{"id":5367,"date":"2021-04-06T07:01:55","date_gmt":"2021-04-06T06:01:55","guid":{"rendered":"http:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/virusemergentes\/?p=5367"},"modified":"2021-04-06T07:05:11","modified_gmt":"2021-04-06T06:05:11","slug":"sobre-la-diferencia-entre-cepa-y-variante-y-algun-otro-concepto-basico-de-virologia-para-dummies","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.madrimasd.org\/blogs\/virusemergentes\/2021\/04\/06\/5367\/","title":{"rendered":"Sobre la diferencia entre cepa y variante (y alg\u00fan otro concepto b\u00e1sico de virolog\u00eda)"},"content":{"rendered":"
Continuando con la reci\u00e9n estrenada costumbre en este blog de publicar hilos de inter\u00e9s que he publicado anteriormente en Twitter, hoy toca este sobre la diferencia entre cepa y variante y alg\u00fan\u00a0otro concepto b\u00e1sico de virolog\u00eda. Fue publicado el 21 de diciembre pasado.<\/strong><\/div>\n
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\u00bfVariante o cepa? Seguro que m\u00e1s de uno se ha preguntado cual es la diferencia, y si se est\u00e1n utilizando estos t\u00e9rminos apropiadamente en esta pandemia cuando hablamos de variantes y cepas del virus SARS-CoV2<\/strong>. En este post intentaremos acotar las definiciones de estos conceptos y algunos m\u00e1s.<\/div>\n
Primero hay que indicar que un \u00abmismo virus\u00bb (una \u00abespecie v\u00edrica<\/strong>\u00ab) puede tener infinidad de variantes GEN\u00c9TICAS<\/strong>. Esto es porque cada vez que un virus replica su genoma para multiplicarse en las c\u00e9lulas del hospedador sufren mutaciones<\/strong>, o errores en la copia. Y algunos virus yerran m\u00e1s que otros. Por ejemplo, los virus cuyo genoma es ARN<\/strong> por lo general cometen m\u00e1s errores que los virus cuyo genoma es ADN<\/strong>. El genoma de los coronavirus<\/strong> es ARN pero mutan menos que otros virus de ARN (v\u00e9ase este hilo <\/a>que publiqu\u00e9 en Twitter hace un tiempo).<\/div>\n
Por supuesto, no todas las variantes generadas por errores de copia son viables (o sea, infecciosas): muchas contienen mutaciones incompatibles con el ciclo infectivo del virus en cuesti\u00f3n. Pero unas pocas si lo son, y son por tanto capaces de infectar otras c\u00e9lulas y continuar el ciclo. La inmensa mayor\u00eda de esas mutaciones no representan cambios en las propiedades infectivas del virus. Son \u00abneutras<\/strong>\u00ab. Se han identificado miles de ellas en el SARS-CoV2 desde el inicio de la pandemia. Eso s\u00ed, cada vez que salta una de estas mutaciones a los medios de informaci\u00f3n general, se anuncia el apocalipsis zombie. Recomendar\u00eda a los medios informarse de fuentes solventes antes de lanzar mensajes catastrofistas. B\u00fasquenlas en los laboratorios de virolog\u00eda.<\/div>\n
Sigamos con el hilo acerca de cepas y variantes v\u00edricas. Ya hemos visto lo que es una variante<\/strong>. Ahora definiremos lo que es una cepa<\/strong>. De hecho, haremos un hueco para definir otro palabro que usamos los vir\u00f3logos: \u00bfqu\u00e9 es un \u00abaislado<\/strong>\u00ab? Para entenderlo hay que considerar que los virus no solo presentan diferencias en sus genomas, sino que tambi\u00e9n pueden diferir en otras caracter\u00edsticas: estructurales, antig\u00e9nicas y funcionales. Eso s\u00ed, todas ellas determinadas por su secuencia gen\u00e9tica. El mismo virus (utilizaremos el t\u00e9rmino \u00abespecie v\u00edrica\u00bb) puede adoptar formas que resuelvan su problema de supervivencia de modos ligeramente diferentes. As\u00ed, habr\u00e1 virus con ligeras diferencias estructurales<\/strong> (por ejemplo, en la glicosilaci\u00f3n de sus prote\u00ednas), mientras que\u00a0 otros diferir\u00e1n en sus propiedades antig\u00e9nicas<\/strong> (la forma en que son reconocidos por el sistema inmune). Por ejemplo, hay especies v\u00edricas que presentan serotipos<\/strong>, que son variantes distinguibles mediante antisueros espec\u00edficos.<\/div>\n
Y otros diferir\u00e1n en propiedades funcionales<\/strong> tales como su velocidad de replicaci\u00f3n<\/strong>, su transmisibilidad<\/strong>, su capacidad de infectar tipos celulares distintos<\/strong>, su capacidad de producir da\u00f1o<\/strong> al tejido al que infectan, su virulencia<\/strong>, etc. Pero no es f\u00e1cil inferir esas propiedades a partir de la secuencia gen\u00e9tica, que nos informa sobre \u00abvariantes\u00bb, no sobre \u00abcepas\u00bb<\/em>. Una cepa v\u00edrica es una variante cuyas propiedades estructurales, antig\u00e9nicas y\/o funcionales han podido ser estudiadas en laboratorio<\/strong>. Es m\u00e1s, una cepa v\u00edrica normalmente representa un prototipo<\/strong> de virus dentro del espectro de virus que contiene una especie v\u00edrica. Por ejemplo, la cepa XXX de la especie A representa las variantes de crecimiento lento. O la cepa YYY representa las variantes neurotr\u00f3picas (invasoras del sistema nervioso), etc. De hecho, cada \u00abespecie v\u00edrica\u00bb est\u00e1 representada por una cepa \u00abtipo\u00bb<\/strong> que es aquella cepa que re\u00fane las caracter\u00edsticas que se consideran propias de esa especie.<\/div>\n
Para poder estudiar en el laboratorio las caracter\u00edsticas estructurales, antig\u00e9nicas y\/o funcionales de un virus, es necesario aislarlo<\/strong> en cultivo celular o en cualquiera de los sistemas biol\u00f3gicos aptos para este fin (huevos embrionados, p ej). Un \u00abaislado<\/strong>\u00bb v\u00edrico es un virus que ha sufrido ese proceso en el laboratorio, pero que a\u00fan no ha sido caracterizado lo suficiente como para conocer sus propiedades y poder considerarlo una \u00abcepa\u00bb.<\/div>\n
As\u00ed, hemos definido los conceptos variante –>aislado –> cepa –> especie v\u00edrica<\/strong>.
\nN\u00f3tese que para poder hablar de \u00abcepas\u00bb es necesario haber aislado un virus y estudiado sus propiedades, y no meramente inferirlas de su secuencia gen\u00e9tica. Sobreinterpretar los datos de secuencia es un error muy frecuente. Un buen art\u00edculo para prevenir este riesgo es el siguiente:<\/div>\n
https:\/\/www.sciencemag.org\/news\/2020\/03\/mutations-can-reveal-how-coronavirus-moves-they-re-easy-overinterpret<\/a><\/div>\n
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Recordemos igualmente aqui este hilo publicado en Twitter <\/a>relatando brevemente las dificultades para estudiar con la debida profundidad la virulencia, transmisibilidad y otras caracter\u00edsticas de las cepas v\u00edricas.<\/div>\n

Y termino recordando cuanto muta un coronavirus: De media, \u223c1 \u00d7 10(-5) a 1 \u00d7 10(\u22126) mutaciones por sitio por replicaci\u00f3n (=msr). Esto es mucho menos de lo esperado para un virus ARN (\u223c1 \u00d7 10(\u22123) a 1 \u00d7 10(\u22125) msr) y m\u00e1s pr\u00f3ximo a las que muestran los virus ADN. Con ello quiero subrayar que nos quedan muchas mutaciones que digerir, y que no nos dejemos llevar por informaciones alarmistas.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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