Uso de DNA arrays para la detección de mutaciones en la gripe aviar
Como he dicho en la noticia anterior, ¡hoy es el día de las colaboraciones! José Manuel Gimeno, periodista de La Flecha, me ha proporcionado el enlace a una noticia sobre el uso de DNA arrays para la detección de mutaciones del virus H5N1 en 11 horas desde la toma de la muestra. La tecnología de los biochips es bastante genérica, y está siendo usada actualmente en muchos centros de investigación básica a lo largo del mundo, como es el caso del CNB o el CNIO (actualmente se están diseñando en el CNIO nuevos biochips relacionados con cáncer, además de los ya disponibles).
La parte más difícil a la hora de diseñar cualquier biochip es encontrar los patrones de expresión adecuados que permitan identificar con una tasa de error baja la condición deseada (cánceres de varios tipos, resistencia a determinados fármacos, mutaciones en virus, …), y aquí es donde normalmente interviene la bioinformática. He intentado encontrar qué técnicas han usado para el diseño del mismo, y siguiendo el hilo hasta la noticia original ¡no he encontrado nada! Es una lástima que la web de la Universidad de Colorado, que es la que publica la noticia original, no haya proporcionado más datos científicos sobre cómo lo han hecho (o un simple enlace), y estén más interesados en la publicidad. Por ejemplo, buscando en Internet he encontrado un artículo del año 2003~2004 (Use of the DNA Flow-Thru Chip, a Three-Dimensional Biochip, for Typing and Subtyping of Influenza Viruses) que describe perfectamente el diseño de un biochip para la clasificación y subclasificación de los distintos tipos de virus de la gripe.
Enlaces:
- Noticia en «La Flecha» sobre el biochip.
- Noticia en «Tendencias 21» sobre el biochip.
- Noticia original del biochip en la web de la Universidad de Colorado.