Biología Computacional
Biología Computacional
En este mundo cada vez más relacionado a través de redes sociales y webs 2.0, cuando menos te lo esperas, te encuentras en una de esas redes sociales una referencia a un blog. Eso es lo que me ha pasado con Alberto Labarga, que al cambiar su URL por defecto en Facebook ahora proporciona la URL de un nuevo blog llamado «Bioinformatics: Biology by other means». Este nuevo blog está escrito en algunos casos en inglés y en otros en…
Pues sí, con el año nuevo llegan nuevos propósitos, como aprender idiomas, ir al gimnasio, dejar algún mal hábito, contribuir a la divulgación de la bioinformática… Por un lado, hace unos días me escribió Luis usando la interfaz de contacto del blog, para contarme que había montado hace unos meses su propia web de bioinformática. La web está en , que a nivel gráfico es bastante agradable y muestra información externa interesante enmarcada en widgets, adquiriendo su página principal bastante…
Hace unos días me enteré de que este año se va a celebrar un nuevo BioHackathon, seguramente tras el éxito del BioHackathon2008 celebrado el año pasado en Tokyo. Como ya os imaginais, va a denominarse BioHackathon2009, y aunque se va a celebrar en Japón, las sesiones y reuniones cambian al celebrarse unos días en Tokyo y otras en Okinawa.
Hace ya tiempo me pidió mi amigo Ramón de BioAlma que probara uno de los nuevos sistemas de text-mining que han desarrollado. El sistema se llama novo|seek, y aunque haya nacido en una compañía, lo puede usar cualquiera tras registrarse gratuitamente en la página de creación de una nueva cuenta. Una vez que te creas la cuenta y te autenticas en el sistema, la página principal de novo|seek muestra una disposición similar a la de los buscadores de contenidos como…
El pasado mes y medio ha sido bastante duro, entre el trabajo científico y el trabajo «burrocrático». Mientras tanto, se me han ido acumulando algunas noticias y servicios interesantes a analizar, y que poco a poco iré publicando. En cualquier caso, quiero escribir sobre algo bastante común en la ciencia, lo que quiero denominar el efecto «límite»: cuando se van acercando las fechas de las vacaciones (navidad, verano, etc…) de pronto aparece trabajo que tendría que estar hecho «para ayer»,…
Hace una semana David González Pisano me contó que acababa de saltar en ArsTechnica la noticia de que Thomson Reuters, la empresa creadora del programa EndNote, acababa de interponer una demanda judicial contra los creadores de Zotero (George Mason University). La demanda está basada en el supuesto de que los creadores de Zotero habrían aplicado técnicas de ingeniería inversa sobre el formato de fichero de EndNote, y que parte del conocimiento obtenido se habría trasladado al diseño de Zotero para…
Hace tiempo apareció en una de las listas de correo electrónico de BioMOBY una hebra de mensajes denominada «A request: in preparation for MOBY Annotation Jamboree«. Esta hebra básicamente trataba sobre un experimento online que se está realizando estos días, y que consiste en parte en anotar servicios bioinformáticos en MOBY. A día de hoy, los recursos bioinformáticos disponibles por la web son muy heterogéneos y caóticos, tal como ocurre con las bases de datos biológicas y bioinformáticas. Por ello,…