Hacer películas moleculares con PyMOL

Tengo a un par de colegas y de amigos que se las han visto y se las han deseado para conseguir generar vídeos en PyMOL mostrando un sitio de unión, una interacción, etc… Y han tenido que recurrir a generar los frames por separado usando un script de PyMOL y seguir alguna de las múltiples recetas disponibles en internet para generar el vídeo de marras.

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La referencias bibliográficas en la web social

Hace ya tiempo publiqué en este blog una entrada relacionada con software de gestión de referencias bibliográficas, como Zotero. Desde entonces el mundo científico y la web han evolucionado hacia el concepto de las redes sociales. Concretamente, si miramos las características de Zotero 2.0 (recién salido del horno) lo primero que nos llama la atención es que permite no sólo sincronizar las referencias bibliográficas entre varios ordenadores, usando el sitio central de Zotero como una especie de backup, sino que…

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HUPO-PSI Spring Meeting 2010

Del 28 al 30 de Marzo se va a celebrar en Seúl (Corea del Sur) el «HUPO-PSI 2010 Spring Meeting». Para refrescar términos y descubrir de qué va el meeting, HUPO (Human Proteome Organisation) es la organización que está detrás de PSI (Proteomics Standards Inititative). Dicha iniciativa fue la que dio lugar, entre otras cosas, al formato PSI-MI, tan usado para hacer públicos los contenidos de bases de datos de interacciones como IntAct, DIP, HPRD, BioGrid, STRING, etc… Si le…

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¿Cuánto aguantaríais por vuestra vocación?

Hoy ha salido publicada en «La Voz de Galicia» la noticia «La bióloga que pasó de publicar en «Science» a profesora de instituto». En ella el periodista escribe sobre el caso de Nuria Naverán, que tomó la decisión de abandonar la ciencia tras haber llegado a lo más alto publicando en la revista Science, e irse a un trabajo seguro. ¿Cuál es el motivo? La falta de salidas en el mundo de la investigación en España y gran incertidumbre de…

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La próxima semana comienza BioHackathon 2010

Tal como ocurrió en 2008 y 2009, este año se celebra BioHackathon 2010. El objetivo de este año de esta reunión será encontrar soluciones a los problemas de la intepretación de la información biológica en el contexto de las tecnologías de la Web Semántica. Y al igual que en las dos ediciones anteriores, se celebra en Tokyo, Japón, del 8 al 12 de Febrero. Ya me gustaría haber asistido por tercer año consecutivo al evento, pero, ¡no pudo ser!

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«Historia de la Bioinformática en el siglo 21»

Para el próximo 4 de Febrero ha organizado el Departamento de Ciencia, Tecnología y Sociedad del Instituto de Filosofía (CSIC) en Madrid el seminario "BIOINFORMATICS IN THE 21ST CENTURY". Este seminario será impartido por Sabina Leonelli, del ESRC Centre for Genomics in Society (Egenis), cuya sede es el Departamento de Sociología y Filosofía, Universidad de Exeter, UK.
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