel\u00edcula. Ya hemos visto que el SARS-2 pudo haber estado circulando tiempo antes de la detecci\u00f3n del primer caso, y ello podr\u00eda explicar esta ausencia de datos sobre la adaptaci\u00f3n a humanos. Simplemente, se tard\u00f3 m\u00e1s en identificar. Otra forma de explicarlo ser\u00eda que el SARS-2 se \u201cpre-adapt\u00f3\u201d en alg\u00fan reservorio animal antes de \u201csaltar\u201d a humanos. Se han propuesto algunos hospedadores intermediarios, como el pangol\u00edn, pero no hay evidencia s\u00f3lida al respecto. La tercera posibilidad es que esa adaptaci\u00f3n no sea natural sino \u201cforzada\u201d en un laboratorio, es decir, que el origen del SARS-2 no sea natural, sino artificial.<\/p>\n

Examinemos m\u00e1s en detalle esta hip\u00f3tesis. En el podcast tambi\u00e9n mencionan un estudio empleando modelos tridimensionales simulados en un ordenador, de la interacci\u00f3n de la prote\u00edna \u201cS\u201d de la esp\u00edcula del virus SARS-2 con el receptor celular (ACE) de diferentes especies animales. Esta simulaci\u00f3n concluye que, de todas las especies analizadas, la mejor interacci\u00f3n ocurre con el receptor humano, lo cual sugiere de nuevo una gran adaptaci\u00f3n del virus al ser humano. \u00bfEs esta gran adaptaci\u00f3n \u201cnatural\u201d o es fruto de la mano del hombre? Una cuesti\u00f3n relevante m\u00e1s: en la prote\u00edna \u201cS\u201d del virus se ha encontrado un \u201cmotivo\u201d (una serie de residuos amino\u00e1cidos con caracter\u00edsticas peculiares) que solo ha sido encontrado en la regi\u00f3n hom\u00f3loga de unos virus \u201cSARS-like\u201d en pangolines. Ese \u201cmotivo\u201d contiene un \u201csitio de clivaje (rotura) por furina\u201d. La furina es una proteasa presente en las c\u00e9lulas de muchos organismos. Este sitio parece facilitar bastante la interacci\u00f3n con el ACE y la infecci\u00f3n de las c\u00e9lulas humanas. Entre los CoV es conocida su capacidad de recombinar, o sea, de adquirir\/intercambiar segmentos de sus genomas. Alg\u00fan virus del linaje \u201cSARS-like\u201d (el \u201cabuelo\u201d del SARS-2 y de los CoV de pangol\u00edn) en su evoluci\u00f3n podr\u00eda haber adquirido esa regi\u00f3n.<\/p>\n

La cuesti\u00f3n es si estos cambios son naturales o los ha introducido el hombre mediante manipulaciones en un laboratorio. El podcast se\u00f1ala que no se puede excluir ninguna de las 2 posibilidades hoy por hoy con la ciencia en la mano. Sin embargo, los expertos tambi\u00e9n se\u00f1alan que \u00abes muy improbable\u00bb que este virus haya sido fabricado directamente por la mano del hombre. De hecho, hay mucha evidencia en contra de esta hip\u00f3tesis: Por un lado, est\u00e1 el hecho de que en el genoma del SARS-2 no hay huella alguna que permita sospechar que no tiene un origen natural. Las manipulaciones gen\u00e9ticas de virus son posibles, desde luego, pero dejan huella. En el genoma del SARS-2 no hay se\u00f1al alguna de manipulaci\u00f3n. Por otro lado, si alguien pens\u00f3 alguna vez crear un virus de estas caracter\u00edsticas para soltarlo deliberadamente, lo hubiera hecho tomando un virus de partida conocido, por ejemplo, el SARS-1. No tiene sentido empezar con un virus desconocido. Hay una tercera posibilidad, y es que el virus no sea resultado de una manipulaci\u00f3n deliberada, pero haya podido resultar a partir de un accidente en un laboratorio, un escape, por ejemplo. Si bien esta \u00faltima posibilidad es algo m\u00e1s plausible que el origen deliberado, ninguna de las dos hip\u00f3tesis \u201cno naturales\u201d del origen del SARS-2 cuenta con evidencia alguna en su favor, aunque tampoco se pueden descartar formalmente.<\/p>\n

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A lo largo del podcast (y tal y como se refleja en este resumen) se expone la forma en la que el SARS-2 pudo surgir por procesos naturales, sin necesidad de la intervenci\u00f3n humana. Est\u00e1 demostrado que el SARS-1 surgi\u00f3 as\u00ed, y ello es un precedente muy relevante a tener en cuenta para el caso del SARS-2 \u00bfDe la misma forma que ha habido un SARS-1 y un SARS-2 podr\u00eda haber un SARS-3? Desde luego. Los procesos que conducen al surgimiento de estos virus se relacionan con el cambio global: los efectos de la actividad humana sobre la naturaleza. Como dice P. Daszak, la deforestaci\u00f3n por ejemplo, implica desarrollo econ\u00f3mico pero tiene un coste ambiental que pagamos no solo en calentamiento global: el precio tambi\u00e9n incluye pandemias.<\/p>\n

Finalmente, hay que se\u00f1alar que alrededor del origen del SARS-2 hay m\u00e1s incertidumbres que certezas, como queda patente en el podcast y en este resumen he intentado reflejar. Hay que estudiar mejor el pool de CoV \u201cSARS-like\u201d presente en la naturaleza, por ejemplo. Cuanto mejor seamos capaces de explicar el origen de este virus m\u00e1s capaces seremos de prevenir el SARS-3.<\/p>\n

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