Nuevo sitio de BioPerl, hospedado por Open Bioinformatics Foundation
David González Pisano me indicó que en NodalPoint.org había aparecido la noticia de la remodelación del sitio web de BioPerl. Alguno se preguntará, «bueno, vale, ¿y qué? Solo han cambiado las páginas, ¿no?». La importancia de esto es que el nuevo sitio web está más orientado a los desarrolladores. Ha sido montado mediante MediaWiki, el mismo software que usa por debajo Wikipedia, con lo cuál el sitio de BioPerl adquiere inmediatamente todas sus virtudes: búsqueda de artículos; creación de artículos organizados por categorías con enlaces a otros existentes; posibilidad de añadir opiniones (pestaña Discuss); control de versiones y posibilidad de ver versiones anteriores de los artículos; etc…
Además, el nuevo sitio de BioPerl ahora tiene un blog de noticias donde los usuarios de BioPerl pueden exponer sus problemas a la hora de usar BioPerl, discutir nuevas características que debería tener, o llamar la atención sobre un posible fallo en la API, por ejemplo. Los blogs relacionados con proyectos de este tipo son la evolución natural de las listas de news a las que uno se suscribía hace unos años, y ahora es cuando se está produciendo la migración.
BioPerl, sus primos BioJava y BioPython, y otros proyectos bioinformáticos (por ejemplo BioMOBY) están empezando a ser hospedados por Open Bioinformatics Foundation, beneficiándose de MediaWiki, WordPress o lo que necesiten. Tanto BioPerl como BioMOBY ya han migrado por completo, mientras que en otros casos esa migración está en curso. Es el caso de BioJava, que tiene su web tradicional, http://www.biojava.org/ y su nueva web http://biojava.open-bio.org/.
DEMUESTREN QUE SABEN USAR BIOPERL
PONGAN UN EJEMPLO
YO YA LO INSTALE VARIAS VECES Y NO HAY FORMA DE ENTRAR A BIOPERL NI SIQUIERA HAY UN MALDITO EJEMPLO Y SI LO HAY NO FUNCIONAN
QUE PORQUERIA
POR QUE NO LO INTEGRAN A ACTIVESTATE?
http://www.bioperl.org/Core/Latest/bptutorial.html#iii_2_1_transforming_sequence_files__seqio_
Y si un ejemplo tan tonto como éste no te funciona, es que no será de BioPerl, sino de quien lo instaló
Can you write here somthing about easy installing dam Bioperl
I get installed:
ActivePerl-5.10.0.1004-MSWin32-x86-287188.msi
thanks to
leonardosepulveda@gmail.com
but I can’t get installed fucking Bioperl
I hope we’ll have a happy marriage betweeen
ActivePerl and Bioperl both in Windows and Unix-Linux systems.
I wish to install Bioperl in Windows XP SP/2
Any help to jhopkinslb@gmail.com
Visit my Site:
http://jameshopkins-mysite.blogspot.com/
Yes, it’ll take into account your suggestion. Now I only have to find a colleague who has successfully managed what you are asking about (BioPerl with ActiveState), because it is very uncommon in my working environment finding someone using Perl outside a UNIX-like system (i.e. Linux or MacOS-X).
Have you followed the installation steps proposed at
http://bioperl.open-bio.org/SRC/bioperl-live/INSTALL.WIN
?
Gracias por su interés.
Me pondré a trabajar en BioPerl y les comunicaré mis experiencias.
También lo intentaré en Ubuntu.
Los resultados los pondré en:
http://jameshopkins-mysite.blogspot.com/