Solicitud de una futura bioinformática desde Nigaragua

Últimamente no le estoy dedicando el tiempo que tendría que dedicarle al weblog con la adaptación y puesta en marcha del entorno de trabajo en el CNIO. «Fruto» de ello ha sido que se me traspapelase el siguiente mensaje que envió Conny desde Nicaragua, solicitando orientación:

Estimados compañeros, soy estudiante de maestría
en Ciencias de Computación y estoy estudiando
mucho la bioinformática porque quiero hacer mi
tesis basada en ésta. Solicito su ayuda a ver si
me pueden enviar información acerca de
herramientas de minería de datos que se aplican
en bioinformática y los algoritmos más usados ya
sea en genomica, proteómica, análisis de datos de
especies etc, es decir las áreas más claves donde
se aplica la bioinformática actualmente. A
propósito, soy nicaragüense y tengo 23 años,
estudio en Costa Rica. Mi sueño es etudiar mi
doctorado en bioinformática en España ya que es
uno de los países numero uno en este emergente
campo. Espero sus respuestas.

    Aquí está mi propio granito de arena, Conny, con enlaces a los principales algoritmos. Lo más importante: la herramienta básica para buscar artículos es PubMed, la base de datos de abstracts de artículos científicos. El enlace a PubMed es:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi

    He estado buscando los artículos de los algoritmos Smith&Waterman, Blast, PSI-Blast y otros, y aquí están los enlaces. El primero de los artículos sólo está disponible bajo suscripción, con lo que de momento tendrás que contentarte con el abstract. En cuanto al resto, espero que no tengas problemas con los enlaces.

(Enlace al abstract de Smith & Waterman)
http://www.springerlink.com/(fmavvh45ujq1fsvukkpkep45)/app/home/contribution.asp?referrer=parent&backto=issue,7,10;journal,126,192;linkingpublicationresults,1:400107,1

(Enlaces al artículo de Blast y PSI-Blast, en HTML y en PDF)
http://nar.oxfordjournals.org/cgi/content/full/25/17/3389
http://nar.oxfordjournals.org/cgi/reprint/25/17/3389.pdf

(Enlace al artículo de ClustalW, en PDF)
http://www.pubmedcentral.nih.gov/picrender.fcgi?tool=EBI&pubmedid=7984417&action=stream&blobtype=pdf

(Enlace al artículo de HMMer)
http://selab.wustl.edu/publications/Eddy98/Eddy98-reprint.pdf

(Enlace al artículo de T-Coffee)
http://igs-server.cnrs-mrs.fr/~cnotred/Publications/Pdf/tcoffee.pdf

Compartir:

6 comentarios

  1. Hola Conny un saludo me gusta mucho tu propuesta, soy estudiante de la carrera de Ciencias Biologicas y de igual manera estoy interesado en la Bioinformatica quiero realizar mi tesis en la misma (aun me faltan 3 años casi) pero mas alineada a la Ciencia (Biologia) pero de todos modos estoy buscando informacion (desesperadamente) y me esta llegando 😉 pero podriamos colaborar estoy para eso….

  2. HOla, yo estoy terminando mi licenciatura en ciencias de la computacion pero siempre me ha gustado la biologia, es por eso que quiero hacer mi tesis en bioinformatica, me podrian dar una pista de por donde empezar, he leido bastante pero todo lo q yo todavia no se, esta bastante desarrollado, asi q estoy en un mar de opciones.

  3. hola buen dia. soy estudiante de ing en sistemas compuacionales en estos momentos estoy realizando mi tesis y es acerca de la mineria de datos en la bioinformatica si tienen algunos temas< relacionados o tutotiales se los agradeseria muchismimo. gracias Dios les bendiga.

  4. hola buen dia. soy estudiante de ing en sistemas compuacionales en estos momentos estoy realizando mi tesis y es acerca de la mineria de datos en la bioinformatica si tienen algunos temas< relacionados o tutotiales se los agradeseria muchismimo. gracias Dios les bendiga.

  5. Hola soy estudiante de biotecnologia y mi tesina de grado sera en un trabajo de bioinformatico, sencillo pero trabajoso para alguien que ha dedicado su carrera a la biologia molecular y no a la programacion,

    estoy muy interesada en hacer una pasantia o mejor aun un doctorado en europa. quisiera pedir si alguien tiene informacion al respecto. mi solicitud seria para el año que viene.

    gracias

Deja un comentario