FoldIt: jugar para hacer ciencia

Hay veces en que la ciencia gana más cuantos más recursos computacionales usa, como es el caso del proyecto Folding@Home. Sin embargo, en otras ocasiones es cuestión del número de ojos que están mirando los datos. Un ejemplo de ello es el proyecto Galaxy Zoo, en el que la gente se entrena primero para aprender a distinguir el tipo de galaxia que está viendo por su forma, para más tarde clasificar imágenes de galaxias poco estudiadas. Otro ejemplo más «bioinformático»…

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Un par de blogs y la importancia educativa de los blogs

Desde que comencé a escribir este blog hace 5 años he visto cómo ha ido creciendo y evolucionando el uso de los blogs, sobre todo como usuario de los mismos. Diarios personales públicos, blogs especializados en áreas temáticas (cocina, ciencia, productos financieros, cine, televisión, etc…), blogs de relatos cortos, de desarrollo de proyectos, etc… Centrándome en el área de bioinformática, nunca pensé que por ejemplo habría blogs que hablaran sobre los problemas de procesar datos de nuevas técnicas experimentales (por…

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Otra competición bioinformática: Predict HIV Progression

En el mundo de la bioinformática hay desde hace tiempo muchas competiciones que sirven para medir el estado del arte de las técnicas existentes en determinadas áreas, como por ejemplo minería de textos (BioCreAtIvE) o predicción de estructura tridimensional de proteínas (CASP). Acabo de descubrir una nueva competición, llamada Predict HIV Progression, también en el campo de la bioinformática. La competición requiere que se prediga la probabilidad de la infección de un paciente de VIH se vuelva menos severa, tomando…

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Hacer una estancia en EMBL

Seguro que muchos de vosotros habréis oído hablar del EMBL (European Molecular Biology Laboratory), y de sus instalaciones en Heidelberg (Alemania). Si estáis pensando en realizar una estancia allí, y vuestros contratos/becas actuales son lo suficientemente flexibles, estáis de enhorabuena. Hoy me ha llegado la información de que está abierto el plazo de solicitudes en la convocatoria de este año de las «becas españolas» para la realización de estancias en el extranjero (por ejemplo, EMBL/Heidelberg). El plazo para la presentación…

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Comienza la andadura de la Plataforma Andaluza de Bioinformática

De forma similar a lo que pasó con CVUB, hace unos días se puso en contacto conmigo M. Gonzalo Claros de la Universidad de Málaga, para hablarme sobre los primeros pasos de la Plataforma Andaluza de Bioinformática. Esta plataforma, está administrada y hospedada físicamente por el SCBI (Centro de Supercomputación y Bioinformática de la Universidad de Málaga), el cuál también es un nodo de la Red Española de Supercomputación. La plataforma permite a los usuarios utilizar, entre otros, muchos de…

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La bioinformática necesita más inversiones

Otra noticia que me mencionó David González salió publicada en el blog Blind.Scientist, el pasado día 7 de Abril. Dicha noticia menciona brevemente lo que todos los que trabajamos en bioinformática estamos viendo: la bioinformática necesita más inversiones. Dichas inversiones no son sólo para comprar más máquinas y almacenamiento, que a día de hoy hace mucha falta debido al cambio de esquemas que ha producido el ingente volumen de datos que generan los experimentos de secuenciación masiva, sino para crear…

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iBIS, un prototipo resultón

Hace ya casi un mes David González me mandó el enlace a una noticia publicada en el blog OpenHelix el pasado 15 de Marzo. Dicha noticia se hacía eco de la creación de un portal online de herramientas y tutoriales bioinformáticos por parte del Center for Computational Science de la University of Miami. Dicho portal se llama iBIS, ahora que he encontrado un pequeño hueco, me he puesto a probarlo

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