La revista Nature se moderniza: Nature Podcast

El otro día mi amigo Ramón Alonso-Allende se encontró con que la revista Nature, una de las que tienen más renombre y solera en el ámbito científico, había creado hace unas pocas semanas un servicio de podcasting. Para aquellos que no sepan lo que es un podcast hay una definición en Wikipedia, de la cuál he tomado el primer párrafo: El podcasting consiste en crear archivos de sonido (generalmente en mp3 u ogg) y distribuirlos mediante un archivo RSS de…

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Aumento espectacular del número de autores publicando en revistas de libre acceso, según un estudio independiente

Echándole un vistazo a los titulares de BioMed Central, me he encontrado con una noticia sorprendente, sobre todo por sus implicaciones. La noticia trata sobre el aumento espectacular del número de autores que publican en revistas de libre acceso. Dicha conclusión surge del estudio «New Journal Publishing Models: An International Survey of Senior Researchers», realizado por CIBER (Centre for Information Behaviour and the Evaluation of Research) y publicado en Septiembre de 2005.

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«¿En qué trabajas?» «Soy Bioinformático» «Y eso… ¿qué es?»

Durante  esta semana y la que viene se celebra en Madrid la V Semana de la Ciencia (un poco contradictorio que una semana de la ciencia dure dos), y con motivo de la misma se van a celebrar representaciones de teatro, charlas coloquio, mesas redondas y jornadas de puertas abiertas en los distintos centros de investigación y entidades que participen. Actualmente trabajo para el CSIC en el CNB, este centro de investigación va a tener el 15 de Noviembre su…

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Para l@s vicios@s del Sudoku, aquí está el Foldoku

Para el pasado ECCB05 varios compañeros de trabajo tuvieron la idea de adaptar el adictivo juego del Sudoku a estructuras de proteínas, y ahí nació el Foldoku. La dificultad del mismo está en que en lugar de números, tenemos estructuras de proteínas, lo cuál es una dificultad para el ojo que no está acostumbrado a distinguir la diferencia entre las mismas a simple vista. En otras palabras, ¡es como hacer un Sudoku con caras de chinos siendo occidental! Está hecho…

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Simulación del movimiento del tRNA dentro del ribosoma durante la decodificación

José Manuel Gimeno, del diario digital «La Flecha», me mandó el enlace a una noticia publicada en su diario («La mayor simulación informática de la biología reproduce la dinámica celular»), basada en un artículo recientemente publicado en la revista PNAS. Intentando indagar en la noticia, me puse a buscar las fuentes de la misma, entre las cuáles está la página web sobre el experimento publicada por el laboratorio de Los Álamos, en cuyos ordenadores fue realizada la simulación. Dicha página…

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Nuevo algoritmo para análisis de microarrays de expresión

Jose Pablo ha mandado este comentario sobre un artículo que ha leído recientemente en Bioinformatics:     En el número del 1 de Noviembre de la revista Bioinformatics se publica un artículo que puede ser muy útil para el análisis de resultados de microarrays de expresión.     En este tipo de experimentos es muy habitual que, de cara a una interpretación biológica de los datos, se empleen técnicas de clustering para identificar grupos de genes o/y muestras subyacentes.     Sin embargo,…

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Dudas sobre el programa «COMPARER»

Carmen Contreras ha mandado el siguiente mensaje: Hola, sabes soy estudiante de biologia (pregrado) y llevo un curso de maestria como alumna libre y tengo una exposición, y tengo que hacer una explicación de como funciona y los principios de el programa COMPARER on line y sabes no encuentro muchas referencias, puedes ayudarme. Personalmente nunca he usado dicha herramienta. Es más, no lo conocía hasta que busqué el sitio web, ¿Alguno de vosotros lo ha usado antes? Si es…

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