Cuando dependes de un programa antiguo
Si trabajas en bioinformática, la mayor parte del tiempo estás dependiendo de programas que no has hecho para tu trabajo cotidiano. En ocasiones (más de lo habitual) es necesario usar programas que son antiguos o muy antiguos, y que no consigues que funcionen en los primeros intentos. Eso es lo que nos ha estado pasando hoy en el laboratorio, intentado hacer funcionar los programas del paquete Tops.
El programa Tops sirve para estudiar la topología de las proteínas, representándolas de forma esquemática. El primer artículo que menciona este paquete data de 1998, y sus autor@s originales ya hace tiempo que dejaron de mantener los programas. Esto es muy común en un mundo muy dinámico como el de la investigación científica, en el que las instrucciones o el código fuente de los programas más antiguos termina por perderse (si es que alguna vez se hizo público), y en el que los servicios bioinformáticos disponibles por web (tengan o no tengan éxito) terminan por dejar de funcionar. Esto ocurre por diversas causas, como no querer seguir manteniendo el software, no conseguir recursos para mantenerlo, se pierde tras una catástrofe como un incendio o una inundación, etc…
En esta ocasión tuvimos suerte, lo conseguimos hacer funcionar, pero ¿y la siguiente?