¿Debería ser eliminada la aplicación de copyrights del trabajo científico publicado?

Así es como se traduce más o menos el título del artículo Should Copyright Be Abolished On Academic Work? publicado en Techdirt el pasado 24 de Julio, basado en un artículo del mismo nombre del 20 de Julio publicado en la web del Harvard’s Berkman Center For Internet and Society, y a su vez basado en un artículo de 61 páginas (en PDF) con el mismo título de Steven Shavell. Básicamente empieza contando alguna de las paradojas introducidas por el…

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Jornada de puertas abiertas en el EBI

Casi todos los centros de investigación celebran al menos una vez al año jornadas de puertas abiertas, y lo mismo ocurre con el EBI. La diferencia entre los distintos centros estriva en el público hacia el que está orientada esa jornada de puertas abiertas. Por ejemplo, los museos y centros de investigación de la Comunidad de Madrid celebran sus jornadas de puertas abiertas coincidiendo con la Semana de la Ciencia. En el caso del EBI su jornada de puertas abiertas…

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Uso de Google Wave en el mundo de la investigación

Rescatando de mi correo un par de enlaces que me había mandado David González Pisano hace medio mes, me he encontrado una noticia publicada el 8 de Junio en el blog Science in the open sobre el uso de la herramienta colaborativa Google Wave en el ámbito de la investigación científica. En pocas palabras, Google Wave permite elaborar de forma colaborativa e interactiva documentos complejos compuestos de waves. ¿Y qué es un wave? Básicamente, toda estructura de datos que permita…

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Hace 10 años, hardware y sistemas operativos en bioinformática

Lo primero, esta publicación ha nacido de una pregunta de Ramón en el comentario 122116 del post ‘Hardware necesario para trabajar en Bioinformática’ En 1999 lo mejor que podía ofrecer Microsoft era el Windows NT y a finales de ese año, el flamante Windows 2000. Aunque los caros ordenadores Apple eran potentes, estaban lastrados por Mac OS 8 y el flamante Mac OS 9. En bioinformática casi todo el mundo usaba las muy caras workstations de SGI, Sun, Compaq (con…

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HMMer 3.0 y la migración de Pfam

Una de las noticias que me confirmaron en persona en el pasado ISMB-ECCB 2009 fue que a finales de Agosto o principios de Septiembre la base de datos Pfam va a cambiar de formato para adaptarse a HMMer 3.0, la última versión principal de este software de búsqueda de motivos. Por lo que entendí tras charlar con uno de sus curadores, el cambio de formato en Pfam no es compatible hacia atrás, en el sentido de que las herramientas de…

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Benchmarking, Linux distros y bioinformática

Hace unos pocos años era casi imposible encontrar herramientas bioinformáticas en los paquetes estándar de las distintas distribuciones Linux, pero a día de hoy es tan común que las podemos encontrar integradas incluso en sistemas de benchmarking como el Phoronix Test Suite. Hace un par de días aparecieron en Phoronix los resultados de comparar las últimas versiones de las distribuciones OpenSuSE, Ubuntu, Fedora y Mandriva (mirad el siguiente enlace), y en la página 3 del informe dos de los benchmarks…

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Hardware necesario para trabajar en bioinformática

Hace unos días me llegó por el sistema de contacto de los blogs el siguiente mensaje de David: Hola, Soy un futuro estudiante de Bioinformática y quería consultarle acerca de los requerimientos de hardware de un ordenador a la hora de utilizar programas y dedicarse a la Bioinformática. ¿Es necesario algun requisito especial en cuanto a memoria, disco duro, tarjeta grafica, procesador…. para alguna de las tareas de esta ciencia?Muchas gracias y enhorabuena por el blog. Supongo que es una…

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