genoDive, un programa de visualización de estructuras genómicas
En las sesiones de BioHackathon acabo de encontrarme con un nuevo programa de visualización de estructuras genómicas y su información asociada. Se llama genoDive, y aunque básicamente trabaja como un cliente DAS, da una nueva dimensión al concepto de exploración gráfica de las anotaciones genómicas.
genoDive Es un programa que está ahora naciendo (es una versión 0.1alpha), estáescrito en C++ y usa las librerías OpenGL para la visualización. Haydos versiones del mismo, una enfocada en la visualización de genomasprocariota con cromosomas circulares (Genotype Pro), mientras que laotra está dedicada a genomas eucariota (con cromosomas lineales).
Debido a ser tan nuevo, aún no están disponibles los enlaces de descarga ni de las compilaciones (para Mac OS X y Windows), ni el código fuente (que debería ser posible compilarlo en Linux, según los autores), por lo que sólo os puedo ofrecer los videos colgados, que se parecen a la demostración que acabo de ver.
Enlaces
- genoDive: http://genodive.org/