EVaBio’07
La bases de datos biomédicas tienen cada día más importancia, debido a la información vital que empiezan a contener, y que se pierde muchas veces: la de las historias médicas de pacientes reales con enfermedades reales. Esas bases de datos necesitan mucho trabajo por detrás, porque para que sus contenidos sean útiles la información a almacenar ha de sufrir un duro trabajo de sistematización de las historias médicas, y necesitan una estandarización que permita consultar y correlacionar la información disponible en los distintos hospitales y centros de investigación de enfermedades.
Para dar una idea de lo duro de ese trabajo, os propongo que consulteis la base de datos OMIM de enfermedades genéticas humanas, que actualmente está hospedada en el NCBI. Esa base de datos no almacena la información que puede llegar a contener una base de datos biomédica, pero sus contenidos han sido generados por expertos dedicados a estudiar tanto artículos científicos como historiales médicos. Aún con eso, su contenido está siendo anotado y relacionado con otras bases de datos del NCBI, debido a las carencias que tenía inicialmente y que impedían que se pudiera aprovechar satisfactoriamente el conocimiento almacenado.
Pues bien, el próximo 12 de Noviembre de 2007 se va a celebrar en Salamanca EVaBio’07, el primer workshop sobre extracción y validación de conocimiento en bases de datos biomédicas aquí en España. Chevi me lo ha comunicado esta mañana, para que le dé difusión en este blog. Al estar englobado el workshop en la XII Conferencia de la Asociación Española de Inteligencia Artificial, y ser uno de los patrocinadores la editorial Springer (muy conocida por sus magníficos libros relacionados con las ciencias de la computación) los que esteis más en el lado ‘bio’ y os interese el tema podeis aprovechar este workshop para entrar en contacto con el lado ‘informático’. Aquí viene el anuncio oficial:
Ruego disculpen las molestias si reciben este mensaje por más de una vía.
I Workshop español sobre Extracción y Validación de conocimiento en Bases de datos Biomédicas
EVABIO’07
CAEPIA’07
http://www.upo.es/eps/bigs/evabio.html
DESCRIPCIÓN
Los avances en investigación en los campos de la biología molecular y la genómica, unidos a un imparable perfeccionamiento en los sistemas de información y almacenamiento, hacen posible la generación de ingentes cantidades de datos experimentales de gran dimensionalidad. Actualmente, los métodos de extracción de conocimiento se basan en diferentes paradigmas, tales como las técnicas de clustering, biclustering, generación de ontologías o el uso de redes genéticas. Independientemente del método de análisis utilizado, los resultados generados deben ser validados. No obstante, a pesar del crecimiento que ha experimentado la literatura a este respecto durante los últimos años, son escasos los trabajos que proponen una técnica de validación bajo un único punto de biológico, utilizando para ello información biológica contrastada.
OBJETIVOS
El objetivo de este Workshop es fomentar un punto de encuentro y promover un forum de discusión para todos los investigadores de ámbito nacional dedicados a la bioinformática desde el punto de vista de la extracción y validación de conocimiento a partir de bases de datos biomédicas.
TOPICOS: los principales tópicos, aunque no los únicos, son:
– Modelado y Análisis de bases de datos de expresión genética basadas en experimentos con Microarrays
– Identificación de Redes Genéticas.
– Interacción proteína-proteína
– Técnicas de validación biológica de modelos de conocimiento
– Integración de bases de datos
– Errores e inconsistencias en bases de datos biológicas
– Generación de Bio-Ontologías, y su posterior evaluación.
CONTRIBUCIONES
Las contribuciones tendrán una extensión máxima de 10 páginas y serán trabajos de investigación originales, sólidos y bien fundamentados o con resultados demostrables, sobre cualquiera de los temas relacionados con el Workshop.
Todos los trabajos presentados deberán estar escritos en español o en inglés y deben seguir las normas de estilo de la editorial Springer, que se encuentran en la página web: http://www.springer.de/comp/lncs/authors.html.
Las contribuciones se remitirán a la siguiente dirección de correo electrónico: evabio@upo.es
FECHAS DE INTERÉS
Recepción de trabajos 15- julio – 2007
Notificación de aceptación 20 – septiembre – 2007
Envío de la versión definitiva 10 – octubre – 2007
Celebración del Workshop 12 – noviembre – 2007