Biología Computacional
Biología Computacional
Saludos desde Tokyo. Llegué esta tarde a Japón a las 6:30 AM, hora de España (hay una diferencia de +8 horas), preparado para asistir al BioHackathon2009. Este año este evento se ha vuelto más interactivo si cabe para l@s que esteis en otra parte del planeta, porque siguiendo el ejemplo de ISMB se ha habilitado un canal de FriendFeed, llamado «biohackathon-2009«.
Mi amigo Jesús Armand, que hasta hace pocos meses se encargaba del blog ‘La paradoja de San Petersburgo‘, me ha contado por e-mail que se va a celebrar en el Salón de Grados de la Facultad de Medicina de Zaragoza el próximo jueves 12 de Marzo a las 17:30 un seminario biomédico organizado por la Facultad de Medicina de la Universidad Zaragoza y el Instituto Aragonés de Ciencias de la Salud. Este seminario se titula «Biología Computacional: desafíos actuales en…
Hace unos días me mandó David González el enlace a una noticia aparecida en Microsiervos el 23 de Febrero. En ella se destacaba el video publicado por Phil Plait (en inglés, con transcripción al castellano del video aquí), autor del blog Bad Astronomy, en el que explicaba según su opinión por qué es importante la ciencia. Personalmente os recomiendo que os veais el video, o si se os da mal el inglés, que os leais su transcripción al castellano, porque…
Por un par de noticias aparecidas en la sección de ciencia de Slashdot (primera, del 8 de Febrero y segunda, del 4 de Marzo), he descubierto el sitio DNA rainbow. Este sitio está montado por Katrin Bierkandt y Jens Bierkandt, un par de científicos que querían hacer algo divertido con los datos que tienen que tratar y manejar en el día a día. Y se les ha ocurrido por un lado, generar imágenes a partir de datos genómicos, y hace…
Como ya sabeis, la componente computacional en bioinformática es muy importante. Un porcentaje respetable de bioinformáticos hace sus propios programas, mientras que buena parte del resto usa programas de terceros. Entre los lenguajes de programación más usados en bioinformática se encuentran Python, Java, Perl y Ruby, y es común eso de pasarle a un colega el cutre-script que soluciona un pequeño problema de integración o selección de información (o que te lo pasen). Y de pronto… ¡el programa deja de…
Ayer me llegó un correo relacionado con la siguiente conferencia del ciclo Barcelona BioMed Conferences que organiza IRB Barcelona. Esta conferencia se titula The DNA-Proteome: recent advances towards establishing the protein-DNA interaction space, y se celebrará del 20 al 22 de Abril en la sala Prat de Riba del Institut d’Estudis Catalans. Para aquell@s que esteis interesad@s, la asistencia a esta conferencia es gratuía pero hay un número limitado de plazas, y el plazo de inscripción termina el próximo 20…
Siguiendo la nueva tendencia en las competiciones bianuales en áreas de la Bioinformática, comenzada por CASP6.5 y continuada en CASP7.5, BioCreative, la competición relacionada con el área de text-mining, va a celebrar su propia edición fraccional (BioCreative II.5). Esta edición está principalmente pensada para participantes, debido a que las fechas proporcionadas por el comunicado oficial de la organización apuntan a los distintos plazos que tienen para entrenar sus herramientas, probarlas y evaluarlas. Ya está abierto el plazo de inscripción, y…